MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009480	CGG	2	6	1582061	1582066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_009480	CG	3	6	1582077	1582082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_009480	CCGT	2	8	1582105	1582112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_009480	CG	3	6	1582195	1582200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_009480	GCCC	2	8	1582202	1582209	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5006	NC_009480	GCC	2	6	1582210	1582215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_009480	GGCG	2	8	1584796	1584803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_009480	GCC	2	6	1584817	1584822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_009480	GCG	2	6	1586141	1586146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_009480	GCG	2	6	1586165	1586170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_009480	GCG	2	6	1586175	1586180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_009480	CG	3	6	1586217	1586222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_009480	CGC	2	6	1586258	1586263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_009480	GCCGC	2	10	1586268	1586277	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5015	NC_009480	CCGG	2	8	1586281	1586288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_009480	CG	3	6	1590738	1590743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_009480	CCCG	2	8	1593315	1593322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5018	NC_009480	GC	3	6	1593364	1593369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_009480	CGC	2	6	1593394	1593399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_009480	CG	3	6	1594806	1594811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_009480	CA	3	6	1595295	1595300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_009480	CGCC	2	8	1600376	1600383	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5023	NC_009480	CGG	2	6	1602071	1602076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_009480	GGGC	2	8	1602077	1602084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_009480	CGG	2	6	1602090	1602095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_009480	GGC	2	6	1602111	1602116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_009480	TCG	2	6	1602121	1602126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_009480	CGC	2	6	1602154	1602159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_009480	GCC	2	6	1602175	1602180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_009480	CG	3	6	1602923	1602928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_009480	CGC	2	6	1602966	1602971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_009480	CCG	2	6	1603007	1603012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_009480	CAC	2	6	1603032	1603037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_009480	CGC	2	6	1603713	1603718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_009480	CGGGG	3	15	1603731	1603745	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5036	NC_009480	CGTG	2	8	1605463	1605470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_009480	TCG	2	6	1605471	1605476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_009480	GTC	2	6	1605528	1605533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_009480	TGG	2	6	1605998	1606003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_009480	TGGT	2	8	1608531	1608538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_009480	CGCC	2	8	1608573	1608580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5042	NC_009480	GGC	2	6	1608607	1608612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_009480	CCA	2	6	1610308	1610313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_009480	G	6	6	1610328	1610333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_009480	CTC	2	6	1611303	1611308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5047	NC_009480	CG	3	6	1611373	1611378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_009480	GCC	2	6	1611396	1611401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_009480	GGA	2	6	1611406	1611411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_009480	ACGC	2	8	1611473	1611480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_009480	TCGGGG	2	12	1611483	1611494	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5052	NC_009480	CGT	3	9	1611496	1611504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_009480	GCC	3	9	1611518	1611526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_009480	CGCCTC	2	12	1611571	1611582	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_009480	GAC	3	9	1611653	1611661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_009480	CGGC	2	8	1611666	1611673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_009480	GTG	2	6	1611683	1611688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_009480	GC	3	6	1611696	1611701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_009480	TGG	2	6	1611708	1611713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_009480	ACG	2	6	1611714	1611719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_009480	GAC	2	6	1611749	1611754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_009480	GCC	2	6	1611757	1611762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_009480	GCCGG	2	10	1613522	1613531	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5064	NC_009480	CCGGT	2	10	1613532	1613541	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5065	NC_009480	CG	3	6	1614104	1614109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_009480	ATG	2	6	1614112	1614117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_009480	CAC	2	6	1614132	1614137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_009480	CTC	2	6	1614141	1614146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_009480	GAG	2	6	1614147	1614152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_009480	CGG	2	6	1615517	1615522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_009480	CGTC	2	8	1616115	1616122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5074	NC_009480	CGGC	2	8	1617243	1617250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_009480	CG	3	6	1617269	1617274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_009480	CGG	2	6	1617283	1617288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5080	NC_009480	CGT	2	6	1620495	1620500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_009480	GCC	2	6	1620508	1620513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_009480	GAC	2	6	1620526	1620531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_009480	GCG	3	9	1620550	1620558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_009480	GGGGC	2	10	1620591	1620600	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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5086	NC_009480	CCCCG	2	10	1620629	1620638	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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5088	NC_009480	CCG	2	6	1627028	1627033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_009480	GC	3	6	1627037	1627042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_009480	GGGC	2	8	1627043	1627050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_009480	GTGC	2	8	1627051	1627058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_009480	GGGGC	2	10	1627072	1627081	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5093	NC_009480	AGG	2	6	1627112	1627117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_009480	CG	3	6	1627661	1627666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_009480	GCGCC	2	10	1631681	1631690	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5099	NC_009480	GTC	2	6	1631722	1631727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_009480	AGAGG	2	10	1632168	1632177	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_009480	GAC	2	6	1632189	1632194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_009480	GGTGG	2	10	1632232	1632241	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_009480	ACG	2	6	1632242	1632247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5109	NC_009480	GCG	2	6	1633267	1633272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_009480	CGC	2	6	1633275	1633280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_009480	G	6	6	1633692	1633697	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009480	CGA	3	9	1634574	1634582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_009480	AGG	2	6	1634598	1634603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_009480	CGT	2	6	1634611	1634616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_009480	GC	3	6	1634626	1634631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_009480	GCG	2	6	1635347	1635352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_009480	CGGG	2	8	1635387	1635394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_009480	CGC	2	6	1635400	1635405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_009480	TCC	2	6	1635669	1635674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_009480	GCC	2	6	1635683	1635688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_009480	ACC	2	6	1635727	1635732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_009480	TCCG	2	8	1635758	1635765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_009480	TCCC	2	8	1635774	1635781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5124	NC_009480	ACC	2	6	1635788	1635793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_009480	CG	4	8	1635802	1635809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_009480	TC	3	6	1635829	1635834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_009480	CGA	2	6	1636431	1636436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_009480	GAG	2	6	1636445	1636450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_009480	CGTC	2	8	1636697	1636704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_009480	TCC	2	6	1636705	1636710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_009480	CG	4	8	1636733	1636740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_009480	TCC	2	6	1641391	1641396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5391	NC_009480	TGGGGG	2	12	1765487	1765498	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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5393	NC_009480	GACG	2	8	1765676	1765683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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