MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 6213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008610	T	6	6	307459	307464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008610	A	8	8	307468	307475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008610	ATTTT	2	10	307483	307492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008610	ATTT	2	8	307554	307561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008610	T	6	6	307595	307600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008610	CAT	2	6	307609	307614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_008610	T	6	6	307657	307662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008610	T	6	6	307681	307686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008610	A	6	6	308084	308089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_008610	CCT	2	6	308098	308103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_008610	GCT	2	6	308134	308139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_008610	T	7	7	308143	308149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008610	GC	3	6	308160	308165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_008610	GTA	2	6	308175	308180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008610	ATT	2	6	308225	308230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008610	GTTT	2	8	308308	308315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008610	CAAG	2	8	308497	308504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_008610	TTA	2	6	308548	308553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_008610	TGG	2	6	308561	308566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008610	TAGA	2	8	308649	308656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008610	TGA	2	6	308668	308673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008610	ATT	2	6	308772	308777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008610	A	6	6	308849	308854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008610	T	8	8	308887	308894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008610	AT	3	6	308911	308916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008610	ATT	2	6	308937	308942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008610	ATC	2	6	309000	309005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_008610	GTA	2	6	309041	309046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008610	TAAAA	2	10	309114	309123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008610	A	7	7	309120	309126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008610	TTGA	2	8	309175	309182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008610	AAT	2	6	312307	312312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008610	GAT	2	6	312327	312332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008610	AAT	2	6	312346	312351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008610	ATT	2	6	312375	312380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008610	ATT	2	6	312400	312405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008610	TAT	2	6	312425	312430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008610	AC	3	6	312479	312484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_008610	TTA	2	6	312514	312519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008610	AGG	2	6	312525	312530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008610	T	6	6	313977	313982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008610	TAA	2	6	313989	313994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008610	AATA	2	8	314006	314013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008610	T	7	7	314015	314021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008610	TTTA	2	8	314047	314054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008610	TTC	2	6	314197	314202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_008610	ATT	2	6	314216	314221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_008610	ATA	2	6	314311	314316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008610	TGT	3	9	314371	314379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008610	T	6	6	314433	314438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008610	ATTC	2	8	314442	314449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_008610	ATC	2	6	314464	314469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_008610	TTG	2	6	314473	314478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008610	ATA	2	6	314533	314538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008610	ACT	2	6	314555	314560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_008610	TAT	2	6	314576	314581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008610	TAATT	2	10	314582	314591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008610	T	6	6	314634	314639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008610	GAT	2	6	314645	314650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008610	A	6	6	314668	314673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008610	GTT	2	6	314681	314686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008610	CTA	2	6	314711	314716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_008610	ATTTTC	2	12	314728	314739	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1564	NC_008610	TC	3	6	314738	314743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_008610	ATA	2	6	314755	314760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008610	T	6	6	314791	314796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_008610	ATAA	2	8	314884	314891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008610	AAT	2	6	314924	314929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008610	AGG	2	6	314943	314948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008610	T	6	6	314957	314962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_008610	AAT	2	6	314970	314975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_008610	TAA	3	9	315061	315069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_008610	TA	3	6	315119	315124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_008610	AGA	2	6	315144	315149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_008610	CATT	2	8	315245	315252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_008610	TA	3	6	315259	315264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008610	TAC	2	6	315271	315276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_008610	AAG	2	6	315297	315302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008610	TAA	2	6	315356	315361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008610	A	7	7	315366	315372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008610	A	7	7	316486	316492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008610	TTA	2	6	316833	316838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008610	T	7	7	322769	322775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008610	TG	3	6	322877	322882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_008610	TAA	2	6	322889	322894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_008610	T	7	7	322908	322914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008610	TGA	2	6	322934	322939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_008610	GTT	2	6	323252	323257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008610	T	6	6	323279	323284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_008610	ATG	2	6	323525	323530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008610	TAA	3	9	323569	323577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008610	C	6	6	323582	323587	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1594	NC_008610	A	7	7	323601	323607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008610	GAA	2	6	323626	323631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008610	TTGT	2	8	323637	323644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008610	ACA	2	6	323659	323664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_008610	AAT	2	6	323675	323680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_008610	TAC	3	9	323771	323779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_008610	ACT	2	6	323781	323786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_008610	AAT	2	6	323819	323824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_008610	AAT	2	6	323832	323837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008610	TTC	2	6	323871	323876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_008610	GAT	2	6	323916	323921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008610	ATC	3	9	323932	323940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_008610	TAAT	2	8	323951	323958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_008610	AGT	2	6	324003	324008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008610	AGA	2	6	324055	324060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008610	AAT	2	6	324085	324090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008610	TTGTG	2	10	324207	324216	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_008610	ATA	2	6	324266	324271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008610	AG	3	6	324300	324305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_008610	ATA	2	6	324325	324330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_008610	GAT	2	6	324344	324349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008610	T	7	7	324349	324355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_008610	TTTCA	2	10	324363	324372	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1617	NC_008610	ATT	2	6	324393	324398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008610	ACC	2	6	324403	324408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_008610	ATA	2	6	324416	324421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_008610	A	6	6	324451	324456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008610	AAAT	2	8	324531	324538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_008610	TAT	2	6	324565	324570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008610	T	7	7	324570	324576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008610	T	6	6	324670	324675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008610	T	6	6	324731	324736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008610	AGC	2	6	324769	324774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_008610	CTT	2	6	324777	324782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_008610	T	6	6	324789	324794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008610	TTA	2	6	324827	324832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008610	T	8	8	324890	324897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_008610	A	6	6	324938	324943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008610	TGC	2	6	325003	325008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_008610	GAT	2	6	325048	325053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_008610	TAA	2	6	325123	325128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_008610	T	6	6	325138	325143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_008610	TG	3	6	325168	325173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_008610	T	6	6	325209	325214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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