MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 6213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008610	TAGA	2	8	771270	771277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008610	TTA	2	6	771293	771298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008610	AT	3	6	771381	771386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008610	TAG	2	6	771794	771799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008610	A	6	6	773190	773195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008610	ACA	2	6	773203	773208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_008610	GTA	2	6	773232	773237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_008610	ACC	2	6	773304	773309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_008610	CTT	2	6	773315	773320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_008610	CAT	2	6	773349	773354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_008610	T	7	7	773388	773394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008610	TCA	2	6	773407	773412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_008610	AAC	2	6	773437	773442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_008610	CATT	2	8	773472	773479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_008610	TTAAA	2	10	773503	773512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008610	ATCA	2	8	775629	775636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_008610	A	6	6	775690	775695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008610	CTT	2	6	775705	775710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_008610	AATT	2	8	775806	775813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008610	TCA	2	6	775818	775823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008610	T	6	6	775885	775890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008610	AAAT	2	8	775951	775958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_008610	CTT	2	6	776035	776040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_008610	TA	3	6	776050	776055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008610	ATA	2	6	778563	778568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008610	TAT	2	6	778588	778593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008610	T	6	6	778593	778598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008610	A	6	6	778602	778607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008610	CGT	2	6	778619	778624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008610	TAA	2	6	778651	778656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_008610	ACA	2	6	778701	778706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_008610	A	6	6	778706	778711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008610	TGA	2	6	778720	778725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008610	CTC	2	6	778771	778776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_008610	ATA	2	6	778807	778812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008610	TTG	2	6	778818	778823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_008610	TCT	2	6	778846	778851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_008610	GT	3	6	778886	778891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_008610	ACCT	2	8	778896	778903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_008610	TCA	2	6	778918	778923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_008610	TGA	2	6	779050	779055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008610	GAA	2	6	779081	779086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008610	TCAG	2	8	779132	779139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_008610	GAA	2	6	779162	779167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008610	AAG	2	6	779169	779174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008610	ACA	2	6	779187	779192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_008610	TCT	2	6	779198	779203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_008610	GCA	2	6	779207	779212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_008610	TGA	2	6	779216	779221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_008610	ATTTA	2	10	779381	779390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_008610	TTTA	2	8	779516	779523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_008610	ACCAA	2	10	779571	779580	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4053	NC_008610	GT	3	6	779608	779613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008610	T	7	7	779621	779627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008610	TAA	2	6	779635	779640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008610	ATCA	2	8	779662	779669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4058	NC_008610	CT	3	6	779685	779690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_008610	TCA	2	6	779711	779716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_008610	TCT	3	9	779749	779757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_008610	A	6	6	783952	783957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008610	A	6	6	784427	784432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008610	ATT	2	6	784452	784457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008610	TAA	2	6	784470	784475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_008610	A	6	6	784478	784483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008610	TAA	2	6	784516	784521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008610	TCA	2	6	786749	786754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_008610	GTT	2	6	786802	786807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008610	TTC	2	6	786843	786848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_008610	TTG	2	6	786850	786855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008610	TTG	2	6	788039	788044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008610	AAC	2	6	788089	788094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_008610	T	6	6	788100	788105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008610	A	7	7	789541	789547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008610	TAA	2	6	791141	791146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008610	A	6	6	791165	791170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_008610	AACAA	2	10	791225	791234	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4078	NC_008610	A	7	7	791233	791239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_008610	TTA	2	6	791240	791245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_008610	TAA	2	6	791404	791409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_008610	AAT	2	6	791490	791495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_008610	TGAAA	2	10	791526	791535	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008610	AGTT	2	8	791578	791585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008610	AT	3	6	793965	793970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_008610	CAT	2	6	795212	795217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_008610	TTA	3	9	795265	795273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_008610	T	6	6	795275	795280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008610	AAC	2	6	795286	795291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008610	ATA	2	6	795317	795322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008610	CAT	2	6	795423	795428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_008610	ACA	2	6	795434	795439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008610	ATA	2	6	795488	795493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008610	TCA	2	6	795542	795547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4099	NC_008610	TTG	2	6	795701	795706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008610	ATGA	2	8	795796	795803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008610	ATG	2	6	795835	795840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008610	ATC	2	6	795852	795857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008610	CTA	2	6	795861	795866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_008610	TG	3	6	795904	795909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_008610	TAT	2	6	795932	795937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_008610	TAAA	2	8	795969	795976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008610	ATA	2	6	796073	796078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008610	A	7	7	796086	796092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008610	ATTTT	2	10	796103	796112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008610	A	6	6	796126	796131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008610	CAT	2	6	796132	796137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_008610	CT	3	6	797887	797892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_008610	A	7	7	798296	798302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008610	ATTT	2	8	798317	798324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008610	ATT	2	6	798362	798367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008610	AGC	2	6	798372	798377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_008610	C	7	7	798380	798386	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4118	NC_008610	AGT	2	6	798447	798452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_008610	GAT	2	6	798515	798520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_008610	GGTACA	2	12	798521	798532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4121	NC_008610	AAAAC	2	10	798547	798556	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4122	NC_008610	ACAA	2	8	801193	801200	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_008610	GCTAT	2	10	801205	801214	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4124	NC_008610	TAT	2	6	801228	801233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008610	TTAA	2	8	801870	801877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_008610	T	6	6	811581	811586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_008610	T	6	6	811617	811622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_008610	ATT	2	6	811666	811671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_008610	T	6	6	811696	811701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_008610	ATTT	2	8	811710	811717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_008610	TG	3	6	811740	811745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_008610	TAT	2	6	811755	811760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_008610	T	6	6	811768	811773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_008610	ATT	2	6	811781	811786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_008610	T	6	6	811826	811831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_008610	A	6	6	811837	811842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_008610	T	7	7	811857	811863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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