MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_010117	CAGT	2	8	1496150	1496157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7502	NC_010117	CTG	2	6	1496199	1496204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_010117	CCT	2	6	1496255	1496260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7504	NC_010117	AGCC	2	8	1496317	1496324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7505	NC_010117	AAAAT	2	10	1496336	1496345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_010117	GCT	2	6	1496377	1496382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_010117	AG	3	6	1496451	1496456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_010117	CT	3	6	1496512	1496517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7509	NC_010117	CTG	2	6	1496535	1496540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_010117	TAC	2	6	1496541	1496546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_010117	GTT	2	6	1496614	1496619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_010117	AAC	2	6	1496698	1496703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_010117	ACA	2	6	1496720	1496725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_010117	A	6	6	1496788	1496793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_010117	T	6	6	1496893	1496898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_010117	TAA	2	6	1496982	1496987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_010117	A	6	6	1496986	1496991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_010117	GAT	2	6	1497023	1497028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_010117	A	7	7	1497046	1497052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_010117	CTT	2	6	1497060	1497065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_010117	GCT	2	6	1497140	1497145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_010117	CTT	2	6	1497155	1497160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_010117	CG	3	6	1497168	1497173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7524	NC_010117	TTA	2	6	1497242	1497247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_010117	CTG	2	6	1497294	1497299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_010117	GCC	2	6	1497381	1497386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7527	NC_010117	TGA	2	6	1497474	1497479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_010117	CA	3	6	1497516	1497521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7529	NC_010117	GTAA	2	8	1497532	1497539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_010117	A	6	6	1497538	1497543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_010117	CAAA	2	8	1497546	1497553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7532	NC_010117	ATA	2	6	1497755	1497760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_010117	ATT	2	6	1497783	1497788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_010117	TAA	2	6	1497929	1497934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_010117	TAA	2	6	1498020	1498025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_010117	ATC	2	6	1498064	1498069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_010117	CAAA	2	8	1498114	1498121	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7538	NC_010117	CACT	2	8	1498209	1498216	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7539	NC_010117	T	6	6	1498216	1498221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_010117	TTC	2	6	1498223	1498228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_010117	T	7	7	1498239	1498245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_010117	CTGA	2	8	1498276	1498283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7543	NC_010117	CAT	2	6	1498292	1498297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_010117	TCGCT	2	10	1498530	1498539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7545	NC_010117	TGT	2	6	1498694	1498699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_010117	ACC	2	6	1498833	1498838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7547	NC_010117	AGA	2	6	1499023	1499028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_010117	AAC	2	6	1499498	1499503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_010117	A	6	6	1499530	1499535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_010117	AAT	2	6	1499617	1499622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_010117	TAATT	2	10	1501877	1501886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_010117	A	8	8	1501893	1501900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_010117	TTAA	2	8	1501903	1501910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_010117	A	6	6	1501919	1501924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_010117	CGC	2	6	1506770	1506775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7556	NC_010117	TTC	2	6	1506805	1506810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_010117	ACTT	2	8	1507945	1507952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7558	NC_010117	ATAA	2	8	1508003	1508010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_010117	ATTTA	2	10	1508087	1508096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_010117	TTC	2	6	1508151	1508156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_010117	TTG	2	6	1508161	1508166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_010117	CAACC	2	10	1508180	1508189	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7563	NC_010117	AGT	2	6	1508195	1508200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_010117	CG	3	6	1508210	1508215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7565	NC_010117	TAA	2	6	1508225	1508230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_010117	CTT	2	6	1508244	1508249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_010117	ATC	2	6	1508268	1508273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_010117	ATA	2	6	1508287	1508292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_010117	TTTAA	2	10	1508311	1508320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_010117	TAC	2	6	1508347	1508352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_010117	CTC	2	6	1508383	1508388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7572	NC_010117	GAC	2	6	1508398	1508403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_010117	AGA	2	6	1511662	1511667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_010117	AGA	2	6	1511669	1511674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_010117	TG	3	6	1511682	1511687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_010117	AATT	2	8	1511698	1511705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_010117	T	7	7	1513091	1513097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_010117	GGGT	2	8	1513143	1513150	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_010117	A	6	6	1514120	1514125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_010117	TAA	2	6	1514138	1514143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_010117	ATCA	2	8	1514158	1514165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7582	NC_010117	AAC	2	6	1514198	1514203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_010117	GAAGC	2	10	1514787	1514796	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7584	NC_010117	CAT	2	6	1514812	1514817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_010117	TCGCT	2	10	1514831	1514840	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7586	NC_010117	GAG	2	6	1514856	1514861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_010117	AAG	2	6	1515889	1515894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_010117	A	7	7	1515910	1515916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_010117	GCG	2	6	1515958	1515963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_010117	TAA	2	6	1515973	1515978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_010117	AGA	2	6	1515996	1516001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_010117	TTA	2	6	1516027	1516032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_010117	CCAT	2	8	1516060	1516067	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7594	NC_010117	A	7	7	1516081	1516087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_010117	CTTT	2	8	1516207	1516214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7596	NC_010117	GGC	2	6	1516225	1516230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7597	NC_010117	TGAT	2	8	1516263	1516270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_010117	GCT	2	6	1516363	1516368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_010117	TAA	2	6	1516431	1516436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_010117	AAT	2	6	1516459	1516464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_010117	TC	3	6	1516529	1516534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7602	NC_010117	CGT	2	6	1516563	1516568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_010117	ATT	2	6	1516616	1516621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_010117	CG	3	6	1516664	1516669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7605	NC_010117	TAA	3	9	1516713	1516721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_010117	TAA	2	6	1516769	1516774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_010117	AAG	2	6	1516828	1516833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_010117	AAAT	2	8	1516867	1516874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_010117	AATT	2	8	1516936	1516943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_010117	TCT	2	6	1516981	1516986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_010117	TAT	2	6	1519187	1519192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_010117	CAT	2	6	1519195	1519200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_010117	A	7	7	1520610	1520616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_010117	CCAC	2	8	1520666	1520673	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7615	NC_010117	CTA	2	6	1520778	1520783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_010117	TTG	2	6	1520798	1520803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_010117	ATC	2	6	1520812	1520817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7618	NC_010117	TGA	2	6	1520819	1520824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_010117	AGC	2	6	1520842	1520847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7620	NC_010117	A	9	9	1520882	1520890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_010117	TCA	2	6	1521050	1521055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_010117	TTCT	2	8	1521069	1521076	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7623	NC_010117	ATA	2	6	1521111	1521116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_010117	GTG	2	6	1521141	1521146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_010117	ATT	2	6	1521206	1521211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_010117	TTTC	2	8	1521237	1521244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7627	NC_010117	CAT	2	6	1521280	1521285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_010117	TAT	2	6	1524318	1524323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_010117	GA	3	6	1524393	1524398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_010117	TTC	2	6	1526010	1526015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7631	NC_010117	TTG	2	6	1526020	1526025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7633	NC_010117	GAAA	2	8	1526149	1526156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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