MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 8741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009727	TTTCT	2	10	53	62	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009727	G	6	6	1628	1633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009727	TAGA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009727	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009727	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009727	A	7	7	4032	4038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009727	A	7	7	4078	4084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009727	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009727	ACCC	2	8	6711	6718	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_009727	A	7	7	6764	6770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009727	TG	3	6	6834	6839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009727	TGA	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009727	GTAT	2	8	6891	6898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009727	GTG	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009727	GGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009727	GCA	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009727	AAC	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009727	GTT	2	6	7206	7211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009727	GTG	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009727	AGCG	2	8	7278	7285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009727	TTGT	2	8	7326	7333	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009727	TTG	2	6	7342	7347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009727	GAG	2	6	7375	7380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009727	GGGT	2	8	7439	7446	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009727	GTG	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009727	TCA	2	6	7487	7492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009727	ACA	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009727	AGG	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009727	TGT	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009727	A	6	6	7649	7654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009727	GAAT	2	8	7705	7712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009727	TG	3	6	7719	7724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009727	AGCGA	2	10	8078	8087	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009727	ATG	2	6	8102	8107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009727	TCGCT	2	10	8128	8137	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009727	TAGC	2	8	8151	8158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009727	TCC	2	6	12081	12086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009727	ACC	2	6	12149	12154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009727	CGT	2	6	12156	12161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009727	A	6	6	12234	12239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009727	TTTTC	2	10	12251	12260	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009727	T	6	6	12264	12269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009727	A	7	7	12314	12320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009727	CTT	2	6	12321	12326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009727	TAA	2	6	12362	12367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009727	ATC	2	6	12390	12395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009727	CAC	2	6	12426	12431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009727	TTC	2	6	12533	12538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009727	GGA	2	6	12552	12557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009727	ATT	2	6	12628	12633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009727	A	6	6	12671	12676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009727	TCT	2	6	12787	12792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009727	GGGC	2	8	12810	12817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009727	TACA	2	8	12870	12877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009727	ACA	2	6	12915	12920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009727	G	6	6	12995	13000	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009727	TGC	2	6	13005	13010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009727	GCT	2	6	13092	13097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009727	ATT	2	6	13104	13109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009727	ATTC	2	8	13118	13125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009727	GAA	2	6	13156	13161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009727	CTG	2	6	13249	13254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009727	GAA	2	6	13315	13320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009727	CAA	2	6	13325	13330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009727	TCTA	2	8	13331	13338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009727	GGA	2	6	13350	13355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009727	AGC	2	6	13386	13391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009727	TGC	2	6	13409	13414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009727	AAC	2	6	13482	13487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009727	TGC	2	6	13565	13570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009727	T	6	6	13593	13598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009727	AAG	2	6	13641	13646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009727	TTCT	2	8	13649	13656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009727	ACC	2	6	13716	13721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009727	TCT	2	6	13758	13763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009727	A	6	6	13809	13814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009727	CTC	2	6	13878	13883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009727	T	6	6	13919	13924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009727	TCC	2	6	13946	13951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009727	ATA	2	6	14029	14034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009727	TCAA	2	8	14072	14079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009727	ATT	2	6	14097	14102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009727	A	6	6	14153	14158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009727	ACT	2	6	14185	14190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009727	ACT	2	6	14297	14302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009727	AATT	2	8	14334	14341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009727	TCT	2	6	14376	14381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009727	T	7	7	14402	14408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009727	ATG	2	6	14442	14447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009727	TCA	2	6	14497	14502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009727	CTT	2	6	14522	14527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009727	TTCG	2	8	14536	14543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009727	A	6	6	14545	14550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009727	AAT	2	6	14585	14590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009727	A	7	7	14669	14675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009727	GC	3	6	14699	14704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009727	GTA	2	6	14711	14716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009727	ATG	2	6	14733	14738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009727	TTC	2	6	14744	14749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009727	TCGCG	2	10	14779	14788	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009727	GGA	2	6	14911	14916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009727	GAAA	2	8	14967	14974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009727	GAT	2	6	15031	15036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009727	CATT	2	8	15124	15131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009727	TGG	2	6	15158	15163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009727	GAT	2	6	15233	15238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009727	T	8	8	15263	15270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009727	GTT	2	6	15317	15322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009727	GGT	2	6	15341	15346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009727	CCA	2	6	15493	15498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009727	CCTGTA	2	12	17972	17983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009727	AACT	2	8	17990	17997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009727	ATA	3	9	18054	18062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009727	TAT	3	9	19242	19250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009727	TAA	2	6	19277	19282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009727	TCAA	2	8	19322	19329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009727	TATT	2	8	19375	19382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009727	TAG	2	6	19480	19485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009727	TA	3	6	19629	19634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009727	AGG	2	6	19653	19658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009727	CTG	2	6	19695	19700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009727	A	6	6	19723	19728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009727	T	6	6	19742	19747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009727	AAC	2	6	19770	19775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009727	ATT	3	9	19784	19792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009727	GTT	2	6	19915	19920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009727	TTTA	2	8	19921	19928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009727	GCC	2	6	19949	19954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009727	AAT	2	6	19964	19969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009727	T	6	6	20019	20024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009727	GAA	2	6	20063	20068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009727	GAG	2	6	20084	20089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009727	T	7	7	20122	20128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009727	AAC	2	6	20150	20155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009727	CAAC	2	8	20316	20323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009727	TTAT	2	8	20344	20351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009727	GAA	2	6	20368	20373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009727	AT	3	6	20377	20382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009727	ATC	2	6	20466	20471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009727	CTT	2	6	20481	20486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009727	AAT	2	6	20509	20514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009727	AATTTG	2	12	20591	20602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009727	CA	3	6	20608	20613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009727	ATC	2	6	20615	20620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009727	T	9	9	20625	20633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009727	AATA	2	8	20652	20659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009727	TGA	2	6	20699	20704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009727	TGC	2	6	20732	20737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009727	TTG	2	6	20746	20751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009727	ACT	2	6	20904	20909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_009727	TGA	2	6	21616	21621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_009727	AGCGA	2	10	62426	62435	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_009727	ATG	2	6	62450	62455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009727	TCGCT	2	10	62476	62485	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
291	NC_009727	TGTC	2	8	62530	62537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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