MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 12772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010407	GGA	2	6	2579261	2579266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_010407	GGC	2	6	2579312	2579317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_010407	CGA	2	6	2580732	2580737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_010407	GCACCG	2	12	2580750	2580761	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_010407	CGC	2	6	2580768	2580773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_010407	CGGT	2	8	2580799	2580806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10007	NC_010407	GCGG	2	8	2580807	2580814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_010407	CGC	2	6	2583175	2583180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_010407	TCG	2	6	2583193	2583198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_010407	CGG	2	6	2583230	2583235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_010407	CG	3	6	2583249	2583254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_010407	GCA	2	6	2584726	2584731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_010407	GAC	2	6	2584749	2584754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_010407	GCC	2	6	2584761	2584766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_010407	GCG	2	6	2584782	2584787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_010407	CTG	2	6	2584791	2584796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_010407	CTG	2	6	2584805	2584810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_010407	TCG	2	6	2585771	2585776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_010407	GTG	2	6	2585802	2585807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_010407	TCG	2	6	2585894	2585899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_010407	GGGA	2	8	2585911	2585918	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_010407	GC	3	6	2592582	2592587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_010407	GGT	2	6	2592647	2592652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_010407	GCT	2	6	2592674	2592679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_010407	G	6	6	2592697	2592702	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_010407	GCGCG	2	10	2592751	2592760	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10027	NC_010407	GCC	2	6	2592761	2592766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10028	NC_010407	CGG	2	6	2593873	2593878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_010407	C	7	7	2593881	2593887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10030	NC_010407	ACTTC	2	10	2593897	2593906	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10031	NC_010407	CTA	2	6	2593944	2593949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_010407	CAGC	2	8	2593973	2593980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_010407	TG	3	6	2593990	2593995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_010407	GCT	2	6	2594082	2594087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10036	NC_010407	CTG	2	6	2594144	2594149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_010407	GCC	2	6	2594184	2594189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_010407	GCG	2	6	2594201	2594206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_010407	TG	3	6	2594259	2594264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_010407	GCC	2	6	2594639	2594644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_010407	GGCG	2	8	2594671	2594678	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_010407	AGCG	2	8	2594722	2594729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_010407	CCT	2	6	2594743	2594748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_010407	GC	3	6	2596007	2596012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_010407	CGAGT	2	10	2596073	2596082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10046	NC_010407	GCAC	2	8	2596122	2596129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10047	NC_010407	ATCG	2	8	2596156	2596163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10048	NC_010407	GC	3	6	2596198	2596203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_010407	GGA	2	6	2596210	2596215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_010407	CAGC	2	8	2596299	2596306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_010407	CGGC	2	8	2596416	2596423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_010407	GAC	2	6	2596445	2596450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_010407	CGT	2	6	2596476	2596481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_010407	GGT	2	6	2596483	2596488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_010407	GATG	2	8	2597986	2597993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_010407	GC	3	6	2599262	2599267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_010407	CG	3	6	2599310	2599315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_010407	CG	3	6	2599325	2599330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_010407	TCC	2	6	2600406	2600411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_010407	CGGGT	2	10	2600420	2600429	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10061	NC_010407	G	6	6	2600435	2600440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_010407	CCGC	2	8	2600454	2600461	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10063	NC_010407	GCGG	2	8	2600474	2600481	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_010407	TTGCG	2	10	2601785	2601794	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10065	NC_010407	GCG	2	6	2601850	2601855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_010407	CG	3	6	2601861	2601866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_010407	CGT	2	6	2603912	2603917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_010407	CGG	2	6	2603943	2603948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10073	NC_010407	GCTC	2	8	2604790	2604797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_010407	CCG	2	6	2604820	2604825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10075	NC_010407	TGG	2	6	2604832	2604837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10088	NC_010407	CG	3	6	2611139	2611144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10089	NC_010407	CCGGG	2	10	2611147	2611156	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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10094	NC_010407	CGTG	2	8	2611873	2611880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10095	NC_010407	CGT	2	6	2612581	2612586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10097	NC_010407	GTC	2	6	2612593	2612598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10099	NC_010407	CG	4	8	2612673	2612680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_010407	GAC	2	6	2614797	2614802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10105	NC_010407	GGC	2	6	2616742	2616747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_010407	GGT	2	6	2616756	2616761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_010407	GCC	2	6	2616771	2616776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_010407	CGT	2	6	2616802	2616807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_010407	TCT	2	6	2616843	2616848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_010407	TGCA	2	8	2618237	2618244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10111	NC_010407	TGC	2	6	2619263	2619268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_010407	CGT	2	6	2620775	2620780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_010407	TGC	2	6	2620905	2620910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_010407	GC	3	6	2622432	2622437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_010407	CGT	2	6	2622461	2622466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_010407	GCC	2	6	2622485	2622490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_010407	CG	3	6	2622526	2622531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10118	NC_010407	ATG	2	6	2622541	2622546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_010407	G	6	6	2622546	2622551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_010407	CGA	2	6	2623067	2623072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_010407	GCG	2	6	2623073	2623078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_010407	CGCC	2	8	2623081	2623088	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10123	NC_010407	GCGG	2	8	2623090	2623097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10124	NC_010407	CGGG	2	8	2625312	2625319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10125	NC_010407	CTG	2	6	2625340	2625345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_010407	TGA	2	6	2625361	2625366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_010407	GCC	2	6	2625399	2625404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10129	NC_010407	CG	3	6	2625438	2625443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10130	NC_010407	AGCGC	2	10	2625490	2625499	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10131	NC_010407	CTC	2	6	2625510	2625515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10132	NC_010407	CGC	2	6	2625516	2625521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10133	NC_010407	CCCGC	2	10	2625523	2625532	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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10143	NC_010407	CGT	2	6	2625688	2625693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10249	NC_010407	CCT	2	6	2658124	2658129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10251	NC_010407	CGG	2	6	2658154	2658159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_010407	CGGG	2	8	2658163	2658170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10253	NC_010407	GCG	2	6	2658420	2658425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_010407	ACG	2	6	2658438	2658443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_010407	TCC	2	6	2658446	2658451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10257	NC_010407	CGC	2	6	2658464	2658469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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