MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_009480	GC	3	6	2360079	2360084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7002	NC_009480	CGG	2	6	2360111	2360116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_009480	GC	3	6	2360124	2360129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_009480	CGC	2	6	2360135	2360140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_009480	GGT	2	6	2360511	2360516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_009480	ATC	2	6	2360611	2360616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_009480	ATC	2	6	2360624	2360629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_009480	CCGG	2	8	2361103	2361110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_009480	GCG	2	6	2361111	2361116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_009480	ACG	2	6	2361131	2361136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_009480	CGT	2	6	2361143	2361148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_009480	GCGG	2	8	2361158	2361165	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7013	NC_009480	CTC	2	6	2361169	2361174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7014	NC_009480	TCG	2	6	2366710	2366715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_009480	CGA	3	9	2366811	2366819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_009480	CGA	2	6	2366873	2366878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_009480	CGCCCC	2	12	2366884	2366895	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
7018	NC_009480	GCG	2	6	2367393	2367398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_009480	ACG	2	6	2367399	2367404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_009480	GACAC	2	10	2367412	2367421	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7021	NC_009480	CCA	2	6	2367440	2367445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_009480	CA	3	6	2367444	2367449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7023	NC_009480	AGCGT	2	10	2367463	2367472	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7024	NC_009480	C	7	7	2368059	2368065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7025	NC_009480	CA	3	6	2368075	2368080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7026	NC_009480	GCACC	2	10	2369015	2369024	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7027	NC_009480	CGT	2	6	2369061	2369066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_009480	CG	3	6	2369096	2369101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7029	NC_009480	CG	3	6	2369879	2369884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_009480	GGA	2	6	2369890	2369895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_009480	CCCGT	2	10	2369912	2369921	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7032	NC_009480	GCCCGG	2	12	2369940	2369951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_009480	GTC	2	6	2370003	2370008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_009480	CCT	2	6	2370753	2370758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7035	NC_009480	AGG	2	6	2370843	2370848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_009480	GCC	2	6	2370944	2370949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7037	NC_009480	TGG	2	6	2370950	2370955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_009480	GGA	2	6	2370993	2370998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_009480	CGCA	2	8	2371007	2371014	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7040	NC_009480	TCC	2	6	2371036	2371041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7041	NC_009480	GTCG	2	8	2371062	2371069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7042	NC_009480	CCT	2	6	2371831	2371836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_009480	GAC	2	6	2371939	2371944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_009480	GCG	2	6	2371982	2371987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_009480	GC	3	6	2372012	2372017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7046	NC_009480	GATCC	2	10	2372041	2372050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7047	NC_009480	CGA	2	6	2372057	2372062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_009480	CGGA	2	8	2372126	2372133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_009480	CTC	2	6	2373044	2373049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7050	NC_009480	GCC	3	9	2375102	2375110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_009480	GC	3	6	2375121	2375126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7052	NC_009480	GTG	2	6	2375131	2375136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_009480	CTG	2	6	2375157	2375162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_009480	GT	3	6	2375164	2375169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_009480	CCT	2	6	2375204	2375209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_009480	GCC	2	6	2375219	2375224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_009480	CG	3	6	2375240	2375245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_009480	GC	3	6	2375246	2375251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7059	NC_009480	CGC	2	6	2375578	2375583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_009480	GC	3	6	2375582	2375587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_009480	ACG	3	9	2375624	2375632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_009480	CGAT	2	8	2378988	2378995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7063	NC_009480	CGGG	2	8	2379006	2379013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7064	NC_009480	GAT	2	6	2379063	2379068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_009480	CGC	2	6	2379084	2379089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_009480	GCC	2	6	2382184	2382189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_009480	GGC	2	6	2382196	2382201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_009480	GC	3	6	2382205	2382210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_009480	GAC	2	6	2382242	2382247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_009480	GGCG	2	8	2382258	2382265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7071	NC_009480	GAG	2	6	2382267	2382272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_009480	GC	3	6	2383627	2383632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7073	NC_009480	CGG	3	9	2383647	2383655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_009480	TCC	2	6	2385422	2385427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7075	NC_009480	TGC	2	6	2385443	2385448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7077	NC_009480	ACC	2	6	2385667	2385672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_009480	TCG	2	6	2385679	2385684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_009480	GCC	2	6	2385710	2385715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7080	NC_009480	CAC	2	6	2385723	2385728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7081	NC_009480	GCT	2	6	2385773	2385778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_009480	CGG	2	6	2385813	2385818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_009480	TGA	2	6	2385821	2385826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_009480	GCG	2	6	2385853	2385858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_009480	GGA	2	6	2385865	2385870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_009480	GC	3	6	2386119	2386124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_009480	GCA	2	6	2386139	2386144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_009480	CCG	3	9	2388401	2388409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_009480	TGAGA	2	10	2388477	2388486	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_009480	CGG	2	6	2388513	2388518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_009480	GCG	2	6	2391606	2391611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_009480	GGA	2	6	2391676	2391681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_009480	ACC	2	6	2391700	2391705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7094	NC_009480	AG	3	6	2391752	2391757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_009480	CGT	2	6	2392657	2392662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_009480	GGGC	2	8	2392665	2392672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7097	NC_009480	GCCC	2	8	2392677	2392684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7098	NC_009480	CCTCCC	2	12	2392714	2392725	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7099	NC_009480	GC	3	6	2392731	2392736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_009480	CGAGC	2	10	2392741	2392750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7101	NC_009480	CGG	2	6	2394171	2394176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_009480	CGGT	2	8	2394180	2394187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7103	NC_009480	CCGAG	2	10	2394201	2394210	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7104	NC_009480	GTC	4	12	2394255	2394266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_009480	CG	3	6	2394345	2394350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7106	NC_009480	AAG	2	6	2394375	2394380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_009480	CG	3	6	2394422	2394427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_009480	GC	3	6	2394434	2394439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_009480	CGA	3	9	2394665	2394673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_009480	CGT	2	6	2394702	2394707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_009480	TGC	2	6	2394712	2394717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_009480	CTGC	2	8	2396895	2396902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7113	NC_009480	CCG	2	6	2397018	2397023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_009480	GCC	2	6	2397034	2397039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_009480	GGA	2	6	2397044	2397049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_009480	CA	3	6	2397054	2397059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7117	NC_009480	GAG	2	6	2397060	2397065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_009480	GC	3	6	2397088	2397093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7119	NC_009480	GCCCG	2	10	2397115	2397124	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7120	NC_009480	CGGCC	2	10	2397136	2397145	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7121	NC_009480	GCCCG	2	10	2399487	2399496	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7122	NC_009480	GGC	2	6	2399530	2399535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_009480	CGCC	2	8	2399545	2399552	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7124	NC_009480	CCCCGA	2	12	2400519	2400530	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7125	NC_009480	CGC	2	6	2403751	2403756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7126	NC_009480	CG	3	6	2403771	2403776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7127	NC_009480	GCG	2	6	2405533	2405538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_009480	CATC	2	8	2405539	2405546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7129	NC_009480	CGCA	2	8	2405636	2405643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7130	NC_009480	ACC	2	6	2406653	2406658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7131	NC_009480	CTG	2	6	2406661	2406666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7259	NC_009480	TCGGG	2	10	2461474	2461483	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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7395	NC_009480	GCCTG	2	10	2515307	2515316	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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