MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009480	CGCGGT	2	12	287427	287438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_009480	CTC	2	6	294798	294803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_009480	GCG	2	6	294859	294864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_009480	CGCTC	2	10	294874	294883	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1505	NC_009480	CGT	2	6	295436	295441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_009480	GGT	2	6	295453	295458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_009480	TCG	2	6	296394	296399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_009480	GGA	2	6	296451	296456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_009480	GCC	2	6	298475	298480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_009480	GCGGG	2	10	298492	298501	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_009480	TCC	2	6	298539	298544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_009480	GGC	2	6	298548	298553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_009480	CAT	2	6	298593	298598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_009480	CGGG	2	8	298621	298628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_009480	G	6	6	298660	298665	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_009480	CGCC	2	8	299071	299078	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1517	NC_009480	CG	3	6	299097	299102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_009480	CGC	2	6	300377	300382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_009480	CTC	2	6	300390	300395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_009480	TCCGCG	2	12	300470	300481	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_009480	GAC	2	6	300522	300527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_009480	CCT	2	6	300530	300535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_009480	GCC	2	6	300788	300793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_009480	GC	3	6	300795	300800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_009480	TCCCGG	2	12	300824	300835	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_009480	GCC	2	6	300854	300859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_009480	GCC	3	9	300873	300881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_009480	CGC	2	6	300911	300916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_009480	GCC	2	6	300921	300926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_009480	GAGGAA	2	12	300941	300952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_009480	CCG	2	6	302135	302140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_009480	CG	4	8	302150	302157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_009480	CGGGG	2	10	303345	303354	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1534	NC_009480	GCG	2	6	303400	303405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_009480	CCT	2	6	303452	303457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_009480	GC	3	6	303482	303487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_009480	GAC	2	6	303520	303525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_009480	GCC	2	6	303532	303537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_009480	GGAT	2	8	303546	303553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009480	CG	3	6	303572	303577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_009480	GAG	2	6	303584	303589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_009480	CCG	3	9	303593	303601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_009480	C	6	6	303608	303613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1544	NC_009480	CGG	2	6	303618	303623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_009480	ACG	2	6	303629	303634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_009480	CG	3	6	304386	304391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_009480	CGGC	2	8	304414	304421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_009480	AAT	2	6	304507	304512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_009480	GC	3	6	304629	304634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_009480	CAC	2	6	304648	304653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_009480	CGGCA	2	10	305954	305963	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1552	NC_009480	CAC	2	6	305971	305976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_009480	ACG	3	9	305979	305987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_009480	CGT	3	9	306012	306020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_009480	GTG	2	6	306023	306028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009480	CCG	2	6	306034	306039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_009480	GCC	3	9	306046	306054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_009480	GTG	2	6	306067	306072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_009480	GCC	2	6	306103	306108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_009480	AGCGCG	2	12	306136	306147	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_009480	ACG	2	6	306154	306159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_009480	GCCC	2	8	306190	306197	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1563	NC_009480	CGT	2	6	306210	306215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_009480	GC	3	6	306235	306240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_009480	CGA	2	6	306291	306296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_009480	CCAG	2	8	306300	306307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_009480	CGAC	2	8	310208	310215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_009480	CGT	3	9	310241	310249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_009480	CCG	2	6	310262	310267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_009480	GCC	3	9	310274	310282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_009480	GAC	2	6	311622	311627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_009480	CGCC	2	8	312363	312370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1573	NC_009480	TCCC	2	8	312417	312424	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1574	NC_009480	CGG	2	6	312442	312447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_009480	CGT	3	9	312462	312470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_009480	GCC	2	6	312471	312476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_009480	GC	3	6	312477	312482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_009480	CGGC	2	8	314746	314753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_009480	CGGTC	2	10	314756	314765	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1580	NC_009480	GGC	2	6	315798	315803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_009480	GCG	2	6	315817	315822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_009480	CGGG	2	8	315824	315831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_009480	CCG	2	6	316590	316595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_009480	CCGC	2	8	317839	317846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1585	NC_009480	GAG	2	6	317847	317852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009480	GCG	2	6	317855	317860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_009480	GAT	2	6	317889	317894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_009480	CG	4	8	317896	317903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_009480	GCG	2	6	317907	317912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_009480	GC	3	6	317927	317932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_009480	CG	3	6	317938	317943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_009480	CGGC	2	8	317964	317971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_009480	CGG	2	6	318241	318246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_009480	CG	3	6	318247	318252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_009480	CTA	2	6	318319	318324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_009480	CCA	2	6	318338	318343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_009480	CAT	2	6	318344	318349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_009480	GGA	2	6	319834	319839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_009480	GAT	2	6	319851	319856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009480	CCGCGT	2	12	319886	319897	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_009480	CCG	2	6	319904	319909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_009480	GAC	2	6	319941	319946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_009480	GC	3	6	319950	319955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_009480	TTC	2	6	319966	319971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_009480	CG	3	6	320005	320010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_009480	CGC	2	6	320024	320029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_009480	GC	3	6	321455	321460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_009480	CGT	2	6	321472	321477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_009480	CAC	2	6	321493	321498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_009480	CCG	2	6	321530	321535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_009480	CG	3	6	322147	322152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_009480	CCT	2	6	322187	322192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_009480	CGG	2	6	322219	322224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_009480	TCG	2	6	322256	322261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_009480	GCCAT	2	10	322286	322295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_009480	CGG	2	6	325315	325320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_009480	CG	3	6	325323	325328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_009480	GCGCC	2	10	325334	325343	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1619	NC_009480	CTC	3	9	326620	326628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_009480	CCGCG	2	10	326655	326664	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1621	NC_009480	GCG	2	6	326682	326687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_009480	G	6	6	326693	326698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_009480	CGC	2	6	326740	326745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_009480	TGC	2	6	326755	326760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_009480	TCC	2	6	326795	326800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_009480	CCG	2	6	326851	326856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_009480	CGC	2	6	329110	329115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_009480	CGG	2	6	331662	331667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_009480	CG	3	6	331668	331673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_009480	CTC	2	6	331707	331712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_009480	GACG	2	8	331714	331721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_009480	CG	3	6	331753	331758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_009480	CGC	2	6	331769	331774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_009480	CGA	2	6	331786	331791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_009480	TGCG	2	8	331803	331810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_009480	CGT	2	6	331826	331831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1655	NC_009480	CGGC	2	8	341938	341945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1909	NC_009480	CGA	2	6	459257	459262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1911	NC_009480	GGC	3	9	459313	459321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1942	NC_009480	GGGC	2	8	468406	468413	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1943	NC_009480	GCC	2	6	468456	468461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1969	NC_009480	GCG	2	6	472366	472371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_009480	CCG	2	6	484543	484548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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