MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010117	GCG	2	6	1691502	1691507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_010117	AAC	2	6	1693917	1693922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_010117	CGG	2	6	1695728	1695733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_010117	AGCGA	2	10	1695782	1695791	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8505	NC_010117	TCGCT	2	10	1695831	1695840	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8506	NC_010117	T	6	6	1695886	1695891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_010117	GTC	2	6	1696964	1696969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_010117	TC	3	6	1696999	1697004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8509	NC_010117	AACAC	2	10	1698519	1698528	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8510	NC_010117	GTC	2	6	1698547	1698552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_010117	TC	3	6	1700160	1700165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8512	NC_010117	GTT	2	6	1700199	1700204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_010117	T	6	6	1700269	1700274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_010117	CCA	2	6	1701170	1701175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8515	NC_010117	GTG	2	6	1701176	1701181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_010117	CGT	2	6	1701203	1701208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_010117	CTG	2	6	1701225	1701230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_010117	TAT	2	6	1701231	1701236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_010117	GAA	2	6	1701238	1701243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_010117	ACG	2	6	1701274	1701279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_010117	T	6	6	1701284	1701289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_010117	AAGTA	2	10	1701326	1701335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_010117	AGCGA	2	10	1701346	1701355	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8524	NC_010117	ATG	2	6	1701370	1701375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_010117	CTTTT	2	10	1701472	1701481	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8526	NC_010117	T	6	6	1701551	1701556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_010117	T	6	6	1701593	1701598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_010117	AAT	2	6	1701713	1701718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_010117	TA	4	8	1701820	1701827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_010117	ATA	2	6	1701936	1701941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_010117	ACT	2	6	1701987	1701992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_010117	T	6	6	1702009	1702014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_010117	CAG	2	6	1702040	1702045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_010117	TATCAA	2	12	1702051	1702062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8535	NC_010117	T	7	7	1702073	1702079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_010117	ATG	2	6	1702085	1702090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_010117	AAG	2	6	1702103	1702108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_010117	CGC	2	6	1702142	1702147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8539	NC_010117	CTT	2	6	1702220	1702225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_010117	AAG	2	6	1702297	1702302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_010117	CCT	2	6	1702315	1702320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8542	NC_010117	CAT	2	6	1702321	1702326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_010117	AAT	2	6	1702339	1702344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_010117	CAAAT	2	10	1702359	1702368	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8545	NC_010117	ATTTTA	2	12	1702407	1702418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_010117	C	6	6	1702431	1702436	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8547	NC_010117	T	6	6	1702439	1702444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_010117	ATG	2	6	1702512	1702517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_010117	ATT	2	6	1702543	1702548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_010117	CCT	2	6	1703046	1703051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_010117	TAA	2	6	1703084	1703089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_010117	TTTCTT	2	12	1703687	1703698	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8553	NC_010117	CGG	2	6	1703705	1703710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_010117	AAT	2	6	1703721	1703726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_010117	TTAA	2	8	1703740	1703747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_010117	T	6	6	1703767	1703772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_010117	GTA	2	6	1703794	1703799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_010117	ATTT	2	8	1703872	1703879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_010117	TTA	2	6	1703880	1703885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_010117	TC	3	6	1703904	1703909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8561	NC_010117	AGG	2	6	1703920	1703925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_010117	A	6	6	1703927	1703932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_010117	TAAC	2	8	1703934	1703941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8564	NC_010117	AAG	2	6	1704261	1704266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_010117	GCTT	2	8	1704277	1704284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8566	NC_010117	TAC	2	6	1704313	1704318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_010117	ATT	2	6	1704339	1704344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_010117	AAT	2	6	1704385	1704390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_010117	CAG	2	6	1704410	1704415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_010117	CAA	2	6	1704436	1704441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_010117	TGT	2	6	1704459	1704464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_010117	TGC	2	6	1704475	1704480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_010117	GAA	2	6	1704482	1704487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8575	NC_010117	ACA	2	6	1704550	1704555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_010117	A	6	6	1704626	1704631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_010117	A	6	6	1704647	1704652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_010117	AGA	2	6	1704673	1704678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_010117	A	7	7	1704686	1704692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_010117	ATTT	2	8	1704848	1704855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_010117	TCAT	2	8	1704865	1704872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8582	NC_010117	AGC	2	6	1704910	1704915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8585	NC_010117	GAAAT	2	10	1705017	1705026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_010117	ATT	2	6	1705063	1705068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_010117	AGA	2	6	1705078	1705083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_010117	A	6	6	1705094	1705099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_010117	GAA	2	6	1705106	1705111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8591	NC_010117	GTT	2	6	1705189	1705194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_010117	AGA	2	6	1705231	1705236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_010117	T	6	6	1707285	1707290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8595	NC_010117	T	6	6	1707511	1707516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_010117	A	6	6	1707517	1707522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_010117	A	8	8	1707546	1707553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_010117	ATTT	2	8	1707629	1707636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_010117	ATT	2	6	1707662	1707667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_010117	T	6	6	1707671	1707676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_010117	AAAT	2	8	1707679	1707686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_010117	TTA	2	6	1707704	1707709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_010117	A	6	6	1707721	1707726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_010117	TAAT	2	8	1707739	1707746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_010117	TAA	2	6	1707749	1707754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8607	NC_010117	CAA	2	6	1711553	1711558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_010117	TAT	2	6	1711636	1711641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_010117	A	6	6	1711844	1711849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8611	NC_010117	A	6	6	1711908	1711913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_010117	ATT	2	6	1711925	1711930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_010117	AAAT	2	8	1712037	1712044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_010117	TCG	2	6	1712053	1712058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_010117	GGA	2	6	1712088	1712093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_010117	ATA	2	6	1712123	1712128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_010117	GAC	2	6	1712143	1712148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_010117	CGG	2	6	1712170	1712175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_010117	CGA	2	6	1712197	1712202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_010117	TA	3	6	1712335	1712340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_010117	CGCC	2	8	1712344	1712351	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8622	NC_010117	A	6	6	1712363	1712368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_010117	AAT	2	6	1712541	1712546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8629	NC_010117	T	6	6	1712812	1712817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_010117	T	6	6	1712843	1712848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_010117	AAC	2	6	1712926	1712931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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