MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 24199

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_010520	AT	4	8	3940654	3940661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24002	NC_010520	T	6	6	3940681	3940686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24003	NC_010520	AT	3	6	3941885	3941890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24004	NC_010520	A	7	7	3941891	3941897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24005	NC_010520	AT	3	6	3943833	3943838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24006	NC_010520	TCAA	2	8	3943846	3943853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24007	NC_010520	TA	3	6	3943889	3943894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24008	NC_010520	ATTT	2	8	3943896	3943903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24009	NC_010520	TTC	2	6	3943907	3943912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24010	NC_010520	TTATAC	2	12	3943916	3943927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24011	NC_010520	ATA	2	6	3944856	3944861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24012	NC_010520	TCT	2	6	3947116	3947121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24013	NC_010520	ATT	2	6	3949315	3949320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24014	NC_010520	ATT	2	6	3950081	3950086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24015	NC_010520	TCC	2	6	3951047	3951052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24016	NC_010520	TCC	2	6	3951999	3952004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24017	NC_010520	TAT	2	6	3952026	3952031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24018	NC_010520	TAAT	2	8	3952049	3952056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24019	NC_010520	AATTT	2	10	3952067	3952076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24020	NC_010520	T	7	7	3952099	3952105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24021	NC_010520	TCC	2	6	3952347	3952352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24022	NC_010520	ATTTAT	2	12	3952357	3952368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24023	NC_010520	T	6	6	3952373	3952378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24024	NC_010520	T	6	6	3954919	3954924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24025	NC_010520	TA	3	6	3954952	3954957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24026	NC_010520	A	7	7	3954960	3954966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24027	NC_010520	T	7	7	3954990	3954996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24028	NC_010520	TA	3	6	3955958	3955963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24029	NC_010520	AT	3	6	3955966	3955971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24030	NC_010520	TTA	2	6	3955997	3956002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24031	NC_010520	ATT	2	6	3956012	3956017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24032	NC_010520	TA	3	6	3956018	3956023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24033	NC_010520	ATT	2	6	3956024	3956029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24034	NC_010520	GTA	2	6	3956032	3956037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24035	NC_010520	TAT	2	6	3956042	3956047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24036	NC_010520	TAA	2	6	3956050	3956055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24037	NC_010520	AGGT	2	8	3956100	3956107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24038	NC_010520	TAA	2	6	3958110	3958115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24039	NC_010520	ATA	2	6	3958116	3958121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24040	NC_010520	TA	3	6	3958127	3958132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24041	NC_010520	CTG	2	6	3958195	3958200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24042	NC_010520	GCT	2	6	3958212	3958217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24043	NC_010520	AT	3	6	3958321	3958326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24044	NC_010520	TGG	2	6	3958330	3958335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24045	NC_010520	A	7	7	3958409	3958415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24046	NC_010520	ACC	2	6	3958454	3958459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24047	NC_010520	GTG	2	6	3958468	3958473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24048	NC_010520	TTTA	2	8	3958538	3958545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24049	NC_010520	TGG	2	6	3958639	3958644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24050	NC_010520	TAAT	2	8	3958722	3958729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24051	NC_010520	ACC	2	6	3958764	3958769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24052	NC_010520	GTG	2	6	3958778	3958783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24053	NC_010520	CTG	2	6	3958844	3958849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24054	NC_010520	GCT	2	6	3958861	3958866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24055	NC_010520	AT	3	6	3958970	3958975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24056	NC_010520	TGG	2	6	3958979	3958984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24057	NC_010520	TAA	2	6	3959065	3959070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24058	NC_010520	ACC	2	6	3959103	3959108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24059	NC_010520	GTG	2	6	3959117	3959122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24060	NC_010520	TTC	2	6	3959160	3959165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24061	NC_010520	T	6	6	3959222	3959227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24062	NC_010520	T	8	8	3959231	3959238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24063	NC_010520	TATCTA	2	12	3959289	3959300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24064	NC_010520	T	8	8	3959301	3959308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24065	NC_010520	CT	3	6	3960130	3960135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24066	NC_010520	TTTA	2	8	3960527	3960534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24067	NC_010520	TAA	2	6	3960535	3960540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24068	NC_010520	TAT	2	6	3960554	3960559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24069	NC_010520	TA	4	8	3960605	3960612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24070	NC_010520	TATT	2	8	3960640	3960647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24071	NC_010520	GA	3	6	3960682	3960687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24072	NC_010520	TAAT	2	8	3961949	3961956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24073	NC_010520	T	7	7	3961956	3961962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24074	NC_010520	AGCA	2	8	3961967	3961974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24075	NC_010520	AT	3	6	3961993	3961998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24076	NC_010520	ATTT	2	8	3962000	3962007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24077	NC_010520	TAT	2	6	3962784	3962789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24078	NC_010520	TAAA	2	8	3962819	3962826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24079	NC_010520	TAA	2	6	3962835	3962840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24080	NC_010520	A	7	7	3962839	3962845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24081	NC_010520	T	7	7	3962866	3962872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24082	NC_010520	CT	3	6	3963072	3963077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24083	NC_010520	ATT	3	9	3963091	3963099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24084	NC_010520	ATATT	2	10	3963127	3963136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24085	NC_010520	T	6	6	3963139	3963144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24086	NC_010520	AT	4	8	3963145	3963152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24087	NC_010520	TTA	2	6	3963161	3963166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24088	NC_010520	ATATA	2	10	3963174	3963183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24089	NC_010520	ATT	2	6	3964473	3964478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24090	NC_010520	ATT	2	6	3964502	3964507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24091	NC_010520	AT	3	6	3964566	3964571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24092	NC_010520	A	7	7	3964603	3964609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24093	NC_010520	TCGT	2	8	3964638	3964645	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24094	NC_010520	TTA	2	6	3964646	3964651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24095	NC_010520	A	6	6	3964655	3964660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24096	NC_010520	ATT	3	9	3964692	3964700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24097	NC_010520	TA	3	6	3966107	3966112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24098	NC_010520	T	6	6	3966165	3966170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24099	NC_010520	ATT	3	9	3966174	3966182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24100	NC_010520	TTTTC	2	10	3966187	3966196	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24101	NC_010520	AT	3	6	3966214	3966219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24102	NC_010520	A	6	6	3966223	3966228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24103	NC_010520	T	7	7	3966238	3966244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24104	NC_010520	ATCC	2	8	3966480	3966487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24105	NC_010520	ATTAT	2	10	3966518	3966527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24106	NC_010520	AT	3	6	3966526	3966531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24107	NC_010520	GTA	2	6	3966567	3966572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24108	NC_010520	TCTTT	2	10	3966599	3966608	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24109	NC_010520	ATA	2	6	3966632	3966637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24110	NC_010520	TAT	2	6	3966652	3966657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24111	NC_010520	ATTAA	2	10	3966668	3966677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24112	NC_010520	TC	3	6	3968407	3968412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24113	NC_010520	T	6	6	3968457	3968462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24114	NC_010520	CTT	2	6	3968472	3968477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24115	NC_010520	ATA	2	6	3968480	3968485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24116	NC_010520	TA	3	6	3968492	3968497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24117	NC_010520	AT	3	6	3968510	3968515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24118	NC_010520	TAA	2	6	3968516	3968521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24119	NC_010520	AAT	2	6	3968522	3968527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24120	NC_010520	TAT	2	6	3968544	3968549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24121	NC_010520	AATATA	2	12	3968555	3968566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24122	NC_010520	AAAT	2	8	3968573	3968580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24123	NC_010520	A	6	6	3968598	3968603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24124	NC_010520	AAAT	2	8	3968617	3968624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24125	NC_010520	TC	3	6	3969987	3969992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24126	NC_010520	CTC	2	6	3970001	3970006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24127	NC_010520	TCC	2	6	3975378	3975383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24128	NC_010520	ACA	2	6	3975703	3975708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24129	NC_010520	T	6	6	3975718	3975723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24130	NC_010520	TAC	2	6	3975730	3975735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24131	NC_010520	AAT	2	6	3975764	3975769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24132	NC_010520	A	8	8	3975802	3975809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24133	NC_010520	TAG	2	6	3975822	3975827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24134	NC_010520	CCT	2	6	3976101	3976106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24135	NC_010520	ACC	2	6	3976565	3976570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24136	NC_010520	CCT	2	6	3976867	3976872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24137	NC_010520	CAG	2	6	3976901	3976906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24138	NC_010520	AAT	2	6	3976924	3976929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24139	NC_010520	TAT	2	6	3976944	3976949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24140	NC_010520	TTA	2	6	3978123	3978128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24141	NC_010520	CTA	2	6	3978194	3978199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24142	NC_010520	CAT	2	6	3978223	3978228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24143	NC_010520	AT	4	8	3978241	3978248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24144	NC_010520	AT	3	6	3978288	3978293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24145	NC_010520	TTTA	2	8	3978318	3978325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24146	NC_010520	A	7	7	3978330	3978336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24147	NC_010520	TAA	2	6	3978362	3978367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24148	NC_010520	A	7	7	3978366	3978372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24149	NC_010520	TC	3	6	3978589	3978594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24150	NC_010520	TAT	3	9	3979740	3979748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24151	NC_010520	TA	3	6	3979794	3979799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24152	NC_010520	TA	4	8	3979815	3979822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24153	NC_010520	ATT	2	6	3979853	3979858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24154	NC_010520	ATTT	2	8	3979873	3979880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24155	NC_010520	AT	3	6	3979883	3979888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24156	NC_010520	AGG	2	6	3982178	3982183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24157	NC_010520	T	7	7	3982184	3982190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24158	NC_010520	ATT	2	6	3983044	3983049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24159	NC_010520	TCC	2	6	3983590	3983595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24160	NC_010520	TCC	2	6	3984475	3984480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24161	NC_010520	CAC	2	6	3985253	3985258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24162	NC_010520	TAAT	2	8	3985260	3985267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24163	NC_010520	TA	3	6	3985283	3985288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24164	NC_010520	AAT	2	6	3985300	3985305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24165	NC_010520	TTA	2	6	3985326	3985331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24166	NC_010520	TAA	2	6	3985337	3985342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24167	NC_010520	A	6	6	3985341	3985346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24168	NC_010520	TCT	2	6	3986189	3986194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24169	NC_010520	TCC	2	6	3986208	3986213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24170	NC_010520	T	7	7	3986214	3986220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24171	NC_010520	ATT	2	6	3986221	3986226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24172	NC_010520	T	7	7	3986225	3986231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24173	NC_010520	ATT	2	6	3986240	3986245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24174	NC_010520	AAC	2	6	3986972	3986977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24175	NC_010520	ATA	2	6	3990292	3990297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24176	NC_010520	AAAG	2	8	3990301	3990308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24177	NC_010520	CCT	2	6	3991619	3991624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24178	NC_010520	T	6	6	3992191	3992196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24179	NC_010520	CCT	2	6	3992376	3992381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24180	NC_010520	AAT	2	6	3992396	3992401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24181	NC_010520	T	6	6	3992410	3992415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24182	NC_010520	TA	3	6	3992480	3992485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24183	NC_010520	T	7	7	3992537	3992543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24184	NC_010520	CTT	2	6	3992552	3992557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24185	NC_010520	TA	3	6	3992565	3992570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24186	NC_010520	ATT	3	9	3992580	3992588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24187	NC_010520	GTT	2	6	3992631	3992636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24188	NC_010520	T	7	7	3992672	3992678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24189	NC_010520	TTAT	2	8	3992721	3992728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24190	NC_010520	T	9	9	3992738	3992746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24191	NC_010520	T	6	6	3992748	3992753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24192	NC_010520	TAAT	2	8	3992761	3992768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24193	NC_010520	T	7	7	3992768	3992774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24194	NC_010520	TA	3	6	3992780	3992785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24195	NC_010520	T	7	7	3992810	3992816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24196	NC_010520	CAA	2	6	3992817	3992822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24197	NC_010520	ATAA	2	8	3992836	3992843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24198	NC_010520	TA	3	6	3992846	3992851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24199	NC_010520	GTT	2	6	3992854	3992859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.