MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 10625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	TAAA	2	8	24	31	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008593	TAA	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008593	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008593	TCA	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008593	ATA	3	9	127	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008593	A	6	6	171	176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008593	AAT	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008593	CAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008593	TA	4	8	236	243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008593	GAT	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008593	TA	3	6	309	314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008593	A	7	7	314	320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008593	TGG	2	6	480	485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008593	A	8	8	505	512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008593	TA	3	6	521	526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008593	AGG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008593	ACA	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008593	CTTT	2	8	2540	2547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008593	TAA	2	6	2555	2560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008593	A	6	6	2559	2564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008593	GAA	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008593	ATT	2	6	6635	6640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008593	TA	3	6	6650	6655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008593	TAA	2	6	7492	7497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008593	AT	3	6	7498	7503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008593	T	6	6	7564	7569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008593	TA	4	8	7574	7581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008593	AT	4	8	7609	7616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008593	TAAAA	2	10	7638	7647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008593	GGTTT	2	10	7671	7680	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008593	G	6	6	7682	7687	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008593	GGA	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008593	ATAA	2	8	9875	9882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008593	TCC	2	6	10538	10543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008593	AAAG	2	8	10563	10570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008593	AAT	2	6	10582	10587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008593	TA	3	6	11293	11298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008593	ATT	2	6	11307	11312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008593	TAT	2	6	11318	11323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008593	ATT	2	6	11324	11329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008593	TAT	2	6	11338	11343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008593	TA	3	6	11351	11356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008593	ATA	2	6	11361	11366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008593	A	7	7	11371	11377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008593	AAT	2	6	11391	11396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008593	TAT	2	6	11416	11421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008593	AAATAA	2	12	11677	11688	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008593	A	6	6	11723	11728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008593	CTG	2	6	11737	11742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008593	GAG	2	6	11772	11777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008593	AGG	2	6	12559	12564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008593	T	6	6	12845	12850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008593	TA	3	6	12873	12878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008593	AT	3	6	12906	12911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008593	AT	5	10	12929	12938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008593	AT	3	6	12942	12947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008593	GGA	2	6	13280	13285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008593	A	6	6	16817	16822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008593	ATA	2	6	16843	16848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008593	TAG	2	6	18706	18711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008593	GA	3	6	18712	18717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008593	T	7	7	20086	20092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008593	A	6	6	20535	20540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008593	CCT	2	6	20541	20546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008593	AT	3	6	20549	20554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008593	TTTA	2	8	20562	20569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008593	TA	3	6	20612	20617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008593	AAAG	2	8	20632	20639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008593	A	6	6	20649	20654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008593	ATA	3	9	20710	20718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008593	TAATA	2	10	20724	20733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008593	A	6	6	20745	20750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008593	AAG	2	6	20755	20760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008593	ATT	2	6	20768	20773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008593	TA	4	8	20815	20822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008593	TTA	2	6	20914	20919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008593	T	6	6	20961	20966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008593	AG	3	6	20987	20992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008593	GTA	2	6	20993	20998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008593	A	7	7	21005	21011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008593	GTA	2	6	21045	21050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008593	ATA	2	6	21053	21058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008593	TTTA	2	8	22892	22899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008593	TAA	2	6	22912	22917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008593	TA	3	6	22950	22955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008593	TAT	2	6	22963	22968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008593	ATA	2	6	22976	22981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008593	AGT	2	6	22993	22998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008593	TTTG	2	8	23012	23019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008593	A	6	6	23025	23030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008593	TA	3	6	23050	23055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008593	ATAA	2	8	23060	23067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008593	TA	3	6	25902	25907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008593	T	6	6	25935	25940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008593	ATT	2	6	25951	25956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008593	ATT	2	6	27209	27214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008593	TAA	2	6	27244	27249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008593	TAT	2	6	27304	27309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008593	ATA	2	6	27310	27315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008593	G	6	6	27372	27377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008593	TAT	2	6	27663	27668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008593	TA	3	6	27686	27691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008593	TAAA	2	8	27709	27716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008593	A	6	6	27729	27734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008593	TCC	2	6	29024	29029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008593	ATTT	2	8	30205	30212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008593	AAT	2	6	30213	30218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008593	GTT	2	6	30222	30227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008593	T	6	6	30226	30231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008593	TAA	2	6	30244	30249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008593	ATT	3	9	30251	30259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008593	ATA	2	6	30283	30288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008593	AGG	2	6	30309	30314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008593	ATA	2	6	31133	31138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008593	TAAT	2	8	31170	31177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008593	A	6	6	31195	31200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008593	T	6	6	31236	31241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008593	TA	3	6	31248	31253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008593	AT	4	8	31271	31278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008593	A	6	6	31305	31310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008593	TTAT	2	8	31314	31321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008593	AGT	2	6	31339	31344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008593	A	6	6	31355	31360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008593	A	6	6	31362	31367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008593	ATT	2	6	31376	31381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008593	TAA	2	6	31383	31388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008593	TAA	2	6	31395	31400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008593	AC	3	6	31425	31430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008593	CTA	2	6	31436	31441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008593	G	6	6	31449	31454	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008593	TAAATA	2	12	32887	32898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008593	ATA	2	6	32903	32908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008593	A	7	7	32923	32929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008593	ATGTA	2	10	32932	32941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008593	AG	3	6	32949	32954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008593	TCG	2	6	34258	34263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008593	TAAA	2	8	34287	34294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008593	TAA	2	6	34534	34539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008593	TATT	2	8	34573	34580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008593	AGG	2	6	34597	34602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008593	TAT	2	6	35375	35380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008593	T	6	6	35429	35434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008593	TAAT	2	8	35440	35447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008593	TC	3	6	36706	36711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008593	TTATG	2	10	36713	36722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008593	TAT	2	6	36734	36739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008593	TAA	2	6	36744	36749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008593	A	6	6	36783	36788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008593	A	6	6	36815	36820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008593	TAAAAA	2	12	36831	36842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008593	A	6	6	36848	36853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008593	TAA	2	6	36854	36859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_008593	TTA	2	6	116050	116055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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