MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 12772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010407	CCG	2	6	1348928	1348933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_010407	GAT	2	6	1349009	1349014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_010407	GAC	2	6	1349051	1349056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_010407	CGG	2	6	1349059	1349064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_010407	CG	4	8	1349080	1349087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_010407	GCA	2	6	1349104	1349109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_010407	CGA	2	6	1349125	1349130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_010407	GC	3	6	1349164	1349169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_010407	GCTCAT	2	12	1349201	1349212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_010407	GCGCG	2	10	1349285	1349294	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5511	NC_010407	GGAAGA	2	12	1349356	1349367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_010407	CGCGG	2	10	1349384	1349393	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5513	NC_010407	GGT	2	6	1349414	1349419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_010407	GCG	3	9	1349424	1349432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_010407	TCG	2	6	1349461	1349466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_010407	CCT	2	6	1349470	1349475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_010407	GGA	2	6	1349590	1349595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_010407	GCC	2	6	1349612	1349617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_010407	CGG	3	9	1349665	1349673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_010407	AGCG	2	8	1349712	1349719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5521	NC_010407	CGT	3	9	1349743	1349751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_010407	CAG	2	6	1349753	1349758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_010407	TCC	2	6	1349788	1349793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_010407	GTGG	2	8	1349800	1349807	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_010407	CCG	2	6	1349851	1349856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_010407	GCC	2	6	1349864	1349869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_010407	GGC	2	6	1350537	1350542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_010407	GC	3	6	1350561	1350566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_010407	CG	3	6	1350588	1350593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_010407	CGCGC	2	10	1351952	1351961	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5531	NC_010407	CGA	2	6	1352029	1352034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_010407	ACC	2	6	1352076	1352081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_010407	ACG	2	6	1352094	1352099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_010407	CG	3	6	1352112	1352117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_010407	GCG	2	6	1352180	1352185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_010407	CGA	3	9	1352197	1352205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_010407	CGGG	2	8	1352232	1352239	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_010407	GC	3	6	1352257	1352262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_010407	GTC	2	6	1352308	1352313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_010407	CGCC	2	8	1352316	1352323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5541	NC_010407	CTC	2	6	1352392	1352397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_010407	GCA	2	6	1352436	1352441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_010407	GAG	2	6	1352449	1352454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_010407	CGT	2	6	1352460	1352465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_010407	CG	3	6	1352475	1352480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_010407	CAC	2	6	1352483	1352488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_010407	CGT	2	6	1352502	1352507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_010407	CGG	2	6	1352546	1352551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_010407	GCC	2	6	1352565	1352570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_010407	TCG	2	6	1352573	1352578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_010407	CCA	2	6	1352580	1352585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_010407	ACC	2	6	1352602	1352607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_010407	GC	4	8	1354281	1354288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_010407	CGC	2	6	1354310	1354315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_010407	CCG	2	6	1354375	1354380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_010407	CCG	2	6	1354538	1354543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_010407	CGT	2	6	1354589	1354594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_010407	TGA	2	6	1354607	1354612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_010407	GTC	2	6	1354624	1354629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_010407	GTC	2	6	1354648	1354653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_010407	CGGG	2	8	1354670	1354677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_010407	GGC	2	6	1354728	1354733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_010407	CGT	2	6	1354737	1354742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_010407	GCC	2	6	1354743	1354748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_010407	CCG	2	6	1354750	1354755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_010407	CGT	2	6	1354778	1354783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_010407	GGTGA	2	10	1354818	1354827	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_010407	CCG	2	6	1354829	1354834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_010407	GCT	2	6	1354856	1354861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5571	NC_010407	CGA	2	6	1354918	1354923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_010407	TCG	2	6	1354941	1354946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_010407	TGA	2	6	1354971	1354976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_010407	GCG	2	6	1355010	1355015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5578	NC_010407	GTG	3	9	1355089	1355097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_010407	GGGC	2	8	1355109	1355116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5580	NC_010407	GTG	2	6	1355122	1355127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5585	NC_010407	GAGCG	2	10	1355204	1355213	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5588	NC_010407	GC	3	6	1355305	1355310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_010407	TCC	2	6	1355330	1355335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_010407	GCCGC	2	10	1355339	1355348	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5592	NC_010407	CG	4	8	1355361	1355368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_010407	GC	3	6	1355387	1355392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_010407	CGC	2	6	1355395	1355400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_010407	CG	5	10	1355402	1355411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_010407	CGC	2	6	1355413	1355418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_010407	CGGA	2	8	1355429	1355436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5598	NC_010407	TCG	2	6	1355442	1355447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_010407	CGC	2	6	1355489	1355494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_010407	CGTCA	2	10	1355504	1355513	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5601	NC_010407	CGC	3	9	1355523	1355531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_010407	GTC	2	6	1355533	1355538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_010407	GCG	2	6	1355541	1355546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_010407	GCC	2	6	1356903	1356908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_010407	CGGG	2	8	1356938	1356945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_010407	CCG	2	6	1356980	1356985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5609	NC_010407	GC	4	8	1357353	1357360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_010407	GTG	2	6	1357400	1357405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_010407	GTC	2	6	1358250	1358255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_010407	TGA	2	6	1358266	1358271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_010407	GCGGT	3	15	1358306	1358320	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5614	NC_010407	CGC	2	6	1358333	1358338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_010407	CGCGGG	2	12	1358344	1358355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5617	NC_010407	GCC	2	6	1358398	1358403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_010407	CCT	2	6	1358409	1358414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_010407	CG	3	6	1360088	1360093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_010407	CGG	2	6	1360095	1360100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5622	NC_010407	GCG	2	6	1360135	1360140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_010407	CGG	2	6	1360143	1360148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_010407	CGCC	2	8	1360181	1360188	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5625	NC_010407	CGG	2	6	1360198	1360203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_010407	GCC	2	6	1360204	1360209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_010407	CGG	2	6	1362444	1362449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5629	NC_010407	GAC	2	6	1363525	1363530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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