MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010117	TA	3	6	132418	132423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010117	A	7	7	132423	132429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010117	GAA	2	6	132436	132441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010117	AAGC	2	8	132466	132473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_010117	TTC	2	6	132511	132516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010117	CAAC	2	8	132522	132529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_010117	T	6	6	132570	132575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010117	CAA	2	6	132643	132648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010117	CTT	2	6	132866	132871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010117	TAT	2	6	132880	132885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010117	CTT	2	6	132893	132898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_010117	GAA	2	6	132972	132977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010117	A	9	9	132976	132984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010117	GAA	2	6	132992	132997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_010117	ACA	2	6	133042	133047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010117	CAC	2	6	133072	133077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_010117	TGC	2	6	133092	133097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010117	A	6	6	133111	133116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010117	CTGC	2	8	133136	133143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
520	NC_010117	CGCC	2	8	133148	133155	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
521	NC_010117	TTA	2	6	133178	133183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010117	ATGG	2	8	133195	133202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010117	AG	3	6	133274	133279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010117	GTG	2	6	133354	133359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010117	CG	3	6	133400	133405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_010117	T	6	6	133406	133411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010117	A	6	6	133542	133547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010117	ATG	2	6	133572	133577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010117	TAA	2	6	133585	133590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010117	GAA	2	6	133640	133645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010117	GCAA	2	8	133654	133661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_010117	ACG	2	6	133752	133757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010117	TTTA	2	8	133806	133813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010117	GCATG	2	10	133820	133829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
535	NC_010117	TGGT	2	8	133875	133882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010117	GAT	2	6	133913	133918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010117	CGT	2	6	133937	133942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_010117	GAAG	2	8	133946	133953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010117	GAA	2	6	133955	133960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010117	TC	3	6	133974	133979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_010117	TGG	2	6	134002	134007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010117	A	7	7	134038	134044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010117	GAAAA	2	10	134066	134075	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010117	A	7	7	134104	134110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010117	TTC	2	6	134161	134166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_010117	AAC	2	6	134206	134211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010117	T	6	6	134251	134256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010117	GAAGC	2	10	134284	134293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
549	NC_010117	AAT	2	6	134306	134311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010117	TTTCG	2	10	134324	134333	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
551	NC_010117	T	7	7	135646	135652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010117	GGGT	2	8	135698	135705	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010117	CTG	2	6	135841	135846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010117	ACA	2	6	135870	135875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010117	AGA	2	6	137073	137078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010117	TGG	2	6	137168	137173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010117	GGA	2	6	137199	137204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010117	GAT	2	6	137224	137229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010117	TCG	2	6	137237	137242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010117	CAG	2	6	137243	137248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010117	CCT	2	6	137262	137267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_010117	A	7	7	137284	137290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010117	AGA	2	6	137297	137302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010117	CTA	2	6	137329	137334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_010117	CAG	2	6	137348	137353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010117	TAT	2	6	137387	137392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010117	A	8	8	137400	137407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010117	T	6	6	137428	137433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010117	CTG	2	6	137572	137577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010117	TAG	2	6	137643	137648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010117	CAGG	2	8	137652	137659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_010117	AGA	2	6	137721	137726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010117	CT	3	6	137836	137841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_010117	CCA	2	6	137846	137851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_010117	GCA	2	6	137857	137862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_010117	GCCA	2	8	137884	137891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_010117	ATG	2	6	137908	137913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_010117	A	7	7	137930	137936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010117	AAT	2	6	137994	137999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010117	CT	3	6	138056	138061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_010117	AG	3	6	138063	138068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010117	TCGCT	2	10	139329	139338	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
583	NC_010117	CT	3	6	141164	141169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_010117	ATA	2	6	141186	141191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010117	CAT	2	6	141248	141253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010117	GC	3	6	141332	141337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
587	NC_010117	GC	3	6	141341	141346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_010117	GAA	2	6	141374	141379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010117	ATGAT	2	10	141399	141408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010117	TCC	2	6	141419	141424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_010117	ATTAA	2	10	143929	143938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010117	ATT	2	6	143985	143990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010117	AAAT	2	8	143998	144005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010117	ATT	2	6	144011	144016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010117	CGA	2	6	145045	145050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_010117	AACAA	2	10	145056	145065	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
597	NC_010117	A	7	7	145064	145070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010117	AGA	2	6	145093	145098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010117	AGA	2	6	145133	145138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010117	CT	3	6	145178	145183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_010117	AAGA	2	8	145184	145191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010117	AAGT	2	8	145197	145204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010117	GAAAA	2	10	145210	145219	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010117	A	7	7	145216	145222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010117	AAAG	2	8	145225	145232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010117	AGAA	2	8	145245	145252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010117	A	9	9	145295	145303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010117	A	6	6	145318	145323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010117	AAT	2	6	145352	145357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010117	AGAT	2	8	145389	145396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010117	GAG	2	6	145430	145435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010117	ACC	2	6	145498	145503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_010117	GAAA	2	8	145525	145532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010117	AG	3	6	145541	145546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010117	TA	3	6	145572	145577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010117	TGAAAA	2	12	145600	145611	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010117	AAG	2	6	145622	145627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010117	TA	3	6	145646	145651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010117	GCA	2	6	145664	145669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010117	TCA	2	6	145793	145798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010117	TCA	2	6	145805	145810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010117	T	7	7	145876	145882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010117	AGA	2	6	145900	145905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010117	TGA	2	6	145951	145956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010117	TTTC	2	8	147757	147764	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_010117	TTG	2	6	147993	147998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010117	GAG	2	6	150094	150099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010117	CTG	2	6	150132	150137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010117	T	6	6	150141	150146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010117	AGG	2	6	150190	150195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010117	T	6	6	150239	150244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010117	ATG	2	6	151212	151217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010117	A	6	6	151225	151230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010117	A	6	6	153185	153190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010117	AAT	2	6	153276	153281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010117	T	6	6	154234	154239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010117	CAG	2	6	154244	154249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_010117	AGC	2	6	154255	154260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_010117	TAA	2	6	154279	154284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010117	CAAAAT	2	12	154382	154393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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917	NC_010117	GTGCCT	2	12	225027	225038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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930	NC_010117	TACAA	2	10	226415	226424	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
931	NC_010117	TTA	2	6	226427	226432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
932	NC_010117	TAA	2	6	226451	226456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_010117	ATT	2	6	227241	227246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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