MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 12772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010407	ACG	2	6	103846	103851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010407	TGACGG	2	12	103910	103921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
503	NC_010407	GCCTC	2	10	103931	103940	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
504	NC_010407	AGGA	2	8	103945	103952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010407	CACGGT	2	12	103956	103967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010407	GTC	2	6	103978	103983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010407	CCGC	2	8	103987	103994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
508	NC_010407	CCG	2	6	104030	104035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_010407	CGG	2	6	104051	104056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010407	CCG	2	6	104135	104140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_010407	CAC	2	6	104175	104180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_010407	GCG	3	9	104228	104236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_010407	TGA	2	6	104315	104320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010407	GTCG	2	8	104352	104359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_010407	GCA	2	6	104388	104393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010407	CAC	2	6	104430	104435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_010407	GCCGA	2	10	104467	104476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
518	NC_010407	CGA	3	9	104489	104497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010407	GCC	2	6	104509	104514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_010407	GCC	2	6	104563	104568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_010407	CGA	2	6	104589	104594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010407	CTG	2	6	104596	104601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010407	GACG	2	8	104604	104611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_010407	CCT	2	6	104678	104683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_010407	GTTCA	2	10	104698	104707	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_010407	AGG	2	6	104717	104722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010407	GTCC	2	8	107042	107049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
528	NC_010407	CGG	2	6	107052	107057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010407	GAG	3	9	107062	107070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010407	ACG	2	6	107123	107128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010407	CCCCG	2	10	107235	107244	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
532	NC_010407	CGC	2	6	108315	108320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_010407	GCG	2	6	108321	108326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010407	CTC	2	6	109177	109182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_010407	CAG	2	6	109197	109202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_010407	CTG	2	6	109216	109221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_010407	AGG	2	6	109236	109241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010407	GC	3	6	109243	109248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_010407	GCGCC	2	10	110538	110547	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
540	NC_010407	CGGA	2	8	110560	110567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
541	NC_010407	AGG	2	6	112431	112436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010407	CG	3	6	112470	112475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_010407	GTC	2	6	112481	112486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_010407	CCG	2	6	112494	112499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_010407	GCC	2	6	112516	112521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_010407	TTC	2	6	112528	112533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010407	CGC	2	6	112587	112592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_010407	CCG	2	6	112593	112598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_010407	CG	3	6	112611	112616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_010407	CCCG	2	8	112622	112629	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
551	NC_010407	GACG	2	8	113216	113223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_010407	GTG	2	6	113256	113261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010407	GCGG	2	8	113335	113342	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
554	NC_010407	GA	3	6	113383	113388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010407	CCG	2	6	113435	113440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_010407	GGC	2	6	113447	113452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010407	GCA	2	6	113617	113622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_010407	CG	3	6	113676	113681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_010407	GCG	2	6	113711	113716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010407	GC	3	6	113797	113802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_010407	GGGGA	2	10	113851	113860	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010407	GC	3	6	113885	113890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_010407	CCG	2	6	113959	113964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_010407	CCCG	2	8	116724	116731	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
565	NC_010407	CCGGC	2	10	116739	116748	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
566	NC_010407	TCC	2	6	116749	116754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_010407	ACG	3	9	116764	116772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_010407	CTG	2	6	116788	116793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_010407	CGT	3	9	116804	116812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010407	CTC	2	6	117381	117386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_010407	TGC	2	6	117408	117413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010407	CG	3	6	119007	119012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_010407	CTC	2	6	119016	119021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_010407	GGC	2	6	119054	119059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_010407	TCG	2	6	119107	119112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_010407	CAC	2	6	124754	124759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_010407	GCA	2	6	124774	124779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010407	GAG	2	6	127930	127935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010407	CAC	2	6	127936	127941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_010407	CGC	2	6	128824	128829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010407	ATCCG	2	10	128835	128844	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
582	NC_010407	GCCCCG	2	12	128852	128863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_010407	GCC	2	6	128898	128903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_010407	CCGC	2	8	128929	128936	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
585	NC_010407	GCG	2	6	130622	130627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010407	TCA	2	6	130633	130638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010407	GCC	2	6	130828	130833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_010407	GGC	2	6	130841	130846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_010407	CCG	2	6	130866	130871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_010407	TCG	2	6	130915	130920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_010407	CGT	2	6	130925	130930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_010407	CT	3	6	130933	130938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_010407	ACC	2	6	133506	133511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_010407	CGT	2	6	133518	133523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010407	GCG	2	6	133536	133541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_010407	CGT	2	6	133545	133550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010407	TCC	2	6	133572	133577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_010407	CCT	2	6	133590	133595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_010407	GCG	2	6	133599	133604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_010407	CCGC	2	8	135528	135535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
601	NC_010407	CCG	2	6	135538	135543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_010407	GCGG	2	8	135550	135557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
603	NC_010407	GTC	3	9	135597	135605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010407	CCT	2	6	135721	135726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_010407	TG	3	6	135745	135750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010407	CCA	2	6	136373	136378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_010407	ACACC	2	10	136380	136389	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
608	NC_010407	GCA	2	6	136795	136800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010407	CGT	2	6	136847	136852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010407	C	6	6	138495	138500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
611	NC_010407	GGGC	2	8	138517	138524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
612	NC_010407	CGG	2	6	138551	138556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010407	CAC	2	6	139142	139147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_010407	CATC	2	8	139153	139160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_010407	AGG	2	6	139173	139178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010407	CGCCC	2	10	140453	140462	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
617	NC_010407	CCCG	2	8	140468	140475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
618	NC_010407	TCG	2	6	141530	141535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010407	CG	4	8	141543	141550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_010407	GAT	2	6	141589	141594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010407	G	6	6	141606	141611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010407	CGC	2	6	141623	141628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_010407	CGC	2	6	141655	141660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_010407	ACGC	2	8	141752	141759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
625	NC_010407	AGGAC	2	10	141760	141769	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
626	NC_010407	GGCGG	2	10	141770	141779	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
627	NC_010407	CCG	2	6	143195	143200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_010407	GCC	2	6	143236	143241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_010407	GCC	2	6	143250	143255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_010407	CG	3	6	143261	143266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_010407	GTC	2	6	145294	145299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010407	GCGG	2	8	145307	145314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
633	NC_010407	CGT	3	9	145321	145329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_010407	GA	3	6	145351	145356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010407	CGC	2	6	145403	145408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_010407	GCG	2	6	145411	145416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_010407	GGC	2	6	145428	145433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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915	NC_010407	CGG	3	9	237156	237164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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942	NC_010407	CGG	2	6	248175	248180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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949	NC_010407	GCG	2	6	248319	248324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_010407	GAG	2	6	248439	248444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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988	NC_010407	GGGC	2	8	253606	253613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
989	NC_010407	GACCC	2	10	254504	254513	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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