MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 12772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_010407	CGGC	2	8	1801674	1801681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7002	NC_010407	CGC	2	6	1801706	1801711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7003	NC_010407	GTC	2	6	1804391	1804396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_010407	CTC	2	6	1804445	1804450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_010407	GGT	2	6	1804462	1804467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_010407	CGG	2	6	1804587	1804592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_010407	CGC	2	6	1804639	1804644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7008	NC_010407	CACG	2	8	1804666	1804673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_010407	TCG	2	6	1804731	1804736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_010407	TCG	2	6	1804758	1804763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_010407	GCG	2	6	1804838	1804843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_010407	CGC	2	6	1804858	1804863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7013	NC_010407	CG	3	6	1804907	1804912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7014	NC_010407	CGG	2	6	1804927	1804932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_010407	CCG	2	6	1804974	1804979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_010407	CGGCGA	2	12	1805020	1805031	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_010407	GGA	2	6	1805044	1805049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_010407	TCA	2	6	1805092	1805097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_010407	GAC	2	6	1805201	1805206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_010407	TCG	2	6	1805245	1805250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_010407	TACC	2	8	1806479	1806486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_010407	CAC	2	6	1806522	1806527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_010407	CGG	2	6	1806559	1806564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_010407	CGG	2	6	1806656	1806661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_010407	GA	3	6	1806701	1806706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_010407	CGC	2	6	1806752	1806757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_010407	CGGA	2	8	1806802	1806809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7028	NC_010407	CAC	2	6	1806817	1806822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7029	NC_010407	GAGGG	2	10	1806823	1806832	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_010407	ACC	2	6	1806921	1806926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_010407	GAC	2	6	1806929	1806934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_010407	CG	3	6	1806938	1806943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_010407	CGG	2	6	1806965	1806970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_010407	CTG	2	6	1806975	1806980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_010407	CGT	2	6	1807024	1807029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_010407	CGG	2	6	1807058	1807063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_010407	AGC	2	6	1807076	1807081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_010407	TCGG	2	8	1807117	1807124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_010407	CG	3	6	1807127	1807132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7041	NC_010407	CTT	2	6	1807180	1807185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_010407	GTC	2	6	1807232	1807237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_010407	CGA	2	6	1807259	1807264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_010407	GC	3	6	1809566	1809571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_010407	ATC	2	6	1809572	1809577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7047	NC_010407	GAC	2	6	1809629	1809634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7050	NC_010407	CTC	2	6	1809892	1809897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7052	NC_010407	CTC	2	6	1809984	1809989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_010407	GCG	2	6	1809997	1810002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_010407	CG	3	6	1810013	1810018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7055	NC_010407	TGC	2	6	1810074	1810079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_010407	GGCG	2	8	1810080	1810087	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7057	NC_010407	CAC	2	6	1810105	1810110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7058	NC_010407	CTC	2	6	1810123	1810128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_010407	CGA	2	6	1810186	1810191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_010407	GTC	2	6	1810201	1810206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_010407	CAC	2	6	1810210	1810215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7062	NC_010407	CGA	2	6	1810219	1810224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_010407	CCG	2	6	1810236	1810241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_010407	ACG	3	9	1810262	1810270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_010407	CGG	2	6	1810280	1810285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7068	NC_010407	TCG	2	6	1810581	1810586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7072	NC_010407	CGA	2	6	1810721	1810726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7074	NC_010407	CCG	2	6	1810749	1810754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7075	NC_010407	CGC	2	6	1810761	1810766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7076	NC_010407	AGCGG	2	10	1810838	1810847	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7077	NC_010407	TCCCG	2	10	1810851	1810860	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7078	NC_010407	CCCT	2	8	1810863	1810870	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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7086	NC_010407	CG	3	6	1812021	1812026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7088	NC_010407	CGGG	2	8	1812080	1812087	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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7090	NC_010407	TGAAC	2	10	1813105	1813114	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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7093	NC_010407	GCCG	2	8	1813659	1813666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7094	NC_010407	CGG	2	6	1815107	1815112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7099	NC_010407	CGGA	2	8	1816258	1816265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7100	NC_010407	GCTCC	2	10	1818115	1818124	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7101	NC_010407	CGC	2	6	1818133	1818138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7102	NC_010407	GCC	2	6	1818154	1818159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_010407	CG	4	8	1818899	1818906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_010407	C	6	6	1818922	1818927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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7108	NC_010407	CG	3	6	1818979	1818984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_010407	CG	3	6	1818986	1818991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7110	NC_010407	AGC	2	6	1818993	1818998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7112	NC_010407	CGA	2	6	1820810	1820815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_010407	CGC	2	6	1820835	1820840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_010407	AGG	3	9	1820849	1820857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_010407	CGC	2	6	1820891	1820896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7117	NC_010407	GAGC	2	8	1824950	1824957	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7118	NC_010407	ACC	2	6	1827220	1827225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7119	NC_010407	GAG	2	6	1827245	1827250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_010407	CGA	2	6	1827262	1827267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7122	NC_010407	CG	3	6	1827319	1827324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_010407	GGT	2	6	1833505	1833510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_010407	CGG	2	6	1833529	1833534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_010407	GCG	2	6	1833546	1833551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_010407	CTC	2	6	1833559	1833564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7127	NC_010407	GC	3	6	1833583	1833588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7129	NC_010407	TGG	2	6	1833612	1833617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7259	NC_010407	GGC	2	6	1851282	1851287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7260	NC_010407	GC	3	6	1851306	1851311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7261	NC_010407	TCG	2	6	1851329	1851334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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