MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_009480	GAG	2	6	3033942	3033947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_009480	TCGAC	2	10	3037095	3037104	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9003	NC_009480	CGA	2	6	3037128	3037133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_009480	TCC	2	6	3037364	3037369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9005	NC_009480	CCG	2	6	3037389	3037394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9006	NC_009480	GCG	2	6	3037431	3037436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_009480	GCG	2	6	3037787	3037792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_009480	CG	3	6	3037806	3037811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9009	NC_009480	CTG	2	6	3037835	3037840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_009480	GCC	2	6	3037889	3037894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_009480	GAC	2	6	3037919	3037924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_009480	GGA	2	6	3037951	3037956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_009480	GTC	3	9	3040104	3040112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_009480	CGC	2	6	3040151	3040156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9015	NC_009480	CG	3	6	3040181	3040186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9016	NC_009480	AGC	2	6	3040188	3040193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_009480	GCC	2	6	3040221	3040226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9018	NC_009480	CG	3	6	3040236	3040241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_009480	TCG	2	6	3040754	3040759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_009480	CCG	2	6	3040783	3040788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9021	NC_009480	CGT	2	6	3043943	3043948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_009480	GGAG	2	8	3043960	3043967	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_009480	GCCG	2	8	3043990	3043997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9024	NC_009480	GCG	2	6	3044004	3044009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_009480	CCCG	2	8	3044126	3044133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9026	NC_009480	C	6	6	3044799	3044804	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9027	NC_009480	CCG	2	6	3045151	3045156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9028	NC_009480	CCTG	3	12	3045167	3045178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9029	NC_009480	CGC	2	6	3045179	3045184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9030	NC_009480	CCG	2	6	3049046	3049051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9031	NC_009480	CGC	3	9	3049052	3049060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9032	NC_009480	CCG	2	6	3049061	3049066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9033	NC_009480	CCG	2	6	3049072	3049077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9034	NC_009480	GAG	2	6	3049088	3049093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_009480	GGCCG	2	10	3053810	3053819	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9036	NC_009480	TGG	2	6	3055095	3055100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_009480	CGGG	2	8	3055119	3055126	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9038	NC_009480	CCCG	2	8	3055128	3055135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9039	NC_009480	C	6	6	3055145	3055150	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9040	NC_009480	CGGC	2	8	3057367	3057374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9041	NC_009480	GCG	2	6	3057377	3057382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_009480	CG	3	6	3057402	3057407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_009480	CAT	2	6	3057430	3057435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_009480	CATC	2	8	3057438	3057445	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9045	NC_009480	CG	3	6	3057487	3057492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9046	NC_009480	GCC	2	6	3057511	3057516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9047	NC_009480	C	6	6	3057541	3057546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9048	NC_009480	GAG	2	6	3057574	3057579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_009480	TCCA	2	8	3058580	3058587	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_009480	GCGG	2	8	3058596	3058603	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9051	NC_009480	CGGGG	2	10	3058611	3058620	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9052	NC_009480	CACC	2	8	3058684	3058691	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9053	NC_009480	CGT	2	6	3058696	3058701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_009480	GC	3	6	3059713	3059718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9055	NC_009480	CCGC	2	8	3060217	3060224	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9056	NC_009480	CGA	2	6	3060234	3060239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_009480	CGC	2	6	3061324	3061329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9058	NC_009480	CGC	3	9	3061339	3061347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9059	NC_009480	CAC	2	6	3061354	3061359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9060	NC_009480	CG	3	6	3061379	3061384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9061	NC_009480	CGTC	2	8	3061393	3061400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_009480	GAG	3	9	3061421	3061429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_009480	GCA	2	6	3061444	3061449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_009480	CGA	2	6	3061454	3061459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_009480	CCA	2	6	3061469	3061474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9066	NC_009480	CGA	2	6	3061477	3061482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_009480	ACC	2	6	3061485	3061490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9068	NC_009480	GCT	2	6	3063798	3063803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_009480	ACC	2	6	3063870	3063875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_009480	CGG	2	6	3065299	3065304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_009480	TCG	2	6	3065308	3065313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9075	NC_009480	GC	3	6	3065374	3065379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9076	NC_009480	TCC	2	6	3067298	3067303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9078	NC_009480	GGCC	2	8	3068512	3068519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9079	NC_009480	CTCG	2	8	3068521	3068528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9080	NC_009480	GAG	2	6	3068529	3068534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9090	NC_009480	CGCC	2	8	3070614	3070621	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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9094	NC_009480	GC	3	6	3072515	3072520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9096	NC_009480	CA	3	6	3072585	3072590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9097	NC_009480	GTA	2	6	3072643	3072648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9099	NC_009480	GCGG	2	8	3072674	3072681	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9100	NC_009480	GCA	2	6	3073272	3073277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_009480	CCG	2	6	3073284	3073289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9102	NC_009480	CGC	2	6	3073369	3073374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9108	NC_009480	GGT	2	6	3075751	3075756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_009480	CGG	2	6	3075765	3075770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_009480	CGGT	2	8	3075832	3075839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9111	NC_009480	GT	3	6	3075860	3075865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_009480	GGAT	2	8	3075906	3075913	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_009480	CGT	2	6	3075930	3075935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9116	NC_009480	GATC	3	12	3077606	3077617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9117	NC_009480	GAG	2	6	3077622	3077627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_009480	CG	3	6	3079228	3079233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9119	NC_009480	CCG	2	6	3079234	3079239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9120	NC_009480	CGG	2	6	3079265	3079270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_009480	CCCG	2	8	3079272	3079279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9122	NC_009480	CGA	2	6	3079322	3079327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_009480	GGA	2	6	3079329	3079334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_009480	CGCC	3	12	3080585	3080596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9125	NC_009480	CGC	2	6	3080629	3080634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9126	NC_009480	CG	4	8	3080670	3080677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9127	NC_009480	TCC	2	6	3080691	3080696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9128	NC_009480	GGA	2	6	3080745	3080750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_009480	TCG	2	6	3080804	3080809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9131	NC_009480	GAG	2	6	3080822	3080827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9132	NC_009480	CGC	2	6	3080858	3080863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9133	NC_009480	CGC	3	9	3080870	3080878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9261	NC_009480	GCG	2	6	3129245	3129250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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