MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 21485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010175	TTG	2	6	793866	793871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010175	CAT	2	6	793909	793914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_010175	GAA	2	6	794015	794020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_010175	AGC	2	6	794043	794048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_010175	GGA	2	6	794078	794083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_010175	TTG	2	6	794657	794662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010175	TCG	2	6	794666	794671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_010175	TGA	2	6	794694	794699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_010175	TGA	2	6	794713	794718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_010175	TCG	2	6	794758	794763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_010175	GCA	2	6	794768	794773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_010175	CAC	2	6	794783	794788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_010175	AGC	3	9	794789	794797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_010175	ATG	2	6	794836	794841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_010175	CTG	2	6	794853	794858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_010175	CAC	2	6	794879	794884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_010175	TG	3	6	794907	794912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_010175	GCT	2	6	794926	794931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_010175	GAT	2	6	794933	794938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_010175	CGA	2	6	794939	794944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_010175	ACG	2	6	794946	794951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_010175	GTC	2	6	795018	795023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_010175	CGA	2	6	795092	795097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_010175	ACG	2	6	795106	795111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_010175	GCAG	2	8	795146	795153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_010175	GAACCT	2	12	795215	795226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_010175	TCA	2	6	795367	795372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_010175	GGT	2	6	795374	795379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_010175	GAC	2	6	795408	795413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_010175	GTA	2	6	795499	795504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_010175	CGC	2	6	795539	795544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_010175	TCC	2	6	795586	795591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_010175	GCC	2	6	795642	795647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_010175	CCAT	2	8	795680	795687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_010175	CAC	2	6	795732	795737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_010175	ATCC	2	8	795753	795760	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_010175	GT	3	6	795845	795850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_010175	CGCA	2	8	795877	795884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_010175	CACAC	2	10	795949	795958	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4040	NC_010175	TCC	2	6	795964	795969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_010175	GGC	2	6	796013	796018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_010175	ACGG	2	8	796040	796047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_010175	CAT	2	6	796138	796143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_010175	GTC	2	6	796191	796196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_010175	TGCA	2	8	796205	796212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_010175	CCT	2	6	796235	796240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_010175	ATG	2	6	796585	796590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_010175	TGGT	2	8	796600	796607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_010175	AGCC	2	8	796676	796683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_010175	GCT	2	6	796745	796750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_010175	ATCA	2	8	797668	797675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_010175	TCC	2	6	797750	797755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_010175	TA	3	6	797777	797782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_010175	TCCT	2	8	797791	797798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_010175	AGT	2	6	797829	797834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4057	NC_010175	CGC	2	6	797872	797877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_010175	AAC	2	6	799027	799032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_010175	T	6	6	799123	799128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_010175	GTG	2	6	799158	799163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_010175	CCAG	2	8	802176	802183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_010175	GAG	2	6	802195	802200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_010175	TGCC	2	8	802259	802266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_010175	TGG	2	6	802286	802291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_010175	CTGGC	2	10	802385	802394	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4066	NC_010175	TTG	2	6	802453	802458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_010175	TGC	2	6	802473	802478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_010175	TGG	2	6	802489	802494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_010175	GCT	2	6	802515	802520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_010175	GCC	2	6	802541	802546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_010175	GCC	2	6	802548	802553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_010175	CGAC	2	8	802572	802579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_010175	ATGGTG	2	12	802589	802600	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_010175	CAGG	2	8	802633	802640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4079	NC_010175	T	6	6	802767	802772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_010175	TGCT	2	8	802877	802884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4082	NC_010175	TGG	2	6	802910	802915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_010175	TA	4	8	803002	803009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4090	NC_010175	TGGT	2	8	803180	803187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_010175	TATC	2	8	803188	803195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4094	NC_010175	TGA	2	6	803292	803297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_010175	CTG	2	6	803451	803456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_010175	TG	3	6	803505	803510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_010175	GCT	2	6	803524	803529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4107	NC_010175	GTC	2	6	803616	803621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_010175	CCTGC	2	10	803669	803678	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4109	NC_010175	ACG	2	6	803704	803709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_010175	GCAG	2	8	803744	803751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_010175	CGG	2	6	803752	803757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_010175	GCTC	2	8	803830	803837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_010175	ACCG	2	8	803899	803906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_010175	GGT	2	6	803972	803977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_010175	GAC	2	6	804006	804011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_010175	CGC	2	6	804137	804142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_010175	TCC	2	6	804184	804189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_010175	CGT	2	6	804220	804225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_010175	GCC	2	6	804240	804245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_010175	AGCG	2	8	804407	804414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_010175	CCAGT	2	10	804453	804462	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4122	NC_010175	GTG	2	6	804475	804480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_010175	GGC	2	6	804493	804498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4125	NC_010175	CT	3	6	806770	806775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4127	NC_010175	CAT	2	6	806940	806945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4129	NC_010175	TAT	2	6	806996	807001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_010175	GAT	2	6	807059	807064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_010175	CCAG	2	8	807091	807098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_010175	ACC	2	6	807163	807168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_010175	TCT	2	6	807171	807176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_010175	CGA	2	6	807200	807205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_010175	ATC	2	6	807216	807221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_010175	GGA	2	6	807604	807609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_010175	GC	3	6	807677	807682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4138	NC_010175	GAT	2	6	807698	807703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_010175	ACG	2	6	807776	807781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_010175	CGA	2	6	807831	807836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_010175	TGC	2	6	807938	807943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4142	NC_010175	GCA	3	9	808011	808019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_010175	CAG	2	6	808030	808035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_010175	AG	3	6	808176	808181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_010175	CTA	2	6	808233	808238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4146	NC_010175	TCAT	2	8	808279	808286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4147	NC_010175	AGGCA	2	10	808404	808413	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4148	NC_010175	ATCC	2	8	808414	808421	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4149	NC_010175	TC	3	6	808447	808452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4150	NC_010175	GTAGG	2	10	808469	808478	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_010175	GT	3	6	808484	808489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_010175	GAC	2	6	808514	808519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4154	NC_010175	CAC	2	6	808538	808543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4155	NC_010175	TTG	2	6	808567	808572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_010175	ATC	2	6	808614	808619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_010175	TGCC	2	8	808702	808709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4158	NC_010175	TGA	2	6	810495	810500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_010175	AG	3	6	810501	810506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_010175	CTA	2	6	810508	810513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_010175	TCCG	2	8	814919	814926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4163	NC_010175	TCC	2	6	820426	820431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4164	NC_010175	CAA	2	6	820522	820527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4165	NC_010175	TGA	2	6	820607	820612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_010175	GCAT	2	8	820630	820637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4167	NC_010175	ATCC	2	8	820655	820662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4168	NC_010175	CCATG	2	10	820663	820672	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4169	NC_010175	ATC	2	6	820765	820770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4171	NC_010175	GC	3	6	822904	822909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4172	NC_010175	CCGC	2	8	822921	822928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4177	NC_010175	CAG	2	6	823045	823050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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