MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_009480	CGTCT	2	10	3223206	3223215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9502	NC_009480	CGGC	2	8	3223228	3223235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9503	NC_009480	GGC	3	9	3223233	3223241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9504	NC_009480	TGG	2	6	3223263	3223268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_009480	TCG	2	6	3223304	3223309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_009480	GAG	2	6	3223351	3223356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9507	NC_009480	CCGG	2	8	3224506	3224513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9508	NC_009480	CG	3	6	3224555	3224560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9509	NC_009480	ACTGA	2	10	3224674	3224683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9510	NC_009480	CGATG	2	10	3224729	3224738	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9511	NC_009480	G	6	6	3224753	3224758	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_009480	ACC	2	6	3224766	3224771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9513	NC_009480	CCTT	2	8	3227266	3227273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9514	NC_009480	GCT	2	6	3227376	3227381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_009480	CAA	2	6	3227391	3227396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9516	NC_009480	CCG	2	6	3227414	3227419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9517	NC_009480	CGC	2	6	3227421	3227426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9518	NC_009480	GTGC	2	8	3227508	3227515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9519	NC_009480	GGT	2	6	3227588	3227593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_009480	CGG	2	6	3227606	3227611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9521	NC_009480	CGA	2	6	3227621	3227626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9522	NC_009480	GGC	2	6	3227645	3227650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9523	NC_009480	CGC	2	6	3227718	3227723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9524	NC_009480	CG	3	6	3227736	3227741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9525	NC_009480	CGG	2	6	3227792	3227797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9526	NC_009480	TCG	3	9	3227820	3227828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_009480	GAC	2	6	3227944	3227949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9528	NC_009480	TTC	2	6	3227998	3228003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9529	NC_009480	GCC	2	6	3228020	3228025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9530	NC_009480	CTTC	2	8	3228470	3228477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9531	NC_009480	CGGC	2	8	3232094	3232101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9532	NC_009480	GCC	2	6	3232104	3232109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9533	NC_009480	CCA	2	6	3232117	3232122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9534	NC_009480	GC	3	6	3232130	3232135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9535	NC_009480	CGC	2	6	3232194	3232199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9536	NC_009480	CGAC	2	8	3232206	3232213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9537	NC_009480	CGCC	3	12	3232747	3232758	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9538	NC_009480	CG	3	6	3232759	3232764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9539	NC_009480	TCA	2	6	3232810	3232815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9540	NC_009480	GA	3	6	3232819	3232824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9541	NC_009480	GCC	2	6	3235672	3235677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9542	NC_009480	GACGGG	2	12	3235678	3235689	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9543	NC_009480	GTGCC	2	10	3236733	3236742	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9544	NC_009480	CGC	2	6	3236856	3236861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9545	NC_009480	TCC	2	6	3236888	3236893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9546	NC_009480	CG	3	6	3236903	3236908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9547	NC_009480	CG	3	6	3236974	3236979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9548	NC_009480	CGA	2	6	3236986	3236991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_009480	GCC	2	6	3237756	3237761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9550	NC_009480	CG	3	6	3237778	3237783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9551	NC_009480	CGG	2	6	3238830	3238835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9552	NC_009480	CGTC	2	8	3238836	3238843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9553	NC_009480	GAG	2	6	3238879	3238884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_009480	GCA	2	6	3239522	3239527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9555	NC_009480	ACG	3	9	3239537	3239545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9556	NC_009480	CGT	3	9	3239570	3239578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9557	NC_009480	CTC	2	6	3240813	3240818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9558	NC_009480	CA	3	6	3240819	3240824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9559	NC_009480	GCG	2	6	3240890	3240895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9560	NC_009480	GTCG	2	8	3240951	3240958	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9561	NC_009480	CACGA	2	10	3240961	3240970	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9562	NC_009480	TGA	2	6	3240998	3241003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_009480	AGG	2	6	3241019	3241024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_009480	CTC	2	6	3241080	3241085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9565	NC_009480	CGG	2	6	3241121	3241126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_009480	CG	3	6	3241508	3241513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9567	NC_009480	TCG	2	6	3241514	3241519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9568	NC_009480	CGT	2	6	3241628	3241633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9569	NC_009480	CGC	2	6	3241634	3241639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9570	NC_009480	GATC	2	8	3241975	3241982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9571	NC_009480	AG	3	6	3242033	3242038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9572	NC_009480	CCCA	2	8	3242060	3242067	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9573	NC_009480	CGC	2	6	3242132	3242137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9574	NC_009480	CGGC	2	8	3242182	3242189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9575	NC_009480	GTC	2	6	3242193	3242198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NC_009480	GGC	2	6	3242448	3242453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9577	NC_009480	CGGGC	2	10	3242471	3242480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9578	NC_009480	CCG	2	6	3242493	3242498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9579	NC_009480	GCG	2	6	3244560	3244565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9580	NC_009480	CAC	2	6	3244566	3244571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9581	NC_009480	CAC	2	6	3244573	3244578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9582	NC_009480	CGA	2	6	3245349	3245354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9583	NC_009480	TCC	3	9	3245355	3245363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9584	NC_009480	CGGCG	2	10	3245365	3245374	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9585	NC_009480	CGA	2	6	3245385	3245390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9586	NC_009480	CGC	2	6	3246584	3246589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9587	NC_009480	CAC	2	6	3246621	3246626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9588	NC_009480	GCA	2	6	3246640	3246645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9589	NC_009480	CAC	2	6	3246649	3246654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9590	NC_009480	GAC	2	6	3246668	3246673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9591	NC_009480	CGG	4	12	3248757	3248768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9592	NC_009480	CGC	2	6	3248769	3248774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9593	NC_009480	GCCC	2	8	3248802	3248809	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9594	NC_009480	GAT	2	6	3248837	3248842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_009480	CGGTG	2	10	3249895	3249904	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9596	NC_009480	GGC	2	6	3249909	3249914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9597	NC_009480	GAG	2	6	3249969	3249974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_009480	CCGG	3	12	3250412	3250423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9599	NC_009480	TCGGG	2	10	3251291	3251300	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9600	NC_009480	GGC	3	9	3251301	3251309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9601	NC_009480	TTAGG	2	10	3253496	3253505	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_009480	CGCA	2	8	3254609	3254616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9603	NC_009480	GCG	2	6	3254619	3254624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9604	NC_009480	TCG	2	6	3254630	3254635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9605	NC_009480	CAT	2	6	3254659	3254664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9606	NC_009480	GC	3	6	3254673	3254678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9607	NC_009480	CG	3	6	3254688	3254693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9608	NC_009480	GAG	2	6	3254698	3254703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9609	NC_009480	GCC	2	6	3255388	3255393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9610	NC_009480	GGC	2	6	3257435	3257440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9611	NC_009480	GCC	2	6	3257447	3257452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9612	NC_009480	CCGG	2	8	3257457	3257464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9613	NC_009480	GTG	2	6	3257514	3257519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9614	NC_009480	AGG	2	6	3257520	3257525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9615	NC_009480	TCC	2	6	3257820	3257825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9616	NC_009480	TTC	2	6	3257841	3257846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9617	NC_009480	GTG	2	6	3257859	3257864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9618	NC_009480	GTCT	2	8	3257871	3257878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9619	NC_009480	TCC	2	6	3258662	3258667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9620	NC_009480	GA	3	6	3258734	3258739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9621	NC_009480	CGA	2	6	3258836	3258841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9622	NC_009480	CGA	2	6	3262072	3262077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9623	NC_009480	ACC	2	6	3262103	3262108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9624	NC_009480	GCG	2	6	3263566	3263571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9625	NC_009480	CGGG	2	8	3266879	3266886	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9626	NC_009480	TCG	2	6	3266887	3266892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9627	NC_009480	CG	3	6	3267335	3267340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9628	NC_009480	CGTCC	2	10	3268941	3268950	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9629	NC_009480	CCGC	2	8	3268959	3268966	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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9631	NC_009480	GCA	2	6	3269003	3269008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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