MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 2416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010529	GCG	2	6	104921	104926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010529	GAC	2	6	105229	105234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010529	CTG	2	6	106012	106017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_010529	ATG	2	6	106068	106073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010529	AAC	2	6	106098	106103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010529	GCC	2	6	106145	106150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_010529	GGC	2	6	106216	106221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_010529	TCGC	2	8	106300	106307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_010529	CGC	2	6	106336	106341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_010529	GCG	2	6	106367	106372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_010529	CAT	2	6	106448	106453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_010529	ATTCG	2	10	106485	106494	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
513	NC_010529	TGTC	2	8	106830	106837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_010529	GCA	2	6	106859	106864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010529	ACG	2	6	106983	106988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010529	TGCG	2	8	106989	106996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
517	NC_010529	CGA	2	6	107011	107016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010529	GCT	2	6	107080	107085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010529	GC	3	6	107131	107136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_010529	CGG	2	6	107178	107183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_010529	TCGC	2	8	107308	107315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
522	NC_010529	GCC	2	6	107356	107361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_010529	GCC	2	6	107493	107498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_010529	CGCA	2	8	107563	107570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_010529	GAC	2	6	107653	107658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_010529	CTC	2	6	107705	107710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_010529	CGA	2	6	107770	107775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_010529	CCA	2	6	107828	107833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_010529	CGT	2	6	107844	107849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_010529	GAT	2	6	107857	107862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010529	GGATT	2	10	107945	107954	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010529	CGG	2	6	108178	108183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010529	CGT	2	6	108238	108243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010529	GATCGA	2	12	108271	108282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
535	NC_010529	ACT	2	6	108373	108378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_010529	TCG	2	6	108394	108399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_010529	GCTG	2	8	108408	108415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
538	NC_010529	GAC	2	6	108440	108445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_010529	AACG	2	8	108473	108480	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_010529	GCG	2	6	108578	108583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010529	GACG	2	8	108679	108686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_010529	CGA	2	6	108790	108795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010529	CA	3	6	108828	108833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_010529	TCG	2	6	108879	108884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010529	AGCGC	2	10	108919	108928	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
546	NC_010529	GCG	2	6	109879	109884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010529	GAC	2	6	109892	109897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010529	CAC	2	6	109921	109926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_010529	CTT	2	6	109927	109932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010529	CTT	2	6	109942	109947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010529	TCG	2	6	109961	109966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_010529	GAT	2	6	109970	109975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010529	CGC	2	6	110067	110072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_010529	C	7	7	110081	110087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
555	NC_010529	CAC	2	6	110140	110145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_010529	CT	3	6	110152	110157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_010529	ACC	2	6	110204	110209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_010529	GCAC	2	8	112129	112136	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_010529	ACA	2	6	112147	112152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010529	CCT	2	6	112443	112448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_010529	TG	3	6	112683	112688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010529	CTTT	2	8	112761	112768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_010529	TGC	3	9	112771	112779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_010529	AG	3	6	112828	112833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010529	GCG	2	6	114168	114173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010529	GCC	2	6	114178	114183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_010529	TGC	2	6	114489	114494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_010529	ACT	2	6	114541	114546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_010529	GC	3	6	115054	115059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_010529	AT	3	6	115064	115069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010529	TG	3	6	115632	115637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010529	GCA	2	6	115646	115651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_010529	CGA	2	6	117399	117404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010529	GCG	2	6	117408	117413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_010529	AGAC	2	8	117489	117496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
576	NC_010529	GC	3	6	117558	117563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_010529	CGA	2	6	118075	118080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010529	AGC	2	6	118082	118087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_010529	GGC	2	6	119558	119563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_010529	CCA	2	6	119574	119579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010529	TGG	2	6	119585	119590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010529	AGA	2	6	119596	119601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010529	CTG	2	6	120334	120339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_010529	CCG	2	6	121679	121684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_010529	TA	3	6	122756	122761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010529	CAAG	2	8	122780	122787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_010529	TCG	2	6	122795	122800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010529	GTT	2	6	122929	122934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010529	GCG	2	6	123049	123054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_010529	CTC	2	6	123070	123075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_010529	TTC	2	6	124517	124522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_010529	GCA	2	6	127521	127526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_010529	AAAG	2	8	127559	127566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010529	GAC	2	6	127603	127608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010529	ACCG	2	8	127631	127638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
596	NC_010529	CG	3	6	127637	127642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_010529	TCG	2	6	127713	127718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010529	GGCGCC	2	12	127769	127780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_010529	CCG	2	6	127791	127796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_010529	CACC	2	8	127833	127840	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
601	NC_010529	GTC	2	6	127841	127846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010529	TGC	2	6	127900	127905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010529	ACC	2	6	127925	127930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_010529	TCC	2	6	128329	128334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_010529	CAC	2	6	128343	128348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_010529	GGC	3	9	128413	128421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010529	TGG	2	6	128440	128445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010529	GCAAC	2	10	128470	128479	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
609	NC_010529	ACTG	2	8	129588	129595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_010529	GAC	2	6	129621	129626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010529	GAA	2	6	129635	129640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010529	CAA	2	6	129642	129647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010529	GGC	2	6	129740	129745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010529	CCGG	2	8	129749	129756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_010529	TA	3	6	129776	129781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010529	TCC	2	6	129783	129788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_010529	CAA	2	6	129843	129848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010529	CCG	2	6	129877	129882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010529	TTC	2	6	131217	131222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010529	GC	3	6	131256	131261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_010529	ACA	2	6	131781	131786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010529	AAG	3	9	131805	131813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010529	GCT	2	6	132165	132170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010529	GAC	2	6	132173	132178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_010529	TGT	3	9	132200	132208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010529	GC	3	6	132258	132263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_010529	AG	3	6	132265	132270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010529	TTA	2	6	132275	132280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010529	TCGCCC	2	12	132305	132316	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_010529	AGCGCT	2	12	132366	132377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_010529	GAA	2	6	132415	132420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010529	ACC	2	6	132433	132438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_010529	GC	4	8	132476	132483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_010529	GCC	2	6	132494	132499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_010529	GTT	2	6	133102	133107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010529	GGC	2	6	133151	133156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_010529	GAAA	2	8	133457	133464	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010529	GTA	2	6	133508	133513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_010529	CTG	2	6	140180	140185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_010529	CCG	2	6	145007	145012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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683	NC_010529	GC	3	6	145770	145775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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912	NC_010529	AAG	3	9	229117	229125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
913	NC_010529	CGA	2	6	229167	229172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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918	NC_010529	CGC	2	6	231298	231303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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921	NC_010529	CGC	2	6	231437	231442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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931	NC_010529	ACA	2	6	234647	234652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
932	NC_010529	CGG	2	6	235030	235035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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951	NC_010529	ATG	2	6	238703	238708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
952	NC_010529	TGC	2	6	239580	239585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
953	NC_010529	CGG	2	6	240647	240652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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973	NC_010529	TAT	2	6	246467	246472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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982	NC_010529	CG	3	6	246938	246943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
983	NC_010529	GCG	2	6	247082	247087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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987	NC_010529	TCG	2	6	247229	247234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
988	NC_010529	GCC	2	6	247318	247323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
989	NC_010529	GC	3	6	247327	247332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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999	NC_010529	TAC	2	6	248869	248874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1000	NC_010529	GCT	2	6	248976	248981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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