MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum R chromosome

Total Repeats: 7614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_009342	TGA	2	6	3275036	3275041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_009342	CCA	2	6	3275390	3275395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7503	NC_009342	A	6	6	3275395	3275400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_009342	CAT	3	9	3276011	3276019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_009342	TG	3	6	3276092	3276097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_009342	GGT	3	9	3276153	3276161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_009342	TTC	2	6	3276201	3276206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_009342	GAGGTT	2	12	3276317	3276328	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_009342	AGT	2	6	3276333	3276338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_009342	CAG	2	6	3276417	3276422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_009342	CTA	2	6	3276582	3276587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_009342	A	8	8	3279555	3279562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_009342	AGT	2	6	3279569	3279574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_009342	CCT	2	6	3280943	3280948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7515	NC_009342	CAT	2	6	3280997	3281002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_009342	ACGAA	2	10	3281059	3281068	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7517	NC_009342	CCCCA	2	10	3281103	3281112	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7518	NC_009342	ACC	2	6	3281125	3281130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7519	NC_009342	CAAA	2	8	3281135	3281142	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7520	NC_009342	TTCT	2	8	3282852	3282859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7521	NC_009342	GA	3	6	3282920	3282925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_009342	AGG	2	6	3282933	3282938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_009342	TCG	2	6	3282941	3282946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_009342	CCA	2	6	3282971	3282976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7525	NC_009342	A	6	6	3282976	3282981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_009342	GAA	2	6	3284743	3284748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_009342	GGGT	2	8	3284783	3284790	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_009342	TCTG	2	8	3284814	3284821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7529	NC_009342	TG	3	6	3284853	3284858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_009342	CGC	2	6	3285702	3285707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7531	NC_009342	AGC	3	9	3285718	3285726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_009342	AGA	2	6	3285793	3285798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_009342	CGATT	2	10	3286411	3286420	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7534	NC_009342	TGA	2	6	3286422	3286427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_009342	AAC	2	6	3286454	3286459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_009342	GTC	2	6	3288151	3288156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_009342	AAAGG	2	10	3288172	3288181	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_009342	ATC	2	6	3288234	3288239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_009342	GGGC	2	8	3288319	3288326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7540	NC_009342	CA	4	8	3288349	3288356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7541	NC_009342	GGCGAG	2	12	3288384	3288395	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7542	NC_009342	G	6	6	3288395	3288400	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_009342	CTT	2	6	3289517	3289522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_009342	GTC	2	6	3289595	3289600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_009342	G	8	8	3289603	3289610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_009342	GAG	2	6	3289661	3289666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_009342	ACC	2	6	3289673	3289678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7548	NC_009342	TCA	2	6	3291110	3291115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_009342	TTC	2	6	3291172	3291177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_009342	GACC	2	8	3291191	3291198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7551	NC_009342	TATCG	2	10	3291214	3291223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7552	NC_009342	TTC	2	6	3291243	3291248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_009342	TC	3	6	3291254	3291259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7554	NC_009342	TCT	2	6	3291323	3291328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_009342	TTG	3	9	3291373	3291381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_009342	AAG	2	6	3291412	3291417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_009342	TC	3	6	3291481	3291486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7558	NC_009342	GAAC	2	8	3291507	3291514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7559	NC_009342	CTT	2	6	3291517	3291522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_009342	CTG	3	9	3291545	3291553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_009342	AGA	2	6	3291734	3291739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_009342	CTG	2	6	3291769	3291774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_009342	TCC	2	6	3291996	3292001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7564	NC_009342	CCAA	2	8	3292051	3292058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7565	NC_009342	CAA	2	6	3292065	3292070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_009342	CAACT	2	10	3292130	3292139	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7567	NC_009342	AGA	2	6	3293433	3293438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_009342	GAAA	2	8	3293444	3293451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_009342	AAT	2	6	3293458	3293463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_009342	GCC	2	6	3293686	3293691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7571	NC_009342	GGC	2	6	3293719	3293724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_009342	CA	3	6	3297041	3297046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7573	NC_009342	CCA	2	6	3297089	3297094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7574	NC_009342	CG	3	6	3297131	3297136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7575	NC_009342	CCA	2	6	3297161	3297166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7576	NC_009342	TGG	2	6	3297192	3297197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_009342	AGC	2	6	3297211	3297216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_009342	ACGAT	2	10	3297294	3297303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7579	NC_009342	GC	3	6	3300828	3300833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7580	NC_009342	GCCC	2	8	3304221	3304228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7581	NC_009342	GGCG	2	8	3304247	3304254	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7582	NC_009342	TA	4	8	3304264	3304271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_009342	AGAA	2	8	3304295	3304302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_009342	TC	3	6	3304364	3304369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7585	NC_009342	GT	3	6	3304412	3304417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_009342	TGC	2	6	3305114	3305119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7587	NC_009342	TAC	2	6	3305131	3305136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_009342	AAACC	2	10	3306119	3306128	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7589	NC_009342	AATG	2	8	3306136	3306143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_009342	ATGA	2	8	3306568	3306575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_009342	CAA	2	6	3309581	3309586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7592	NC_009342	AAG	2	6	3309599	3309604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_009342	TTC	2	6	3310572	3310577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7594	NC_009342	CCA	2	6	3310625	3310630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7595	NC_009342	AAG	2	6	3311334	3311339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_009342	GC	3	6	3311394	3311399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7597	NC_009342	GCAG	2	8	3311401	3311408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7598	NC_009342	A	6	6	3311410	3311415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_009342	TTG	2	6	3312453	3312458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_009342	GA	3	6	3312562	3312567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_009342	TGC	2	6	3312617	3312622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_009342	CAG	2	6	3312689	3312694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_009342	TTAT	2	8	3313163	3313170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_009342	A	6	6	3313183	3313188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_009342	TTG	2	6	3313353	3313358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_009342	AC	3	6	3313371	3313376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7607	NC_009342	GAT	2	6	3313450	3313455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_009342	T	7	7	3313455	3313461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_009342	GCA	2	6	3313488	3313493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_009342	CGG	2	6	3313648	3313653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_009342	CA	3	6	3313810	3313815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7612	NC_009342	T	6	6	3313965	3313970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_009342	ACA	2	6	3313995	3314000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_009342	ATT	2	6	3314139	3314144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.