MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C chromosome

Total Repeats: 7166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010424	CTA	2	6	435566	435571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_010424	AAG	2	6	435593	435598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010424	CAT	2	6	435603	435608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_010424	TCC	2	6	435624	435629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_010424	CGGGC	2	10	435743	435752	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1506	NC_010424	GAA	2	6	435826	435831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010424	GGA	2	6	435909	435914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010424	CTG	2	6	435943	435948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_010424	CTTT	2	8	436004	436011	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_010424	TTTG	2	8	436034	436041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010424	GCC	2	6	436102	436107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_010424	GAC	2	6	436174	436179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_010424	TTC	2	6	436201	436206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010424	CCA	2	6	436233	436238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_010424	GAA	2	6	436279	436284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010424	GCA	2	6	436294	436299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_010424	TCG	2	6	436317	436322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010424	CTT	2	6	436397	436402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_010424	ACG	2	6	436546	436551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010424	TTA	2	6	436564	436569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010424	CCG	2	6	436640	436645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_010424	CAGG	2	8	436692	436699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_010424	CAT	2	6	436767	436772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_010424	CGA	2	6	436784	436789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_010424	GC	3	6	436863	436868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_010424	GGA	2	6	436914	436919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010424	AGA	2	6	436929	436934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010424	CAT	2	6	437010	437015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_010424	TTC	2	6	437044	437049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_010424	CCGG	2	8	437161	437168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_010424	ACTG	2	8	437236	437243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_010424	ATC	2	6	437267	437272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_010424	GA	3	6	437375	437380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010424	GGTT	2	8	437424	437431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010424	GCT	2	6	437536	437541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_010424	ACT	2	6	437553	437558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_010424	ACC	2	6	437581	437586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_010424	GAG	2	6	437630	437635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010424	AAGG	2	8	437660	437667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010424	CTC	2	6	437751	437756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_010424	TGG	2	6	437880	437885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010424	TCC	2	6	437955	437960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_010424	CGA	2	6	438007	438012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_010424	TGG	2	6	438218	438223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010424	ACT	2	6	438363	438368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_010424	TGCC	2	8	438387	438394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_010424	GTG	2	6	438434	438439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_010424	CGG	2	6	438465	438470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_010424	GAA	2	6	438479	438484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_010424	GGCCG	2	10	438576	438585	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1551	NC_010424	CGG	2	6	438600	438605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_010424	GAG	2	6	438737	438742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010424	TGA	2	6	438760	438765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_010424	CAG	2	6	438824	438829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_010424	GTC	2	6	438831	438836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_010424	CA	3	6	439082	439087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_010424	TCT	2	6	439201	439206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_010424	GCG	2	6	439229	439234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_010424	GGA	2	6	439298	439303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_010424	GAA	2	6	439316	439321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010424	CGC	2	6	439328	439333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_010424	TTC	2	6	439439	439444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_010424	TGC	2	6	439467	439472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_010424	GGGT	2	8	439516	439523	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010424	AAG	2	6	439575	439580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010424	TTA	2	6	439707	439712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010424	GCTTT	2	10	439764	439773	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1568	NC_010424	GAA	2	6	439807	439812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010424	GATG	2	8	439832	439839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010424	AG	3	6	439930	439935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010424	GGC	2	6	440010	440015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_010424	GGT	2	6	440025	440030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010424	TAA	2	6	440078	440083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010424	GCCG	2	8	440166	440173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_010424	CCG	2	6	440191	440196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_010424	GAAG	2	8	440268	440275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_010424	CCG	2	6	440276	440281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_010424	GTT	2	6	440292	440297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010424	CA	4	8	440304	440311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_010424	ATGG	2	8	440410	440417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_010424	GAT	2	6	440442	440447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_010424	TTC	2	6	441478	441483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_010424	CGC	2	6	441508	441513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_010424	A	6	6	441578	441583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_010424	AAG	2	6	441701	441706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_010424	ACC	2	6	441741	441746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_010424	A	6	6	441747	441752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010424	AGG	2	6	441762	441767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010424	TA	3	6	443196	443201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010424	GAA	2	6	443357	443362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010424	GA	3	6	443451	443456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010424	ACC	2	6	443467	443472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_010424	GAAA	2	8	443531	443538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010424	GGT	2	6	443545	443550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010424	CCG	2	6	443561	443566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_010424	GGC	2	6	443611	443616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1598	NC_010424	TGC	2	6	443711	443716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_010424	CCGG	2	8	443758	443765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_010424	CGTTAT	2	12	443846	443857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1601	NC_010424	G	6	6	443883	443888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_010424	GCG	2	6	443967	443972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_010424	GCT	2	6	443974	443979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_010424	ATC	2	6	444002	444007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_010424	CGG	2	6	444021	444026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_010424	GATG	2	8	444043	444050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010424	GCG	3	9	444058	444066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_010424	CGG	2	6	444096	444101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_010424	TGG	3	9	444114	444122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010424	GGACG	2	10	444182	444191	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_010424	CG	3	6	444190	444195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_010424	GGTC	2	8	444205	444212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_010424	GTT	2	6	444259	444264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010424	CTG	2	6	444284	444289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_010424	GCT	2	6	444292	444297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_010424	GGA	2	6	444298	444303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010424	TAT	2	6	444337	444342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010424	TGG	2	6	444354	444359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010424	CTG	2	6	444428	444433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_010424	GCC	2	6	444452	444457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_010424	TCT	2	6	444458	444463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_010424	GGA	2	6	444496	444501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_010424	GAAGAC	2	12	444512	444523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1624	NC_010424	TG	3	6	445951	445956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_010424	T	7	7	445999	446005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_010424	ATA	2	6	446779	446784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010424	CAA	2	6	446805	446810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_010424	ACG	2	6	446943	446948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_010424	TGCC	2	8	446958	446965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_010424	AC	3	6	446997	447002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_010424	CCG	2	6	447035	447040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_010424	ATT	2	6	447047	447052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_010424	CGC	3	9	447087	447095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1909	NC_010424	CG	3	6	514115	514120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1931	NC_010424	TTC	2	6	518707	518712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1932	NC_010424	ATT	2	6	519619	519624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_010424	CGG	2	6	536772	536777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1978	NC_010424	CGGTA	2	10	536779	536788	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1979	NC_010424	AGAT	2	8	536942	536949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1980	NC_010424	ATC	2	6	536951	536956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_010424	GACCCA	2	12	540890	540901	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

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