MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caulobacter sp. K31 chromosome

Total Repeats: 13318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010338	GGA	2	6	5370293	5370298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_010338	GCG	2	6	5370356	5370361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_010338	AGT	2	6	5370471	5370476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_010338	GTT	2	6	5372808	5372813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_010338	CCA	2	6	5372817	5372822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_010338	AGG	2	6	5372856	5372861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_010338	GGC	2	6	5373211	5373216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_010338	TGC	2	6	5373269	5373274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_010338	GCC	2	6	5373330	5373335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13010	NC_010338	GA	3	6	5373514	5373519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_010338	CTG	2	6	5373520	5373525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_010338	AAG	2	6	5373567	5373572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_010338	ACCGA	2	10	5373634	5373643	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13014	NC_010338	CGCGG	2	10	5373646	5373655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13015	NC_010338	CTT	2	6	5373703	5373708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_010338	GCCG	2	8	5373772	5373779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13017	NC_010338	TTC	2	6	5373800	5373805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_010338	CGCC	2	8	5373855	5373862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13019	NC_010338	CCG	2	6	5373864	5373869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13020	NC_010338	CAG	2	6	5373890	5373895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_010338	TCC	2	6	5375693	5375698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_010338	GAG	2	6	5375740	5375745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_010338	AGA	2	6	5377012	5377017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_010338	GCA	2	6	5377078	5377083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_010338	C	6	6	5377113	5377118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13026	NC_010338	AAG	2	6	5378308	5378313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_010338	CCG	2	6	5378364	5378369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_010338	TGC	2	6	5378472	5378477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_010338	CCG	2	6	5378487	5378492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13030	NC_010338	CG	3	6	5378552	5378557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13031	NC_010338	TCG	2	6	5378570	5378575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_010338	GGC	2	6	5378658	5378663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_010338	GGC	2	6	5379691	5379696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_010338	CAG	2	6	5379701	5379706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_010338	AACC	2	8	5383414	5383421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_010338	TGAG	2	8	5383463	5383470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_010338	CG	3	6	5385152	5385157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13038	NC_010338	A	6	6	5385181	5385186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_010338	GC	3	6	5385253	5385258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_010338	CCG	2	6	5385682	5385687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_010338	AGA	2	6	5387173	5387178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_010338	TC	3	6	5387197	5387202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_010338	CGG	2	6	5387831	5387836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_010338	TCG	2	6	5387847	5387852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_010338	CGGC	2	8	5388300	5388307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_010338	GC	3	6	5388469	5388474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_010338	AAG	2	6	5388502	5388507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_010338	CT	4	8	5389420	5389427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13049	NC_010338	GA	3	6	5389430	5389435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_010338	CGG	2	6	5389505	5389510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_010338	GTC	2	6	5389525	5389530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_010338	CTT	2	6	5389537	5389542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_010338	CGG	2	6	5389583	5389588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_010338	CGC	2	6	5389607	5389612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13055	NC_010338	TCCC	2	8	5389624	5389631	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13056	NC_010338	TC	3	6	5389632	5389637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_010338	AG	3	6	5389640	5389645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_010338	TGG	2	6	5389653	5389658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_010338	CCCTG	2	10	5390961	5390970	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13060	NC_010338	CGA	2	6	5390985	5390990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_010338	AAG	2	6	5390999	5391004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_010338	CGCGG	2	10	5391041	5391050	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13063	NC_010338	CG	3	6	5391078	5391083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13064	NC_010338	CGG	2	6	5391102	5391107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_010338	G	6	6	5393910	5393915	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_010338	GC	3	6	5393983	5393988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13067	NC_010338	CACC	2	8	5394770	5394777	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13068	NC_010338	AGGGG	2	10	5394832	5394841	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_010338	G	6	6	5394883	5394888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_010338	TCT	2	6	5395100	5395105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_010338	G	7	7	5395137	5395143	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_010338	GGC	2	6	5395209	5395214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_010338	GCT	2	6	5395274	5395279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_010338	GCC	2	6	5395285	5395290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_010338	GGT	2	6	5395296	5395301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_010338	CGCC	2	8	5395307	5395314	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13077	NC_010338	GAGG	2	8	5395756	5395763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_010338	A	6	6	5395767	5395772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_010338	CGG	2	6	5395777	5395782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_010338	CCG	2	6	5395787	5395792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13081	NC_010338	TCG	2	6	5395798	5395803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_010338	CAT	2	6	5396597	5396602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_010338	C	6	6	5396608	5396613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13084	NC_010338	GC	3	6	5396662	5396667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_010338	GTT	2	6	5397764	5397769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_010338	C	6	6	5397776	5397781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13087	NC_010338	GGA	2	6	5397900	5397905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13089	NC_010338	CGCGC	2	10	5398517	5398526	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13090	NC_010338	GC	3	6	5400442	5400447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13091	NC_010338	GC	3	6	5400449	5400454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13092	NC_010338	CGG	2	6	5400489	5400494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_010338	CTTCG	2	10	5400503	5400512	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13094	NC_010338	GGC	2	6	5401357	5401362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_010338	CGT	2	6	5401381	5401386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_010338	GGCG	2	8	5401387	5401394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13097	NC_010338	TGA	2	6	5401426	5401431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_010338	CG	3	6	5403452	5403457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_010338	TTG	2	6	5404956	5404961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_010338	CTC	2	6	5406070	5406075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_010338	GCC	2	6	5406081	5406086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13102	NC_010338	GAT	2	6	5406101	5406106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_010338	GTC	2	6	5406134	5406139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_010338	GCC	3	9	5406230	5406238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_010338	GCG	2	6	5406722	5406727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_010338	CCG	2	6	5406750	5406755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13107	NC_010338	CGG	3	9	5407312	5407320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_010338	GCC	3	9	5407329	5407337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13109	NC_010338	CCG	2	6	5407383	5407388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_010338	ACA	2	6	5407392	5407397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_010338	ACG	2	6	5407487	5407492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_010338	GCG	2	6	5407586	5407591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_010338	GC	3	6	5407597	5407602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_010338	GGC	2	6	5407675	5407680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_010338	CGC	2	6	5407694	5407699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13117	NC_010338	AAT	2	6	5407750	5407755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_010338	GCG	3	9	5407841	5407849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_010338	G	6	6	5407849	5407854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_010338	GCCC	2	8	5407919	5407926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13121	NC_010338	GC	3	6	5407952	5407957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13122	NC_010338	TCG	2	6	5408085	5408090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_010338	AC	3	6	5408098	5408103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13124	NC_010338	CGT	2	6	5408119	5408124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_010338	GA	3	6	5408158	5408163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_010338	GGC	2	6	5408172	5408177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_010338	CG	3	6	5408183	5408188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13128	NC_010338	GGGCA	2	10	5408209	5408218	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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13130	NC_010338	CGC	2	6	5408291	5408296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13292	NC_010338	GC	3	6	5471031	5471036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13293	NC_010338	AGGG	2	8	5471089	5471096	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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13318	NC_010338	CG	3	6	5477539	5477544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.