MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009480	CG	3	6	2229345	2229350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_009480	AGGAC	2	10	2229409	2229418	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6503	NC_009480	CAGC	2	8	2230755	2230762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6504	NC_009480	CGA	2	6	2230766	2230771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_009480	CCGT	2	8	2230803	2230810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6506	NC_009480	TGC	2	6	2230813	2230818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_009480	AGCGCT	2	12	2230837	2230848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_009480	GTCG	2	8	2234220	2234227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6509	NC_009480	CGG	2	6	2234228	2234233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_009480	TC	4	8	2237440	2237447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_009480	CTC	2	6	2237453	2237458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_009480	GT	3	6	2240919	2240924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_009480	CGC	2	6	2240946	2240951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6514	NC_009480	GCC	2	6	2240961	2240966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_009480	CG	4	8	2246722	2246729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_009480	GCT	2	6	2246732	2246737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_009480	CCT	2	6	2246750	2246755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_009480	GC	3	6	2246781	2246786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6519	NC_009480	GTC	2	6	2246789	2246794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_009480	CG	3	6	2246798	2246803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6521	NC_009480	CG	3	6	2246822	2246827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_009480	ACCCG	2	10	2246928	2246937	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6523	NC_009480	CCTT	2	8	2246995	2247002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6524	NC_009480	CCG	2	6	2247046	2247051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_009480	CCG	2	6	2247055	2247060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_009480	CCA	2	6	2247115	2247120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_009480	CGG	2	6	2247173	2247178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_009480	CGGAC	2	10	2247183	2247192	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6529	NC_009480	CGCC	2	8	2247196	2247203	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6530	NC_009480	CGG	2	6	2247246	2247251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_009480	GCC	2	6	2247255	2247260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6532	NC_009480	CGA	2	6	2247282	2247287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_009480	GAT	2	6	2247365	2247370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_009480	GTCG	2	8	2247423	2247430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_009480	ATC	2	6	2247454	2247459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_009480	CGG	2	6	2247478	2247483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_009480	AC	3	6	2247515	2247520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_009480	CGC	3	9	2247559	2247567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_009480	ACG	2	6	2247576	2247581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_009480	AC	3	6	2247595	2247600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_009480	CGC	2	6	2247651	2247656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_009480	CGG	2	6	2247699	2247704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_009480	C	6	6	2247726	2247731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6544	NC_009480	GCC	2	6	2247804	2247809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_009480	AC	3	6	2247822	2247827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6546	NC_009480	TGA	2	6	2247849	2247854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_009480	GTT	2	6	2247872	2247877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_009480	GCAA	2	8	2247919	2247926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6549	NC_009480	TTA	2	6	2247947	2247952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_009480	ATCTC	2	10	2248050	2248059	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6551	NC_009480	AAC	2	6	2248135	2248140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_009480	AC	3	6	2248143	2248148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_009480	TCT	2	6	2248190	2248195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_009480	ACG	2	6	2248238	2248243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_009480	CGA	2	6	2248318	2248323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_009480	ACCA	2	8	2248525	2248532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_009480	AGG	2	6	2248569	2248574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_009480	CCA	2	6	2248596	2248601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_009480	CAA	2	6	2248666	2248671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_009480	GTA	2	6	2248753	2248758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_009480	CTG	2	6	2248781	2248786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_009480	ACC	2	6	2248922	2248927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_009480	C	6	6	2249127	2249132	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6564	NC_009480	TC	3	6	2249180	2249185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6565	NC_009480	ACC	2	6	2249210	2249215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6566	NC_009480	GCA	2	6	2249268	2249273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_009480	AGA	2	6	2249326	2249331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_009480	TCT	2	6	2249344	2249349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_009480	TTC	2	6	2249524	2249529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_009480	GGA	2	6	2249640	2249645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_009480	CCG	2	6	2249717	2249722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_009480	ACG	2	6	2249736	2249741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_009480	CCAT	2	8	2249751	2249758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_009480	GCCT	2	8	2249776	2249783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6575	NC_009480	ATA	2	6	2249784	2249789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_009480	GCT	2	6	2249885	2249890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_009480	CCT	2	6	2249901	2249906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_009480	TGG	2	6	2249964	2249969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_009480	GTT	2	6	2249975	2249980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_009480	CGA	2	6	2249988	2249993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_009480	CTG	2	6	2250018	2250023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_009480	TCCA	2	8	2250084	2250091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6583	NC_009480	GA	3	6	2250144	2250149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_009480	TCC	2	6	2250230	2250235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6585	NC_009480	ACG	2	6	2250236	2250241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_009480	CTTCG	2	10	2250278	2250287	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6587	NC_009480	TTC	2	6	2250388	2250393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_009480	CAA	2	6	2250413	2250418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_009480	CTCCC	2	10	2250465	2250474	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6590	NC_009480	GGT	2	6	2250545	2250550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_009480	CGA	2	6	2250612	2250617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_009480	CA	3	6	2250756	2250761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6593	NC_009480	TCGC	2	8	2250786	2250793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6594	NC_009480	ACT	2	6	2250795	2250800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_009480	TA	3	6	2250875	2250880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_009480	TAT	2	6	2250956	2250961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_009480	CTT	2	6	2250996	2251001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_009480	CAC	2	6	2251196	2251201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_009480	GAC	2	6	2251214	2251219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_009480	AC	3	6	2251244	2251249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6601	NC_009480	AC	3	6	2251303	2251308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_009480	CCCAC	2	10	2251320	2251329	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6603	NC_009480	AGG	2	6	2251331	2251336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_009480	AGC	2	6	2251343	2251348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_009480	TCAATG	2	12	2251367	2251378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6606	NC_009480	AGAGG	2	10	2251451	2251460	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_009480	AGG	2	6	2251479	2251484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_009480	CTC	2	6	2251558	2251563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6609	NC_009480	GT	3	6	2251620	2251625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_009480	ATG	2	6	2251815	2251820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_009480	TCC	2	6	2251841	2251846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6612	NC_009480	CCA	2	6	2251877	2251882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6613	NC_009480	CACGA	2	10	2251942	2251951	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6614	NC_009480	GAC	2	6	2251955	2251960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_009480	CAC	2	6	2251968	2251973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_009480	CA	3	6	2251995	2252000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6617	NC_009480	TTC	2	6	2252040	2252045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_009480	CCG	2	6	2252073	2252078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6619	NC_009480	CTC	2	6	2252257	2252262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6620	NC_009480	TCC	2	6	2252305	2252310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_009480	CAG	2	6	2252416	2252421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_009480	AAT	2	6	2252455	2252460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_009480	GCT	2	6	2252495	2252500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_009480	CTT	2	6	2252547	2252552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_009480	CTA	2	6	2252555	2252560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_009480	TGC	2	6	2252604	2252609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_009480	CTG	2	6	2252643	2252648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_009480	CGT	2	6	2252716	2252721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6630	NC_009480	GACCA	2	10	2252795	2252804	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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