MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 chromosome

Total Repeats: 23585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_009495	TC	3	6	3862400	3862405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23502	NC_009495	ATTA	2	8	3862430	3862437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23503	NC_009495	T	6	6	3862450	3862455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23504	NC_009495	CTT	2	6	3862465	3862470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23505	NC_009495	ATA	2	6	3862473	3862478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23506	NC_009495	TA	3	6	3862485	3862490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23507	NC_009495	TAA	2	6	3862509	3862514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23508	NC_009495	TAT	2	6	3862537	3862542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23509	NC_009495	AATATA	2	12	3862548	3862559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23510	NC_009495	AAAT	2	8	3862566	3862573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23511	NC_009495	A	6	6	3862591	3862596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23512	NC_009495	AAAT	2	8	3862610	3862617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23513	NC_009495	TC	3	6	3863980	3863985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23514	NC_009495	TCC	2	6	3869371	3869376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23515	NC_009495	ACA	2	6	3869696	3869701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23516	NC_009495	T	6	6	3869711	3869716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23517	NC_009495	TAC	2	6	3869723	3869728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23518	NC_009495	AAT	2	6	3869757	3869762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23519	NC_009495	A	7	7	3869795	3869801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23520	NC_009495	TAG	2	6	3869814	3869819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23521	NC_009495	CCT	2	6	3870093	3870098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23522	NC_009495	ACC	2	6	3870557	3870562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23523	NC_009495	CCT	2	6	3870859	3870864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23524	NC_009495	CAG	2	6	3870893	3870898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23525	NC_009495	AAT	2	6	3870917	3870922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23526	NC_009495	TAT	2	6	3870937	3870942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23527	NC_009495	TTA	2	6	3872116	3872121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23528	NC_009495	CTA	2	6	3872187	3872192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23529	NC_009495	CAT	2	6	3872216	3872221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23530	NC_009495	AT	4	8	3872234	3872241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23531	NC_009495	AT	4	8	3872279	3872286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23532	NC_009495	TTTA	2	8	3872311	3872318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23533	NC_009495	A	7	7	3872323	3872329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23534	NC_009495	TAA	2	6	3872355	3872360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23535	NC_009495	A	7	7	3872359	3872365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23536	NC_009495	TC	3	6	3872582	3872587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23537	NC_009495	TTATTC	2	12	3873732	3873743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23538	NC_009495	ACA	2	6	3873773	3873778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23539	NC_009495	TA	3	6	3873787	3873792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23540	NC_009495	TA	4	8	3873808	3873815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23541	NC_009495	ATT	2	6	3873846	3873851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23542	NC_009495	ATTT	2	8	3873866	3873873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23543	NC_009495	AT	3	6	3873876	3873881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23544	NC_009495	AGG	2	6	3876171	3876176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23545	NC_009495	T	7	7	3876177	3876183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23546	NC_009495	ATT	2	6	3877037	3877042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23547	NC_009495	TCC	2	6	3877583	3877588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23548	NC_009495	TCC	2	6	3878468	3878473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23549	NC_009495	CAC	2	6	3879246	3879251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23550	NC_009495	TAAT	2	8	3879253	3879260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23551	NC_009495	TA	3	6	3879276	3879281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23552	NC_009495	AAT	2	6	3879293	3879298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23553	NC_009495	TTA	2	6	3879319	3879324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23554	NC_009495	TAA	2	6	3879330	3879335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23555	NC_009495	A	6	6	3879334	3879339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23556	NC_009495	TAG	2	6	3879340	3879345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23557	NC_009495	TCT	2	6	3880185	3880190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23558	NC_009495	CTT	2	6	3880206	3880211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23559	NC_009495	T	7	7	3880210	3880216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23560	NC_009495	ATT	2	6	3880217	3880222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23561	NC_009495	T	7	7	3880221	3880227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23562	NC_009495	ATT	2	6	3880236	3880241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23563	NC_009495	ATA	2	6	3884288	3884293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23564	NC_009495	AAAG	2	8	3884297	3884304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23565	NC_009495	CCT	2	6	3885615	3885620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23566	NC_009495	T	6	6	3886187	3886192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23567	NC_009495	CCT	2	6	3886372	3886377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23568	NC_009495	AAT	2	6	3886392	3886397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23569	NC_009495	T	6	6	3886406	3886411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23570	NC_009495	TA	3	6	3886476	3886481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23571	NC_009495	T	7	7	3886533	3886539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23572	NC_009495	CTT	2	6	3886548	3886553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23573	NC_009495	TA	3	6	3886561	3886566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23574	NC_009495	ATT	3	9	3886576	3886584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23575	NC_009495	T	7	7	3886668	3886674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23576	NC_009495	T	9	9	3886734	3886742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23577	NC_009495	T	7	7	3886744	3886750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23578	NC_009495	TAA	2	6	3886755	3886760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23579	NC_009495	TA	3	6	3886777	3886782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23580	NC_009495	T	7	7	3886807	3886813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23581	NC_009495	CAA	2	6	3886814	3886819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23582	NC_009495	ATAA	2	8	3886833	3886840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23583	NC_009495	TA	3	6	3886843	3886848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23584	NC_009495	GTT	2	6	3886851	3886856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23585	NC_009495	GGA	2	6	3886904	3886909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.