MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 12772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010407	CCT	2	6	1685202	1685207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_010407	GTT	2	6	1685227	1685232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_010407	CG	3	6	1689339	1689344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6504	NC_010407	CCGA	2	8	1689370	1689377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6505	NC_010407	GAC	2	6	1689386	1689391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_010407	GC	4	8	1690715	1690722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_010407	GTC	2	6	1690836	1690841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_010407	C	6	6	1691605	1691610	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6509	NC_010407	CTCG	2	8	1691665	1691672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_010407	AGCGGC	2	12	1693557	1693568	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_010407	CGC	2	6	1693604	1693609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_010407	CG	4	8	1693829	1693836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_010407	CG	3	6	1694715	1694720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6514	NC_010407	CGG	2	6	1695539	1695544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_010407	CGC	2	6	1695595	1695600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_010407	GGA	2	6	1695601	1695606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_010407	ACCC	2	8	1695670	1695677	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6518	NC_010407	AG	3	6	1695703	1695708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_010407	GCG	2	6	1695728	1695733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_010407	CGG	2	6	1695747	1695752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_010407	ACC	2	6	1695761	1695766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6522	NC_010407	GCT	2	6	1695835	1695840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_010407	ACG	2	6	1695971	1695976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_010407	GCG	2	6	1696016	1696021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_010407	GCC	2	6	1696025	1696030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_010407	CCCGA	2	10	1696876	1696885	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6527	NC_010407	TCC	2	6	1697112	1697117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_010407	CGG	2	6	1698004	1698009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_010407	CG	4	8	1698014	1698021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6530	NC_010407	CGA	2	6	1698059	1698064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_010407	GTG	2	6	1698069	1698074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6533	NC_010407	ACG	3	9	1702515	1702523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_010407	GCC	2	6	1702525	1702530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_010407	GGA	3	9	1702536	1702544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_010407	CGC	2	6	1702559	1702564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_010407	CGTC	2	8	1704174	1704181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_010407	CGA	2	6	1704634	1704639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_010407	CGG	2	6	1705126	1705131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_010407	TGC	3	9	1705146	1705154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6542	NC_010407	CCG	2	6	1705298	1705303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_010407	GAG	2	6	1705352	1705357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_010407	CGC	2	6	1705358	1705363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_010407	GCGG	2	8	1706167	1706174	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6546	NC_010407	CGG	3	9	1706184	1706192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_010407	TGCG	2	8	1706231	1706238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6548	NC_010407	TCG	2	6	1706258	1706263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_010407	CG	3	6	1706272	1706277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_010407	ACCGGT	2	12	1706298	1706309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_010407	ACGC	2	8	1706318	1706325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_010407	CGGC	2	8	1706331	1706338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_010407	GAG	2	6	1706341	1706346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_010407	GACG	2	8	1706366	1706373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6555	NC_010407	GTCG	2	8	1706387	1706394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6556	NC_010407	GAG	2	6	1706404	1706409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_010407	GGC	2	6	1706434	1706439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_010407	AGCG	2	8	1706458	1706465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6559	NC_010407	CG	4	8	1706468	1706475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_010407	GGA	2	6	1706478	1706483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_010407	GGC	2	6	1706494	1706499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_010407	TG	3	6	1709593	1709598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_010407	GTC	2	6	1711016	1711021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_010407	AGG	2	6	1711061	1711066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_010407	GGA	2	6	1712560	1712565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_010407	GA	3	6	1712570	1712575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_010407	CGA	2	6	1712593	1712598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6569	NC_010407	GCT	2	6	1712622	1712627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_010407	CGG	2	6	1712656	1712661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6572	NC_010407	CGGA	2	8	1712728	1712735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6573	NC_010407	CG	3	6	1713688	1713693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6594	NC_010407	CGC	2	6	1715579	1715584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6603	NC_010407	CGGGT	2	10	1719135	1719144	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6604	NC_010407	GCGGG	2	10	1719232	1719241	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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6610	NC_010407	CT	3	6	1724045	1724050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6613	NC_010407	GAC	3	9	1725274	1725282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_010407	CCGC	2	8	1725290	1725297	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6615	NC_010407	GGC	2	6	1725300	1725305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6621	NC_010407	GGA	2	6	1726755	1726760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_010407	CCT	2	6	1728111	1728116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_010407	TGAAC	2	10	1728126	1728135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6625	NC_010407	C	7	7	1728225	1728231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6627	NC_010407	CTC	2	6	1730746	1730751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6628	NC_010407	GGCAG	2	10	1730755	1730764	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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