MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009480	CG	3	6	1207334	1207339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_009480	CCG	2	6	1208197	1208202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_009480	GAG	2	6	1208218	1208223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_009480	TCC	2	6	1209002	1209007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_009480	GC	3	6	1209046	1209051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_009480	GGCCC	2	10	1209052	1209061	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4007	NC_009480	TCG	2	6	1209117	1209122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_009480	GCG	2	6	1209123	1209128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_009480	CG	3	6	1209134	1209139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_009480	CGG	2	6	1209146	1209151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_009480	TCG	2	6	1209152	1209157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_009480	GCCC	2	8	1209167	1209174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4013	NC_009480	ACG	2	6	1212075	1212080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_009480	GC	3	6	1212085	1212090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_009480	GC	3	6	1212103	1212108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_009480	TCG	2	6	1212112	1212117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_009480	GGA	2	6	1212131	1212136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009480	CGA	2	6	1212137	1212142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_009480	C	6	6	1212758	1212763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4020	NC_009480	AAGG	2	8	1212858	1212865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_009480	TCC	2	6	1212892	1212897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_009480	CTCC	2	8	1212909	1212916	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4023	NC_009480	GCA	2	6	1213559	1213564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_009480	CG	3	6	1213574	1213579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_009480	CG	3	6	1213587	1213592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_009480	CCTC	2	8	1214259	1214266	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4027	NC_009480	GGA	2	6	1214290	1214295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_009480	CGT	2	6	1214311	1214316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_009480	CTCG	2	8	1214336	1214343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_009480	GCG	2	6	1214354	1214359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_009480	CGA	2	6	1214382	1214387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_009480	CGC	2	6	1214413	1214418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_009480	CGA	2	6	1214458	1214463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_009480	GC	3	6	1214469	1214474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_009480	CGAG	2	8	1214493	1214500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_009480	GAG	2	6	1214573	1214578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009480	CTG	2	6	1214579	1214584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_009480	CG	3	6	1214621	1214626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_009480	CGC	2	6	1214635	1214640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_009480	TCGGC	2	10	1214755	1214764	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4041	NC_009480	CTC	2	6	1214785	1214790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_009480	CGCA	2	8	1214810	1214817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_009480	CG	3	6	1214877	1214882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_009480	AGG	2	6	1214904	1214909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_009480	GAC	2	6	1214915	1214920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_009480	GAC	2	6	1217387	1217392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_009480	GGC	2	6	1217412	1217417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_009480	TCG	2	6	1217425	1217430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_009480	GTG	2	6	1217431	1217436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_009480	CGT	2	6	1217437	1217442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_009480	CTC	2	6	1217706	1217711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_009480	G	6	6	1217750	1217755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_009480	CTC	2	6	1217802	1217807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_009480	CAC	2	6	1217863	1217868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_009480	GAAC	2	8	1217874	1217881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_009480	TCG	2	6	1217895	1217900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_009480	ATCA	2	8	1217914	1217921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_009480	G	6	6	1218887	1218892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_009480	CG	3	6	1218929	1218934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_009480	CCG	2	6	1218975	1218980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_009480	GTG	2	6	1218986	1218991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_009480	TC	3	6	1219001	1219006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_009480	CAC	2	6	1219111	1219116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_009480	AGC	2	6	1219131	1219136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_009480	GA	3	6	1219188	1219193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_009480	CGG	2	6	1219238	1219243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_009480	CAC	2	6	1219270	1219275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_009480	TGCGCG	2	12	1219333	1219344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_009480	CCT	2	6	1219885	1219890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_009480	GCA	2	6	1219908	1219913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_009480	CCG	2	6	1219914	1219919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_009480	CGA	2	6	1219933	1219938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_009480	TCCG	2	8	1220244	1220251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_009480	CCT	3	9	1220280	1220288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_009480	CGT	2	6	1220300	1220305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_009480	CGG	3	9	1220327	1220335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_009480	GCC	2	6	1221721	1221726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_009480	TCGA	2	8	1223305	1223312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_009480	GAG	2	6	1223346	1223351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_009480	CG	4	8	1223924	1223931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_009480	CG	4	8	1223944	1223951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_009480	GC	3	6	1225779	1225784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_009480	CGGA	2	8	1225787	1225794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_009480	CGG	2	6	1225810	1225815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_009480	CCG	2	6	1225841	1225846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_009480	CG	3	6	1225881	1225886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_009480	AGG	2	6	1225892	1225897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_009480	CG	3	6	1226107	1226112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_009480	GTC	2	6	1226121	1226126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_009480	CCGG	2	8	1226145	1226152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4091	NC_009480	CGGC	2	8	1227005	1227012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_009480	GCCC	2	8	1227029	1227036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4093	NC_009480	GC	4	8	1227042	1227049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_009480	GC	3	6	1228939	1228944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_009480	GCC	2	6	1228957	1228962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_009480	GTC	2	6	1230380	1230385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_009480	CCG	2	6	1231065	1231070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_009480	CGATCA	2	12	1231071	1231082	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_009480	C	6	6	1231238	1231243	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4100	NC_009480	GGA	2	6	1231245	1231250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_009480	CG	4	8	1232484	1232491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_009480	CG	3	6	1232567	1232572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_009480	CG	3	6	1232648	1232653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_009480	GTC	2	6	1232665	1232670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_009480	GCC	2	6	1232685	1232690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_009480	CCG	2	6	1232774	1232779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_009480	CCG	2	6	1232783	1232788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_009480	CGGC	2	8	1232815	1232822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_009480	CGG	2	6	1232852	1232857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_009480	AGG	2	6	1232887	1232892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_009480	CCA	2	6	1234750	1234755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_009480	ATCC	2	8	1241038	1241045	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_009480	GAC	2	6	1241050	1241055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_009480	GCC	2	6	1241060	1241065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_009480	TCG	2	6	1241083	1241088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_009480	CGT	2	6	1241091	1241096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_009480	GC	3	6	1241097	1241102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_009480	CGA	2	6	1241422	1241427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_009480	CGGG	3	12	1241428	1241439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_009480	CTC	2	6	1241477	1241482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_009480	CG	4	8	1241491	1241498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_009480	CG	3	6	1241523	1241528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_009480	CGGG	2	8	1241541	1241548	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_009480	GGACGC	2	12	1241549	1241560	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_009480	CGG	2	6	1241575	1241580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_009480	CGC	2	6	1242473	1242478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_009480	GCG	2	6	1242537	1242542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_009480	GGC	2	6	1242568	1242573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_009480	GCC	2	6	1242580	1242585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_009480	CGAGG	2	10	1242588	1242597	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4131	NC_009480	CGG	2	6	1243434	1243439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_009480	CG	3	6	1243441	1243446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_009480	GC	4	8	1245961	1245968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4259	NC_009480	T	6	6	1286297	1286302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4384	NC_009480	CG	3	6	1314799	1314804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4385	NC_009480	GC	3	6	1314810	1314815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4387	NC_009480	GATC	2	8	1314845	1314852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4388	NC_009480	GCG	2	6	1316577	1316582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4390	NC_009480	CG	3	6	1316618	1316623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4391	NC_009480	CCGG	2	8	1317369	1317376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4392	NC_009480	GGCG	2	8	1317377	1317384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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