MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 24199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010520	TTATT	2	10	849189	849198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_010520	AAT	2	6	849199	849204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_010520	ATTA	2	8	849345	849352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_010520	TAA	2	6	849357	849362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_010520	TTG	2	6	849403	849408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_010520	ATTATA	2	12	849427	849438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_010520	CAAG	2	8	849445	849452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_010520	ACA	2	6	850023	850028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_010520	TA	3	6	850051	850056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_010520	TTA	2	6	850071	850076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_010520	TTG	2	6	850086	850091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_010520	AGG	2	6	850174	850179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_010520	TTA	2	6	850822	850827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_010520	ATT	2	6	850835	850840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_010520	TGC	2	6	851015	851020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_010520	CAT	2	6	851153	851158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_010520	TAG	2	6	851227	851232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_010520	GT	3	6	851233	851238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_010520	A	6	6	852121	852126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_010520	TAT	2	6	852140	852145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_010520	TA	4	8	852806	852813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_010520	ATC	2	6	852828	852833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_010520	TAT	2	6	852866	852871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_010520	TGA	2	6	852873	852878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_010520	TA	3	6	852885	852890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_010520	TA	3	6	852895	852900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_010520	CTTT	2	8	852906	852913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_010520	AGG	2	6	852915	852920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_010520	CTA	2	6	853682	853687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_010520	T	6	6	853692	853697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_010520	ATTA	2	8	853705	853712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_010520	TTGAAA	2	12	853717	853728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_010520	TAT	2	6	853729	853734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_010520	T	6	6	853765	853770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_010520	ACCAT	2	10	853787	853796	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5536	NC_010520	AT	5	10	853845	853854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_010520	CTT	2	6	853885	853890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_010520	ATA	2	6	854824	854829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_010520	AAT	2	6	854920	854925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_010520	TAT	2	6	854945	854950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_010520	AT	4	8	854957	854964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_010520	TAT	3	9	854962	854970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_010520	AGA	2	6	855076	855081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_010520	ATC	2	6	855100	855105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_010520	TAC	2	6	855142	855147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_010520	AATT	2	8	855148	855155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_010520	AAGA	2	8	855180	855187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_010520	TGA	2	6	855212	855217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_010520	TAAAA	2	10	855322	855331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_010520	TAG	2	6	855339	855344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_010520	GA	3	6	855371	855376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010520	GAA	2	6	855402	855407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_010520	TA	3	6	855408	855413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_010520	ATT	2	6	855522	855527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_010520	T	7	7	855534	855540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_010520	AGA	2	6	855564	855569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_010520	TTA	2	6	855571	855576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_010520	AAT	2	6	855650	855655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_010520	CTG	2	6	855707	855712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_010520	AT	4	8	855767	855774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_010520	TAA	2	6	855776	855781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_010520	A	6	6	855798	855803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_010520	ATT	2	6	855828	855833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_010520	AAT	2	6	855835	855840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_010520	T	6	6	855854	855859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_010520	ATG	2	6	855916	855921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_010520	AT	3	6	855938	855943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_010520	AAT	2	6	855956	855961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_010520	ATA	3	9	857261	857269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_010520	TAA	2	6	857284	857289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_010520	ACA	2	6	857306	857311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_010520	TA	3	6	857342	857347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_010520	GAA	2	6	857354	857359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_010520	CTT	3	9	857382	857390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_010520	AAG	2	6	857398	857403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_010520	TAAATA	2	12	857469	857480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_010520	TA	3	6	860270	860275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_010520	AT	3	6	860284	860289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_010520	ATAA	2	8	860298	860305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_010520	TAG	2	6	860313	860318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_010520	AAT	2	6	860326	860331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010520	GAT	2	6	860362	860367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_010520	TTAGT	2	10	860368	860377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_010520	TGA	2	6	860432	860437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_010520	TTAATT	2	12	860455	860466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_010520	A	6	6	860481	860486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_010520	AAGT	2	8	861523	861530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_010520	ATA	2	6	861613	861618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_010520	AGATA	2	10	864011	864020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_010520	TATCT	2	10	864031	864040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5596	NC_010520	A	6	6	864155	864160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_010520	A	6	6	864212	864217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_010520	ATA	2	6	864225	864230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_010520	TCTT	2	8	864301	864308	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5601	NC_010520	ATT	2	6	864430	864435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_010520	A	6	6	864450	864455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_010520	A	6	6	864474	864479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_010520	AAAT	2	8	864486	864493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_010520	A	6	6	864555	864560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_010520	AT	3	6	864564	864569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_010520	TATAA	2	10	866035	866044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_010520	GTAAT	2	10	866048	866057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_010520	AATT	2	8	866188	866195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_010520	ATAA	2	8	866212	866219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_010520	AG	3	6	866254	866259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_010520	AATA	2	8	866750	866757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_010520	GTT	2	6	866770	866775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5618	NC_010520	TA	3	6	866928	866933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5620	NC_010520	CAA	2	6	866984	866989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5623	NC_010520	TAA	2	6	867255	867260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_010520	AGTT	2	8	868389	868396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_010520	TGA	2	6	868421	868426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_010520	A	6	6	868700	868705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5633	NC_010520	ATA	2	6	869853	869858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_010520	TAATA	2	10	869874	869883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_010520	A	6	6	869887	869892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5636	NC_010520	AT	3	6	869909	869914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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