MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009480	CGC	2	6	1809182	1809187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_009480	ACCG	2	8	1809204	1809211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_009480	CGA	2	6	1809281	1809286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_009480	CGA	2	6	1809305	1809310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_009480	GC	3	6	1809312	1809317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_009480	GC	3	6	1809320	1809325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_009480	CGC	2	6	1809334	1809339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_009480	CACGGG	2	12	1811551	1811562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_009480	ACG	4	12	1811591	1811602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_009480	GCC	2	6	1811603	1811608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_009480	C	6	6	1813706	1813711	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5512	NC_009480	ATGCG	3	15	1813720	1813734	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5513	NC_009480	CGG	3	9	1813741	1813749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_009480	CCGT	2	8	1813768	1813775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_009480	CGG	2	6	1813795	1813800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_009480	CGG	2	6	1813805	1813810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_009480	CG	3	6	1813828	1813833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_009480	TCC	2	6	1815753	1815758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_009480	GC	3	6	1815768	1815773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_009480	CCG	2	6	1815798	1815803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_009480	GCC	2	6	1815825	1815830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_009480	CGAA	2	8	1815832	1815839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_009480	CGC	3	9	1820453	1820461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_009480	GC	3	6	1820470	1820475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_009480	C	6	6	1823486	1823491	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5526	NC_009480	CGG	3	9	1823564	1823572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_009480	GCC	2	6	1823584	1823589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_009480	CCG	2	6	1823598	1823603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_009480	ACGC	2	8	1823927	1823934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_009480	TGC	2	6	1824002	1824007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_009480	CGG	2	6	1824314	1824319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_009480	GAC	2	6	1824342	1824347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_009480	GC	3	6	1824390	1824395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_009480	GCG	2	6	1824439	1824444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_009480	CGG	2	6	1824456	1824461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_009480	GAT	2	6	1824483	1824488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_009480	GGA	2	6	1826225	1826230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_009480	GCC	2	6	1826234	1826239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_009480	CGCC	2	8	1826455	1826462	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5540	NC_009480	GCAT	2	8	1828023	1828030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_009480	CGG	2	6	1828033	1828038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_009480	CGC	2	6	1828043	1828048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_009480	GCG	2	6	1828063	1828068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_009480	GCG	2	6	1828078	1828083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_009480	ATG	2	6	1828125	1828130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_009480	GCCG	2	8	1828149	1828156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_009480	CGCA	2	8	1828183	1828190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_009480	GGA	2	6	1828221	1828226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_009480	AGC	2	6	1828757	1828762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_009480	GC	3	6	1828768	1828773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_009480	CTC	2	6	1828776	1828781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_009480	CCCG	2	8	1828782	1828789	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5553	NC_009480	GAC	2	6	1828793	1828798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_009480	TCG	2	6	1828829	1828834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_009480	GGCC	2	8	1830126	1830133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_009480	CG	3	6	1830158	1830163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_009480	TGA	2	6	1830434	1830439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009480	TCGGTG	2	12	1831491	1831502	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5559	NC_009480	GAC	2	6	1832492	1832497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_009480	CGC	2	6	1832515	1832520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_009480	CG	3	6	1836610	1836615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_009480	ACGG	2	8	1836654	1836661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_009480	GC	3	6	1836668	1836673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_009480	CCG	2	6	1836675	1836680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_009480	GC	3	6	1838015	1838020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_009480	CGA	2	6	1838051	1838056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_009480	GTC	2	6	1838113	1838118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_009480	GCC	2	6	1838156	1838161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_009480	TCG	2	6	1838827	1838832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_009480	AGG	2	6	1838841	1838846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_009480	CCG	2	6	1839497	1839502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_009480	GGC	2	6	1840811	1840816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5574	NC_009480	CG	3	6	1840863	1840868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_009480	GCC	2	6	1841964	1841969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_009480	GC	3	6	1841970	1841975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_009480	CAC	2	6	1842034	1842039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_009480	GGA	2	6	1842789	1842794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_009480	CGC	2	6	1842850	1842855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_009480	GGA	2	6	1842856	1842861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_009480	ACCC	2	8	1842925	1842932	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5582	NC_009480	AG	3	6	1842958	1842963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_009480	CG	3	6	1842976	1842981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_009480	GCG	2	6	1842983	1842988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_009480	CGG	2	6	1843002	1843007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_009480	GCT	2	6	1843090	1843095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5590	NC_009480	GCG	2	6	1843266	1843271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5592	NC_009480	CGGC	2	8	1845252	1845259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_009480	CG	4	8	1845262	1845269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_009480	CGA	2	6	1845307	1845312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5596	NC_009480	CGG	2	6	1846672	1846677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_009480	CGAC	2	8	1846686	1846693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_009480	CGA	3	9	1846697	1846705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_009480	CGC	2	6	1849741	1849746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_009480	GCG	3	9	1849752	1849760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_009480	GAC	3	9	1849763	1849771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_009480	GCC	2	6	1849774	1849779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_009480	GGA	3	9	1849785	1849793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_009480	CCG	2	6	1851346	1851351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_009480	CGGT	2	8	1851402	1851409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_009480	CG	3	6	1851431	1851436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_009480	GAG	2	6	1851897	1851902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_009480	CGA	2	6	1853562	1853567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_009480	GAG	2	6	1853590	1853595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_009480	GACGC	2	10	1853598	1853607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5611	NC_009480	CGGGTC	2	12	1855308	1855319	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_009480	GTC	2	6	1858227	1858232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5614	NC_009480	CGA	2	6	1859804	1859809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_009480	CG	3	6	1859861	1859866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_009480	CGT	2	6	1859883	1859888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5618	NC_009480	CG	4	8	1860907	1860914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5619	NC_009480	CCG	2	6	1860929	1860934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_009480	TCG	2	6	1860954	1860959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_009480	GC	3	6	1862324	1862329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_009480	AAT	2	6	1862338	1862343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_009480	CAC	2	6	1862376	1862381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_009480	GGT	2	6	1862385	1862390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_009480	AGC	2	6	1862413	1862418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_009480	AAC	2	6	1862450	1862455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_009480	GCA	3	9	1862483	1862491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_009480	GC	3	6	1862499	1862504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_009480	GTC	2	6	1862510	1862515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5631	NC_009480	CGT	2	6	1866100	1866105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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