MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 6213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008610	TGA	2	6	1135834	1135839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008610	TCA	2	6	1135868	1135873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_008610	ATA	2	6	1135905	1135910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_008610	TTA	2	6	1135914	1135919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_008610	TACC	2	8	1135971	1135978	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_008610	ACG	2	6	1135989	1135994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_008610	AAT	2	6	1136128	1136133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008610	AGAA	2	8	1136142	1136149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_008610	A	6	6	1136224	1136229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_008610	AT	4	8	1136247	1136254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_008610	ATG	2	6	1136268	1136273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_008610	TGAT	2	8	1136302	1136309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_008610	CAAA	2	8	1136346	1136353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_008610	A	6	6	1136369	1136374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_008610	A	6	6	1136404	1136409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_008610	A	7	7	1136491	1136497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_008610	A	6	6	1136507	1136512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_008610	CAA	2	6	1136527	1136532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_008610	TAT	2	6	1136540	1136545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008610	CTT	2	6	1136563	1136568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_008610	A	7	7	1136596	1136602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_008610	TTA	2	6	1136606	1136611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_008610	T	9	9	1136672	1136680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008610	AAG	2	6	1136730	1136735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_008610	CAAAA	2	10	1136762	1136771	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6026	NC_008610	A	6	6	1136768	1136773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_008610	CTA	2	6	1136775	1136780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_008610	T	6	6	1136837	1136842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_008610	TTG	2	6	1136908	1136913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_008610	CAAA	2	8	1137005	1137012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_008610	ATT	2	6	1137022	1137027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_008610	CTTTA	2	10	1137048	1137057	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6033	NC_008610	GCT	2	6	1137062	1137067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_008610	GTA	2	6	1137085	1137090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_008610	T	6	6	1137132	1137137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_008610	TGA	2	6	1137182	1137187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_008610	AAG	2	6	1137196	1137201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_008610	GGA	2	6	1137237	1137242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_008610	TAT	2	6	1137270	1137275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_008610	AAATA	2	10	1137312	1137321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_008610	GTA	2	6	1137336	1137341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_008610	T	6	6	1137376	1137381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_008610	TGA	2	6	1137391	1137396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_008610	TGA	2	6	1137400	1137405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_008610	TGT	2	6	1137429	1137434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_008610	T	6	6	1137437	1137442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_008610	AAAT	2	8	1137448	1137455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_008610	TAT	2	6	1137461	1137466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_008610	CGC	2	6	1137494	1137499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6051	NC_008610	TTTA	2	8	1137508	1137515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_008610	ACTT	2	8	1137527	1137534	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_008610	GAA	2	6	1137595	1137600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008610	T	6	6	1137641	1137646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008610	A	7	7	1137652	1137658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_008610	GAAC	2	8	1137669	1137676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_008610	A	6	6	1137696	1137701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_008610	A	6	6	1137713	1137718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_008610	ACCA	2	8	1137728	1137735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_008610	AAT	2	6	1137756	1137761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_008610	AAG	2	6	1138047	1138052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_008610	ATGA	2	8	1138064	1138071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_008610	AG	3	6	1138125	1138130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_008610	ATA	2	6	1138160	1138165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_008610	TACT	2	8	1138168	1138175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_008610	ATC	2	6	1140485	1140490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6068	NC_008610	TTTA	2	8	1140518	1140525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_008610	CAA	2	6	1140538	1140543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_008610	ATT	2	6	1146096	1146101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_008610	AT	3	6	1148154	1148159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_008610	AT	3	6	1148171	1148176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_008610	TA	3	6	1148181	1148186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_008610	T	6	6	1148206	1148211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_008610	T	7	7	1148213	1148219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_008610	TAAAC	2	10	1148902	1148911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6079	NC_008610	TAC	2	6	1152179	1152184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_008610	CA	3	6	1152995	1153000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6083	NC_008610	AAC	2	6	1154047	1154052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_008610	AT	4	8	1154063	1154070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6087	NC_008610	ACACA	2	10	1154095	1154104	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6093	NC_008610	T	7	7	1155272	1155278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6099	NC_008610	TAT	2	6	1155416	1155421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6101	NC_008610	AAGAA	2	10	1155525	1155534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_008610	AAT	2	6	1155552	1155557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_008610	TAG	2	6	1155597	1155602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6105	NC_008610	ATA	2	6	1155644	1155649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6109	NC_008610	ATT	2	6	1155739	1155744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6111	NC_008610	A	6	6	1155780	1155785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6116	NC_008610	ATTTA	2	10	1155949	1155958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_008610	A	6	6	1155963	1155968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6123	NC_008610	AAATT	2	10	1156224	1156233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6129	NC_008610	TCT	2	6	1156441	1156446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_008610	ATA	2	6	1156485	1156490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.