MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_009480	ACC	2	6	2869254	2869259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8502	NC_009480	C	6	6	2869459	2869464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8503	NC_009480	TC	3	6	2869512	2869517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8504	NC_009480	ACC	2	6	2869542	2869547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_009480	GCA	2	6	2869600	2869605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_009480	AGA	2	6	2869658	2869663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_009480	TCT	2	6	2869676	2869681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_009480	GGATC	2	10	2869805	2869814	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8509	NC_009480	TTC	2	6	2869856	2869861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_009480	GGA	2	6	2869972	2869977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_009480	CCG	2	6	2870049	2870054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8512	NC_009480	ACG	2	6	2870068	2870073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_009480	CCAT	2	8	2870083	2870090	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8514	NC_009480	GCCT	2	8	2870108	2870115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8515	NC_009480	ATA	2	6	2870116	2870121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_009480	GCT	2	6	2870217	2870222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_009480	CCT	2	6	2870233	2870238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8518	NC_009480	TGG	2	6	2870296	2870301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_009480	GTT	2	6	2870307	2870312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_009480	CGA	2	6	2870320	2870325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_009480	CTG	2	6	2870350	2870355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_009480	TCCA	2	8	2870416	2870423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8523	NC_009480	GA	3	6	2870476	2870481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_009480	TCC	2	6	2870562	2870567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8525	NC_009480	ACG	2	6	2870568	2870573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_009480	CTTCG	2	10	2870610	2870619	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8527	NC_009480	TTC	2	6	2870720	2870725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_009480	CAA	2	6	2870745	2870750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_009480	CTCCC	2	10	2870797	2870806	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8530	NC_009480	GGT	2	6	2870877	2870882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_009480	CGA	2	6	2870944	2870949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_009480	CA	3	6	2871088	2871093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_009480	TCGC	2	8	2871118	2871125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8534	NC_009480	ACT	2	6	2871127	2871132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_009480	TA	3	6	2871207	2871212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_009480	TAT	2	6	2871288	2871293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_009480	CTT	2	6	2871328	2871333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_009480	CAC	2	6	2871528	2871533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8539	NC_009480	GAC	2	6	2871546	2871551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_009480	AC	3	6	2871576	2871581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8541	NC_009480	AC	3	6	2871635	2871640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8542	NC_009480	CCCAC	2	10	2871652	2871661	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8543	NC_009480	AGG	2	6	2871663	2871668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_009480	AGC	2	6	2871675	2871680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_009480	TCAATG	2	12	2871699	2871710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8546	NC_009480	AGAGG	2	10	2871783	2871792	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_009480	AGG	2	6	2871811	2871816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_009480	CTC	2	6	2871890	2871895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8549	NC_009480	GT	3	6	2871952	2871957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_009480	ATG	2	6	2872147	2872152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_009480	TCC	2	6	2872173	2872178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8552	NC_009480	CCA	2	6	2872209	2872214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8553	NC_009480	CACGA	2	10	2872274	2872283	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8554	NC_009480	GAC	2	6	2872287	2872292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_009480	CAC	2	6	2872300	2872305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8556	NC_009480	CA	3	6	2872327	2872332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8557	NC_009480	TTC	2	6	2872372	2872377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_009480	CCG	2	6	2872405	2872410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8559	NC_009480	CTC	2	6	2872589	2872594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8560	NC_009480	TCC	2	6	2872637	2872642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8561	NC_009480	CAG	2	6	2872748	2872753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_009480	AAT	2	6	2872787	2872792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_009480	GCT	2	6	2872827	2872832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_009480	CTT	2	6	2872879	2872884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_009480	CTA	2	6	2872887	2872892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_009480	TGC	2	6	2872936	2872941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_009480	CTG	2	6	2872975	2872980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_009480	CGT	2	6	2873048	2873053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_009480	CAA	2	6	2873078	2873083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_009480	GACCA	2	10	2873127	2873136	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8571	NC_009480	CGC	2	6	2873286	2873291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8572	NC_009480	ACC	2	6	2873344	2873349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8573	NC_009480	CTTG	2	8	2873440	2873447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8574	NC_009480	CAGC	2	8	2873577	2873584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8575	NC_009480	CCAGA	2	10	2873624	2873633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8576	NC_009480	CAC	3	9	2873733	2873741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8577	NC_009480	CCCG	2	8	2873769	2873776	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8578	NC_009480	ACC	2	6	2873806	2873811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8579	NC_009480	AAC	2	6	2873824	2873829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_009480	GGC	2	6	2873874	2873879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_009480	CCG	2	6	2873889	2873894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8582	NC_009480	CGA	2	6	2877415	2877420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_009480	CCGG	2	8	2877426	2877433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8584	NC_009480	CG	4	8	2877436	2877443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8585	NC_009480	GCG	2	6	2877450	2877455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_009480	GC	3	6	2877460	2877465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8587	NC_009480	GGA	2	6	2877494	2877499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_009480	ACG	3	9	2877507	2877515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_009480	CGT	3	9	2877541	2877549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_009480	CGT	2	6	2877563	2877568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8591	NC_009480	TC	4	8	2878473	2878480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8592	NC_009480	CATCC	2	10	2879656	2879665	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8593	NC_009480	CGG	2	6	2879677	2879682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_009480	CGT	2	6	2879690	2879695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_009480	GGC	3	9	2879722	2879730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8596	NC_009480	GT	3	6	2879736	2879741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_009480	CGCC	2	8	2879757	2879764	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8598	NC_009480	CGC	2	6	2879786	2879791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8599	NC_009480	CGA	2	6	2879794	2879799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_009480	CG	3	6	2879861	2879866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8601	NC_009480	GGGA	2	8	2879879	2879886	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_009480	CGG	3	9	2880749	2880757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_009480	GAG	2	6	2885333	2885338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_009480	GTC	2	6	2886493	2886498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_009480	ACC	2	6	2886510	2886515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8606	NC_009480	CAC	2	6	2887338	2887343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8607	NC_009480	GGA	2	6	2887440	2887445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_009480	GC	3	6	2892640	2892645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8609	NC_009480	CCTC	2	8	2892647	2892654	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8610	NC_009480	GGC	2	6	2892726	2892731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_009480	GC	3	6	2895022	2895027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8612	NC_009480	CGCA	2	8	2895044	2895051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8613	NC_009480	CAC	2	6	2895085	2895090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8614	NC_009480	CG	3	6	2895091	2895096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8615	NC_009480	CG	3	6	2895102	2895107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8616	NC_009480	CGC	2	6	2896735	2896740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8617	NC_009480	CAAC	2	8	2896781	2896788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8618	NC_009480	GTC	2	6	2896789	2896794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_009480	CTC	2	6	2900971	2900976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8620	NC_009480	ACG	3	9	2900981	2900989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_009480	CCT	2	6	2900997	2901002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8622	NC_009480	CGT	3	9	2901012	2901020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_009480	GC	3	6	2901032	2901037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8624	NC_009480	GC	3	6	2901044	2901049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8625	NC_009480	GCGTC	2	10	2901088	2901097	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8626	NC_009480	TGGCGG	3	18	2901099	2901116	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8627	NC_009480	CGC	2	6	2901118	2901123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8628	NC_009480	GCC	4	12	2901180	2901191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8629	NC_009480	GGC	2	6	2901202	2901207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8631	NC_009480	CGTG	2	8	2901282	2901289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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