MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 24199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_010520	CT	3	6	2200301	2200306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14502	NC_010520	T	6	6	2200318	2200323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_010520	AATC	2	8	2200328	2200335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14504	NC_010520	AT	3	6	2200354	2200359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_010520	ATTT	2	8	2201256	2201263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_010520	CTAT	2	8	2201295	2201302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14507	NC_010520	AAT	2	6	2201372	2201377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_010520	GTAC	2	8	2201419	2201426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14509	NC_010520	TAA	2	6	2201430	2201435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_010520	TAC	2	6	2201436	2201441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14511	NC_010520	AAT	2	6	2201453	2201458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_010520	ATA	2	6	2201462	2201467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_010520	AAG	2	6	2201489	2201494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_010520	ATA	2	6	2201496	2201501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_010520	TAA	2	6	2201569	2201574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_010520	AG	3	6	2201618	2201623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_010520	CAA	2	6	2202271	2202276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_010520	TTG	2	6	2202280	2202285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_010520	TCA	2	6	2202309	2202314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_010520	TA	4	8	2202323	2202330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_010520	TTAT	2	8	2202351	2202358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_010520	ATT	2	6	2202362	2202367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_010520	TAT	2	6	2202415	2202420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_010520	C	6	6	2202436	2202441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14525	NC_010520	TA	3	6	2202457	2202462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_010520	TTA	2	6	2202465	2202470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_010520	TTA	3	9	2202495	2202503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_010520	T	6	6	2202520	2202525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_010520	GGT	2	6	2202543	2202548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_010520	GCTA	2	8	2202726	2202733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14531	NC_010520	A	6	6	2202763	2202768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_010520	CCTT	2	8	2202836	2202843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14533	NC_010520	CAT	2	6	2202879	2202884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_010520	ATC	2	6	2203165	2203170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14535	NC_010520	T	6	6	2203191	2203196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_010520	TCT	2	6	2203399	2203404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_010520	T	6	6	2203487	2203492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_010520	TA	3	6	2203509	2203514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_010520	TA	3	6	2203518	2203523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_010520	AAT	2	6	2203535	2203540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_010520	AAT	2	6	2203544	2203549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_010520	AAC	2	6	2203569	2203574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_010520	A	6	6	2203606	2203611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_010520	A	6	6	2204614	2204619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_010520	TAAT	2	8	2206692	2206699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_010520	AAT	2	6	2206722	2206727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_010520	ATAA	2	8	2206745	2206752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_010520	A	6	6	2206751	2206756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_010520	TTTA	2	8	2206757	2206764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_010520	TAT	2	6	2206803	2206808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_010520	CTTT	2	8	2206821	2206828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14552	NC_010520	ATTT	2	8	2206919	2206926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_010520	TCC	2	6	2209589	2209594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14554	NC_010520	AGT	2	6	2209608	2209613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_010520	ATA	2	6	2209628	2209633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_010520	TAA	3	9	2209665	2209673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_010520	AAT	2	6	2209685	2209690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_010520	A	6	6	2209768	2209773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_010520	TAT	2	6	2210401	2210406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_010520	TCCT	2	8	2210413	2210420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14561	NC_010520	TC	3	6	2210456	2210461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14562	NC_010520	TC	3	6	2210503	2210508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14563	NC_010520	ATA	2	6	2210514	2210519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_010520	TAA	2	6	2210529	2210534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_010520	CT	3	6	2210539	2210544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14566	NC_010520	TCT	2	6	2210602	2210607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_010520	CAT	2	6	2210625	2210630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_010520	T	6	6	2210633	2210638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_010520	TAT	2	6	2210807	2210812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_010520	TTA	2	6	2210813	2210818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_010520	A	6	6	2210826	2210831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_010520	TA	3	6	2210870	2210875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_010520	AAT	2	6	2210906	2210911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_010520	ATA	2	6	2210916	2210921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_010520	T	7	7	2210937	2210943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_010520	A	6	6	2210944	2210949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_010520	A	6	6	2210957	2210962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_010520	AGG	2	6	2211966	2211971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_010520	AT	3	6	2214236	2214241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_010520	T	7	7	2214278	2214284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_010520	ATAA	2	8	2214290	2214297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_010520	A	7	7	2214300	2214306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_010520	T	6	6	2214348	2214353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_010520	ATT	2	6	2214366	2214371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_010520	TAA	2	6	2214385	2214390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_010520	TATCAT	2	12	2216522	2216533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14587	NC_010520	T	6	6	2216543	2216548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_010520	T	6	6	2216611	2216616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_010520	AAATAA	2	12	2216617	2216628	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_010520	TAA	2	6	2216648	2216653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_010520	TAA	2	6	2216680	2216685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_010520	TTA	2	6	2216686	2216691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_010520	TA	3	6	2216690	2216695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_010520	TATAA	2	10	2216700	2216709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_010520	ATAA	2	8	2216732	2216739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_010520	GAA	2	6	2216741	2216746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_010520	ATTTT	2	10	2216762	2216771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_010520	AAC	2	6	2216774	2216779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14599	NC_010520	TTAT	2	8	2216787	2216794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_010520	CTT	2	6	2218416	2218421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14601	NC_010520	TCC	2	6	2220434	2220439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14602	NC_010520	ATT	2	6	2220441	2220446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_010520	TAA	2	6	2220496	2220501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_010520	TAA	2	6	2220540	2220545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_010520	TAAA	2	8	2220556	2220563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_010520	ATTT	2	8	2221667	2221674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_010520	TAA	2	6	2221675	2221680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_010520	TAC	2	6	2221684	2221689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14609	NC_010520	TA	3	6	2221697	2221702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_010520	ATT	2	6	2221703	2221708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_010520	AAATT	2	10	2221713	2221722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_010520	TGT	2	6	2221759	2221764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_010520	AAT	2	6	2221786	2221791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_010520	T	6	6	2221808	2221813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_010520	GGA	2	6	2225544	2225549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_010520	ATT	2	6	2226683	2226688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_010520	CCCT	2	8	2227129	2227136	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14618	NC_010520	GTA	2	6	2227141	2227146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_010520	TAT	2	6	2227169	2227174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_010520	ATACT	2	10	2227180	2227189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14621	NC_010520	ATG	2	6	2227191	2227196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_010520	TAA	2	6	2227199	2227204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_010520	AAT	2	6	2227212	2227217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_010520	T	7	7	2227221	2227227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_010520	ATA	2	6	2227239	2227244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_010520	TA	3	6	2227243	2227248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_010520	AAT	2	6	2227311	2227316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14628	NC_010520	TA	3	6	2227323	2227328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_010520	AT	3	6	2227365	2227370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14630	NC_010520	T	6	6	2227387	2227392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14632	NC_010520	TA	3	6	2228835	2228840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14636	NC_010520	GGA	2	6	2228905	2228910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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