MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 9824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_010117	TGAT	2	8	1418468	1418475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_010117	AGGGG	3	15	1418515	1418529	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_010117	A	6	6	1418583	1418588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_010117	A	6	6	1418613	1418618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_010117	TTGT	2	8	1418629	1418636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_010117	AAAAT	2	10	1418671	1418680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_010117	A	6	6	1418781	1418786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_010117	ATT	2	6	1418913	1418918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_010117	GC	3	6	1418925	1418930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_010117	ATA	2	6	1418956	1418961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_010117	CTT	2	6	1419021	1419026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_010117	TTAA	2	8	1419060	1419067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_010117	TGT	2	6	1419113	1419118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_010117	T	6	6	1419885	1419890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_010117	ATTTC	2	10	1419979	1419988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7016	NC_010117	TCT	2	6	1419996	1420001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_010117	TAA	2	6	1420099	1420104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_010117	ACA	2	6	1420113	1420118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_010117	CGG	2	6	1420139	1420144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_010117	CTA	2	6	1420165	1420170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_010117	ATA	2	6	1420176	1420181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_010117	TG	3	6	1420192	1420197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_010117	AAT	2	6	1420243	1420248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_010117	T	7	7	1420248	1420254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_010117	TAA	2	6	1420349	1420354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_010117	GAT	2	6	1420385	1420390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_010117	A	6	6	1420407	1420412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_010117	A	6	6	1420478	1420483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_010117	GGT	2	6	1420484	1420489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_010117	AGG	2	6	1420514	1420519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_010117	C	6	6	1420599	1420604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7032	NC_010117	ATG	2	6	1420736	1420741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_010117	AAT	2	6	1420759	1420764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_010117	CCA	2	6	1420780	1420785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7035	NC_010117	ATTTT	2	10	1420857	1420866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_010117	T	6	6	1420870	1420875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_010117	TGC	2	6	1420905	1420910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_010117	GGC	2	6	1420979	1420984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_010117	TCAA	2	8	1421019	1421026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7040	NC_010117	A	6	6	1421025	1421030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_010117	TGT	2	6	1421054	1421059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_010117	T	6	6	1421059	1421064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_010117	GGC	2	6	1421069	1421074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_010117	T	6	6	1421113	1421118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_010117	GCA	2	6	1421145	1421150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_010117	CAC	2	6	1421269	1421274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7047	NC_010117	CTT	2	6	1421323	1421328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_010117	GT	3	6	1421385	1421390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_010117	AAT	2	6	1421521	1421526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_010117	ATA	2	6	1421552	1421557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_010117	TGT	2	6	1421592	1421597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_010117	AGCA	2	8	1421603	1421610	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7053	NC_010117	AATTC	2	10	1421664	1421673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7054	NC_010117	CAGC	2	8	1421735	1421742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7055	NC_010117	TA	3	6	1421761	1421766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_010117	T	6	6	1421777	1421782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_010117	CGG	2	6	1421971	1421976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_010117	AACCAT	2	12	1422034	1422045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_010117	TTA	2	6	1422046	1422051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_010117	T	6	6	1422073	1422078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_010117	ACT	2	6	1422096	1422101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_010117	C	6	6	1422105	1422110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7063	NC_010117	AAT	2	6	1422119	1422124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_010117	GTT	2	6	1422133	1422138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_010117	TTG	2	6	1422182	1422187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_010117	ATA	2	6	1422213	1422218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_010117	CGT	2	6	1422428	1422433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_010117	GTAG	2	8	1422476	1422483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_010117	GCG	2	6	1422538	1422543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_010117	T	6	6	1422573	1422578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_010117	AAT	2	6	1422594	1422599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_010117	T	6	6	1422772	1422777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_010117	ATTG	2	8	1422784	1422791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_010117	ATA	2	6	1422797	1422802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_010117	TTC	2	6	1422830	1422835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_010117	TTC	2	6	1422848	1422853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_010117	TC	3	6	1422924	1422929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7078	NC_010117	CGGT	2	8	1422939	1422946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7079	NC_010117	T	7	7	1422976	1422982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_010117	TAA	2	6	1423039	1423044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_010117	AAAT	2	8	1423045	1423052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_010117	TCC	2	6	1423055	1423060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7083	NC_010117	AAT	2	6	1423088	1423093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_010117	TA	3	6	1423101	1423106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_010117	AT	3	6	1423173	1423178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_010117	GAT	2	6	1423185	1423190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_010117	TCT	2	6	1423229	1423234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_010117	GCT	2	6	1423338	1423343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_010117	CAA	2	6	1423408	1423413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_010117	A	6	6	1423535	1423540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_010117	TTTTC	2	10	1423643	1423652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7092	NC_010117	A	6	6	1424299	1424304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_010117	ATT	2	6	1424347	1424352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_010117	AAT	2	6	1424359	1424364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_010117	AAG	2	6	1424454	1424459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_010117	TAA	2	6	1427528	1427533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_010117	ATT	2	6	1427551	1427556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_010117	T	7	7	1427562	1427568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_010117	C	6	6	1427632	1427637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7100	NC_010117	GGC	2	6	1427667	1427672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_010117	CAG	2	6	1427679	1427684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_010117	GCCG	2	8	1427686	1427693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7103	NC_010117	TTTC	2	8	1428925	1428932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7104	NC_010117	AAG	2	6	1435110	1435115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_010117	CAG	2	6	1435150	1435155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_010117	TTC	2	6	1435232	1435237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_010117	GAC	2	6	1435255	1435260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_010117	T	6	6	1435265	1435270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_010117	TTTAG	2	10	1435453	1435462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_010117	AT	3	6	1435486	1435491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_010117	ATA	2	6	1435580	1435585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_010117	AC	3	6	1435598	1435603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7113	NC_010117	ATT	2	6	1435604	1435609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_010117	T	6	6	1435633	1435638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_010117	AAT	2	6	1435675	1435680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_010117	AGT	2	6	1435705	1435710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_010117	AGCGA	2	10	1435718	1435727	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7118	NC_010117	ATG	2	6	1435741	1435746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_010117	TCGCT	2	10	1435767	1435776	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7120	NC_010117	TTACT	2	10	1435785	1435794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7121	NC_010117	ACC	2	6	1435803	1435808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7122	NC_010117	TTC	2	6	1435850	1435855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_010117	CTG	2	6	1435906	1435911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_010117	TCT	2	6	1435917	1435922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_010117	GAA	2	6	1435941	1435946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_010117	AATT	2	8	1436039	1436046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_010117	CCA	2	6	1436052	1436057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_010117	ATT	2	6	1436070	1436075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_010117	AAT	2	6	1436148	1436153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_010117	T	6	6	1436182	1436187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_010117	AAATT	2	10	1436223	1436232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_010117	GTA	2	6	1436352	1436357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_010117	AGC	2	6	1436378	1436383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7134	NC_010117	A	7	7	1436387	1436393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7135	NC_010117	ATT	2	6	1436441	1436446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7138	NC_010117	T	7	7	1436576	1436582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7142	NC_010117	T	7	7	1436719	1436725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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