MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 2416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010529	T	6	6	248997	249002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010529	GAA	2	6	249019	249024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_010529	TGC	2	6	249072	249077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_010529	TCG	2	6	249091	249096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010529	GGC	2	6	249125	249130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_010529	TCCT	2	8	249133	249140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_010529	CCG	2	6	249198	249203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_010529	GGC	2	6	249270	249275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_010529	CAC	2	6	249345	249350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_010529	GCCA	2	8	249378	249385	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_010529	GGCG	2	8	249390	249397	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_010529	CCG	2	6	249507	249512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_010529	ATGC	2	8	249560	249567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_010529	TGCC	2	8	249578	249585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_010529	GCC	2	6	249640	249645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_010529	CGCGG	2	10	249665	249674	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_010529	GGC	2	6	249705	249710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_010529	GCG	2	6	249927	249932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010529	CAC	2	6	249942	249947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_010529	GAA	2	6	250017	250022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010529	GCCC	2	8	250040	250047	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1022	NC_010529	CTGG	2	8	250079	250086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_010529	TGCGC	2	10	250100	250109	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_010529	GCA	2	6	250115	250120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_010529	CGGC	2	8	250198	250205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_010529	CGG	2	6	250274	250279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010529	GTG	2	6	250302	250307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010529	CGG	2	6	250425	250430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_010529	CTGC	2	8	250504	250511	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_010529	TGA	2	6	250589	250594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010529	GGC	2	6	250626	250631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_010529	GCC	2	6	250635	250640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_010529	CGG	2	6	250657	250662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_010529	AAG	3	9	250702	250710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010529	AGT	2	6	253090	253095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010529	CGC	2	6	253130	253135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_010529	GCC	2	6	253180	253185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_010529	CGCCC	2	10	253188	253197	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1039	NC_010529	CGG	2	6	253224	253229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_010529	CG	3	6	253284	253289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_010529	ACG	2	6	253295	253300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010529	C	6	6	253370	253375	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1043	NC_010529	GTC	2	6	253384	253389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010529	CGC	2	6	253404	253409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_010529	GCG	2	6	253412	253417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_010529	ACA	2	6	253418	253423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010529	CCG	2	6	253441	253446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_010529	TGT	2	6	254130	254135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010529	GCC	2	6	254241	254246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_010529	TGT	2	6	254258	254263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010529	TTG	2	6	254267	254272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010529	GC	3	6	254298	254303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_010529	GCG	2	6	254707	254712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010529	GGC	2	6	254808	254813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010529	GCG	2	6	254891	254896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010529	GCG	2	6	254925	254930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010529	TCAT	2	8	255003	255010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_010529	CG	4	8	255014	255021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_010529	CG	3	6	255023	255028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_010529	ATT	2	6	255046	255051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_010529	TGC	2	6	255069	255074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010529	C	6	6	256964	256969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1063	NC_010529	CGC	2	6	256983	256988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_010529	TG	3	6	256993	256998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010529	GCT	2	6	257030	257035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010529	CGG	2	6	257065	257070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010529	GCG	2	6	257092	257097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_010529	CAC	2	6	257157	257162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_010529	CG	3	6	257231	257236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_010529	GCC	2	6	257277	257282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_010529	CGC	2	6	257292	257297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_010529	TCCGAG	2	12	257300	257311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010529	CAT	2	6	257323	257328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010529	CGG	3	9	257433	257441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_010529	T	7	7	257451	257457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010529	CGC	2	6	257460	257465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_010529	CG	3	6	257502	257507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_010529	GCC	2	6	257518	257523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_010529	GTC	2	6	257571	257576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_010529	GCC	2	6	257691	257696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_010529	TGGA	2	8	257726	257733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010529	GCCCA	2	10	257743	257752	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1083	NC_010529	GCGCC	2	10	257766	257775	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1084	NC_010529	GCC	2	6	257797	257802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_010529	CGA	2	6	257807	257812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_010529	TTG	2	6	257815	257820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010529	GAT	2	6	257868	257873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010529	GCG	2	6	257911	257916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010529	GTG	2	6	258023	258028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010529	GCC	2	6	258099	258104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_010529	ACT	2	6	258133	258138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_010529	CAT	2	6	258145	258150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_010529	CG	4	8	258157	258164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_010529	CGG	2	6	258212	258217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_010529	GTG	2	6	258307	258312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010529	CCG	2	6	258402	258407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_010529	GGGGC	2	10	258435	258444	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_010529	CGC	3	9	258474	258482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_010529	CGGCCG	2	12	258581	258592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_010529	TGAC	2	8	258596	258603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_010529	TCG	2	6	258613	258618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_010529	CGCT	2	8	258627	258634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_010529	CGC	2	6	258739	258744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_010529	CTC	2	6	258805	258810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_010529	CTGCA	2	10	258829	258838	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1106	NC_010529	CCT	2	6	258868	258873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_010529	GCC	2	6	258949	258954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_010529	AGC	2	6	259003	259008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_010529	A	8	8	259028	259035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010529	TTC	2	6	259038	259043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_010529	TTC	2	6	259092	259097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010529	A	9	9	260339	260347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010529	CTT	2	6	260365	260370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_010529	TGT	2	6	262636	262641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010529	A	6	6	262661	262666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010529	GCC	2	6	262895	262900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_010529	ACC	2	6	262913	262918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_010529	GCA	2	6	263120	263125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_010529	A	6	6	263127	263132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010529	TG	3	6	263150	263155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010529	GAA	2	6	263203	263208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010529	TGTT	2	8	263340	263347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010529	T	6	6	263351	263356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010529	AC	3	6	263366	263371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_010529	ACAA	2	8	263374	263381	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_010529	A	6	6	263386	263391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010529	AGGTG	2	10	263428	263437	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010529	AGGTG	2	10	263449	263458	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010529	TGT	2	6	263459	263464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010529	GTT	2	6	263506	263511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010529	GCTAG	2	10	263589	263598	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_010529	AGG	2	6	266529	266534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010529	GCC	2	6	266687	266692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_010529	CGA	2	6	266737	266742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_010529	CAG	2	6	268020	268025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_010529	GC	3	6	268117	268122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_010529	AGG	2	6	268124	268129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_010529	AGG	2	6	269086	269091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1153	NC_010529	CG	3	6	271743	271748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1165	NC_010529	ATA	2	6	272440	272445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1399	NC_010529	TCATT	2	10	323592	323601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1401	NC_010529	AGCGGC	2	12	328798	328809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_010529	ACT	2	6	329080	329085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_010529	GGA	2	6	330722	330727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_010529	GTA	2	6	330728	330733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_010529	CTT	2	6	330970	330975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_010529	TTCAT	2	10	330998	331007	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1410	NC_010529	TCG	2	6	331079	331084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_010529	TGT	2	6	331585	331590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_010529	CGG	2	6	331608	331613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_010529	TGT	2	6	331640	331645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_010529	TGT	2	6	331649	331654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1428	NC_010529	TCGC	2	8	337233	337240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1429	NC_010529	TTC	2	6	337252	337257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_010529	ACGT	2	8	337330	337337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1434	NC_010529	T	6	6	337470	337475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_010529	CGA	2	6	337490	337495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1437	NC_010529	GCG	2	6	337568	337573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1438	NC_010529	GAG	2	6	337723	337728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_010529	AGCG	2	8	337861	337868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1440	NC_010529	GCT	2	6	338273	338278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_010529	GGC	2	6	338280	338285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_010529	CAG	2	6	341139	341144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_010529	CG	3	6	341149	341154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1444	NC_010529	GTTC	2	8	341199	341206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1445	NC_010529	AAAG	2	8	341289	341296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_010529	CGC	2	6	341381	341386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1488	NC_010529	TGA	2	6	349145	349150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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