MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 21303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	CAA	2	6	26	31	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010723	AT	3	6	37	42	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010723	TAT	2	6	47	52	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010723	TAA	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010723	TA	4	8	77	84	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010723	A	8	8	89	96	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010723	T	9	9	97	105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010723	AAT	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010723	GGA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010723	ATA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010723	TAA	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010723	CAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010723	CTA	3	9	1674	1682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010723	TAT	2	6	1687	1692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010723	AT	3	6	1691	1696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010723	TA	3	6	1700	1705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010723	TCTAT	2	10	1706	1715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010723	TTAAA	2	10	1716	1725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010723	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010723	AAT	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010723	AGG	2	6	1745	1750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010723	T	6	6	1752	1757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010723	AAAT	2	8	2864	2871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010723	TTA	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010723	A	6	6	2890	2895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010723	TAA	2	6	3120	3125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010723	TAT	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010723	AGG	2	6	4261	4266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010723	AT	3	6	4268	4273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010723	AGG	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010723	TAA	2	6	9065	9070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010723	A	7	7	9074	9080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010723	TTTTA	2	10	9112	9121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010723	A	6	6	9129	9134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010723	T	6	6	9150	9155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010723	TATAGA	2	12	9168	9179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010723	AAT	2	6	9240	9245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010723	AT	4	8	9244	9251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010723	TAT	2	6	9257	9262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010723	TA	4	8	9268	9275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010723	TAT	2	6	9288	9293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010723	AT	4	8	9292	9299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010723	AG	3	6	9320	9325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010723	A	6	6	9344	9349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010723	AAATT	2	10	9361	9370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010723	A	7	7	9378	9384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010723	TTG	2	6	9386	9391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010723	GGC	2	6	9600	9605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010723	CTT	2	6	9637	9642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010723	GCG	2	6	9656	9661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010723	AG	3	6	9696	9701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010723	GGTAA	2	10	9813	9822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010723	CGA	2	6	9836	9841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010723	GCA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010723	GCA	2	6	9950	9955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010723	CGC	2	6	9957	9962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010723	GTGA	2	8	9963	9970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010723	AGG	2	6	10026	10031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010723	CAG	2	6	10053	10058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010723	TGC	2	6	10163	10168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010723	GAA	2	6	10245	10250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010723	GCC	2	6	10389	10394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010723	AGC	2	6	10472	10477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010723	GAA	2	6	10507	10512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010723	GGT	2	6	10581	10586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010723	GTC	2	6	10595	10600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010723	TCGTG	2	10	10604	10613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010723	GGA	2	6	10707	10712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010723	ATC	2	6	10731	10736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010723	AC	3	6	10758	10763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010723	AC	3	6	10926	10931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010723	CCT	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010723	ATG	2	6	11098	11103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010723	TACT	2	8	11124	11131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010723	TTTAA	2	10	11145	11154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010723	TA	3	6	11226	11231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010723	ACA	2	6	11234	11239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010723	ATT	2	6	11248	11253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010723	GGA	2	6	11514	11519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010723	AGAA	2	8	11522	11529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010723	TAG	2	6	11543	11548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010723	GCGA	2	8	11551	11558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010723	CCAAA	2	10	11571	11580	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010723	ACC	2	6	11751	11756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010723	TAC	2	6	11770	11775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010723	TGA	2	6	11777	11782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010723	GGGAG	2	10	11827	11836	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010723	TG	4	8	11885	11892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010723	ATG	2	6	11893	11898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010723	GGA	2	6	12066	12071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010723	TAAGT	2	10	12356	12365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010723	AGC	2	6	12412	12417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010723	ACC	2	6	12491	12496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010723	CA	3	6	12510	12515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010723	CGT	2	6	12537	12542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010723	TAG	2	6	12604	12609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010723	TAT	2	6	12747	12752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010723	TTA	2	6	12755	12760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010723	AGGAT	2	10	12779	12788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010723	GCTA	2	8	12791	12798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010723	AGGT	2	8	12960	12967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010723	GAG	2	6	12968	12973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010723	CGG	2	6	12987	12992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010723	CGG	2	6	13215	13220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010723	ACC	2	6	13486	13491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010723	CCT	2	6	13574	13579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010723	TCGT	2	8	13626	13633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010723	GGT	2	6	13710	13715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010723	TCG	2	6	13825	13830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010723	CGT	2	6	13905	13910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010723	GACC	2	8	13988	13995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010723	GTT	2	6	14008	14013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010723	CGGGA	2	10	14043	14052	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010723	CCT	2	6	14081	14086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010723	CTGA	2	8	14180	14187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010723	AATA	2	8	14212	14219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010723	TA	3	6	14225	14230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010723	TGA	2	6	14278	14283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010723	TG	3	6	14362	14367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010723	CCA	2	6	14464	14469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_010723	CCA	2	6	14544	14549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_010723	TTTA	2	8	14550	14557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010723	T	7	7	14582	14588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010723	T	6	6	14611	14616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010723	TAAA	2	8	15140	15147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010723	ATA	2	6	15149	15154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010723	AT	3	6	17358	17363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010723	TAATA	2	10	17382	17391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010723	TAG	2	6	17430	17435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010723	AG	3	6	17452	17457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010723	TGGT	2	8	17462	17469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010723	ATTA	2	8	17569	17576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010723	T	7	7	17625	17631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010723	A	6	6	17636	17641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010723	GA	3	6	17650	17655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010723	ATA	2	6	17656	17661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010723	AT	3	6	18949	18954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010723	ATA	2	6	18957	18962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010723	TAT	3	9	18994	19002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010723	T	6	6	19002	19007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010723	ATT	3	9	19037	19045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010723	T	7	7	19130	19136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010723	ATA	2	6	19172	19177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010723	GA	3	6	19193	19198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010723	GCGT	2	8	19236	19243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010723	TC	3	6	19272	19277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010723	T	9	9	19284	19292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010723	ATTA	2	8	19300	19307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010723	T	6	6	19434	19439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010723	TA	3	6	19454	19459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010723	AGA	2	6	19485	19490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010723	AT	3	6	19509	19514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010723	TAT	2	6	19517	19522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010723	TAA	2	6	19523	19528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010723	TTA	2	6	19572	19577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010723	TTAA	2	8	19600	19607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010723	ATA	2	6	19610	19615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010723	TAT	4	12	19624	19635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010723	TAA	2	6	19662	19667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010723	GA	3	6	19683	19688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010723	GCGT	2	8	19726	19733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_010723	TC	3	6	19762	19767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_010723	T	6	6	19777	19782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010723	ATTA	2	8	19790	19797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010723	T	7	7	19924	19930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010723	ATTT	2	8	19953	19960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_010723	ATG	2	6	20188	20193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010723	TTA	2	6	20202	20207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_010723	AAG	2	6	20240	20245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_010723	ATT	2	6	20773	20778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_010723	TGA	2	6	28057	28062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_010723	TATT	2	8	28280	28287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_010723	ATA	3	9	29514	29522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_010723	TA	3	6	31744	31749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_010723	TA	3	6	71527	71532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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