MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009480	GCA	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009480	ACC	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009480	CT	3	6	1511	1516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009480	ACG	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009480	CGGC	3	12	1562	1573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009480	TCC	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009480	GA	3	6	1598	1603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009480	CCG	2	6	1622	1627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009480	CCG	2	6	1668	1673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009480	CGT	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009480	CGC	2	6	1721	1726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009480	CCG	2	6	1734	1739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009480	GA	3	6	3142	3147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009480	AG	3	6	5819	5824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009480	CTA	2	6	5834	5839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009480	GAC	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009480	ATC	2	6	5889	5894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009480	CCG	2	6	5912	5917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009480	CCA	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009480	GCG	2	6	8012	8017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009480	CCG	2	6	8035	8040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009480	CCA	2	6	11293	11298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009480	ATCGC	2	10	11350	11359	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009480	AGG	2	6	11419	11424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009480	CGT	2	6	11461	11466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009480	CTTCC	2	10	11504	11513	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_009480	CGA	2	6	11530	11535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009480	CTCG	2	8	11536	11543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009480	ACG	2	6	11562	11567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009480	TCG	2	6	11599	11604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009480	GCGGT	2	10	11608	11617	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009480	ACG	2	6	12313	12318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009480	CCG	2	6	12331	12336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009480	GC	3	6	13784	13789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009480	GCG	2	6	13803	13808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009480	TCG	2	6	13812	13817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009480	CCG	2	6	13821	13826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009480	G	6	6	13918	13923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009480	CGG	2	6	14014	14019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009480	TG	3	6	14043	14048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009480	AGA	2	6	14111	14116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009480	CTC	2	6	14423	14428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009480	CCGGG	2	10	14431	14440	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009480	GGC	2	6	14469	14474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009480	CCGGT	2	10	15339	15348	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009480	TGC	2	6	15375	15380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009480	CGG	2	6	16111	16116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009480	CGC	2	6	16120	16125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009480	CTGG	2	8	16155	16162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009480	TCG	2	6	16168	16173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009480	GCG	2	6	16185	16190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009480	GT	3	6	16200	16205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009480	TCG	2	6	17977	17982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009480	GGGC	2	8	18058	18065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009480	CGC	3	9	18070	18078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009480	CG	3	6	25437	25442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009480	GCC	2	6	25488	25493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009480	GTC	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009480	CGG	2	6	25544	25549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009480	CGC	2	6	25574	25579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_009480	GTC	2	6	25610	25615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009480	GT	3	6	25663	25668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009480	C	6	6	25693	25698	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_009480	TCC	2	6	25776	25781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009480	CGG	2	6	25795	25800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009480	GC	3	6	25851	25856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009480	GTC	2	6	29961	29966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009480	CG	3	6	29987	29992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009480	CGGCG	2	10	31268	31277	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009480	GCC	2	6	31284	31289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009480	GC	4	8	31320	31327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009480	ACCGC	2	10	31374	31383	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_009480	CAC	2	6	31399	31404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009480	GATGCA	2	12	33446	33457	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009480	CGG	2	6	33614	33619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009480	CGG	2	6	33646	33651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009480	CCT	2	6	35730	35735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009480	GCG	2	6	35736	35741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009480	GTC	2	6	35747	35752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009480	CG	3	6	35786	35791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009480	CGG	2	6	36236	36241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009480	CG	3	6	36250	36255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009480	TC	3	6	37969	37974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009480	GTC	2	6	37975	37980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009480	GCC	2	6	37989	37994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009480	GT	3	6	38073	38078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009480	GTC	2	6	38087	38092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009480	AGCCA	2	10	38244	38253	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_009480	TGC	2	6	38300	38305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009480	TCT	2	6	38320	38325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009480	CCG	3	9	38326	38334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009480	ACA	2	6	38468	38473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009480	GGA	2	6	38495	38500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009480	GGC	2	6	38527	38532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009480	CTA	2	6	38622	38627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009480	CGA	2	6	38684	38689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009480	GAGT	2	8	38755	38762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009480	GTT	2	6	38823	38828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009480	TGC	3	9	38951	38959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009480	TCGA	2	8	39033	39040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009480	CAAATG	2	12	39048	39059	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009480	TGT	2	6	39077	39082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009480	GCG	2	6	39105	39110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009480	GCG	2	6	39129	39134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009480	AAG	2	6	39307	39312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009480	GGC	2	6	39323	39328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009480	GTT	2	6	39360	39365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009480	TGC	2	6	39410	39415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009480	CGC	2	6	39462	39467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009480	GAA	2	6	39498	39503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009480	CAG	2	6	39543	39548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009480	TGGT	2	8	39552	39559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009480	A	6	6	39643	39648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009480	GCT	2	6	39663	39668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009480	CGT	3	9	39776	39784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009480	CTT	2	6	39808	39813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009480	GCG	2	6	39835	39840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009480	GCCG	2	8	39862	39869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009480	ACC	2	6	39919	39924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009480	CGT	2	6	39986	39991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009480	CGG	2	6	39998	40003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009480	CCA	2	6	40025	40030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009480	CCT	2	6	40035	40040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009480	CTC	2	6	42067	42072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009480	CCA	2	6	42077	42082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009480	TCT	2	6	43236	43241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009480	C	6	6	43311	43316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_009480	CGC	2	6	43324	43329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009480	GGTGAC	2	12	43381	43392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_009480	CG	3	6	43438	43443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009480	GCC	3	9	43623	43631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009480	TGG	2	6	43660	43665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009480	AGC	2	6	43673	43678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009480	TGC	2	6	43700	43705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009480	GAG	2	6	43722	43727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009480	TGA	2	6	43753	43758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009480	CG	3	6	43798	43803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009480	GTC	2	6	43813	43818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009480	GCG	2	6	43867	43872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009480	AGC	2	6	43908	43913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009480	CGA	2	6	43959	43964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009480	GAAG	2	8	43969	43976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009480	AC	3	6	43985	43990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009480	CCT	2	6	43995	44000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_009480	TCA	2	6	44022	44027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009480	CGT	2	6	44115	44120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009480	CGT	2	6	44154	44159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009480	GAT	2	6	44284	44289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009480	GCG	2	6	44299	44304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_009480	GAC	2	6	44410	44415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_009480	CACG	2	8	44632	44639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_009480	GAC	2	6	44662	44667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_009480	CG	3	6	44970	44975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_009480	TCA	2	6	45011	45016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_009480	GCT	2	6	45045	45050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_009480	ACC	2	6	46412	46417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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273	NC_009480	CGT	2	6	56046	56051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_009480	TCG	2	6	56200	56205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_009480	GCAAT	2	10	56248	56257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_009480	CGA	2	6	56307	56312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_009480	ACG	2	6	56319	56324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_009480	TGC	2	6	56336	56341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_009480	TCG	2	6	56372	56377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_009480	CG	4	8	56403	56410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_009480	AC	3	6	56483	56488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_009480	G	7	7	56572	56578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_009480	GCCG	2	8	56674	56681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
286	NC_009480	CCG	2	6	56694	56699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_009480	GACA	2	8	56709	56716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
288	NC_009480	GA	3	6	56717	56722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009480	GC	3	6	56761	56766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
290	NC_009480	C	7	7	56807	56813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
291	NC_009480	TGG	2	6	56847	56852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_009480	C	6	6	65037	65042	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
421	NC_009480	GC	3	6	65055	65060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
422	NC_009480	CAG	2	6	65068	65073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_009480	GCCC	2	8	65100	65107	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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425	NC_009480	ACG	2	6	65147	65152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_009480	CGA	2	6	65181	65186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_009480	GGC	2	6	65271	65276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_009480	GTA	2	6	65290	65295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_009480	TCG	2	6	65405	65410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_009480	GC	3	6	65434	65439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
431	NC_009480	CGG	2	6	65442	65447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_009480	CGGC	2	8	65450	65457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
433	NC_009480	CTC	2	6	65577	65582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_009480	TCA	2	6	65593	65598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_009480	GCC	2	6	65612	65617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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437	NC_009480	CGC	2	6	67580	67585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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439	NC_009480	CGT	2	6	67670	67675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_009480	CGC	2	6	67716	67721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_009480	AGT	3	9	67728	67736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_009480	CTT	2	6	67745	67750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_009480	GC	3	6	67765	67770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
444	NC_009480	TGCCC	2	10	67798	67807	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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450	NC_009480	TTA	2	6	69065	69070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_009480	GGT	2	6	69937	69942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
452	NC_009480	CGT	2	6	70014	70019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_009480	GCC	3	9	70182	70190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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459	NC_009480	TGA	2	6	70253	70258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_009480	TCG	2	6	70364	70369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_009480	CGC	3	9	70372	70380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
463	NC_009480	CGG	3	9	70420	70428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_009480	CGC	3	9	70522	70530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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491	NC_009480	GC	4	8	72465	72472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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