MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 17609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008262	TCA	2	6	2446436	2446441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_008262	TGC	2	6	2446454	2446459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_008262	CTG	2	6	2446493	2446498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_008262	TCG	2	6	2446568	2446573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_008262	CCA	2	6	2446592	2446597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15006	NC_008262	ATG	3	9	2446650	2446658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_008262	CCG	2	6	2446747	2446752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_008262	CGC	2	6	2446805	2446810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15009	NC_008262	TCT	2	6	2446904	2446909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_008262	CTTG	2	8	2446950	2446957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15011	NC_008262	TGA	2	6	2446962	2446967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_008262	TAATA	2	10	2447002	2447011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_008262	ATT	2	6	2447028	2447033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_008262	TCT	2	6	2447042	2447047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_008262	T	8	8	2447066	2447073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_008262	T	7	7	2447116	2447122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_008262	ATT	2	6	2447155	2447160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_008262	ATT	2	6	2447166	2447171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_008262	TA	3	6	2447175	2447180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_008262	CTA	2	6	2447194	2447199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_008262	AAAT	2	8	2447249	2447256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_008262	ATA	2	6	2447282	2447287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_008262	TAC	2	6	2447297	2447302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_008262	TTA	2	6	2447307	2447312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_008262	AT	4	8	2448463	2448470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_008262	T	6	6	2448487	2448492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_008262	TAA	2	6	2448502	2448507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_008262	ATT	2	6	2448527	2448532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_008262	TAG	2	6	2448551	2448556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_008262	TCC	2	6	2448561	2448566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15031	NC_008262	T	8	8	2448567	2448574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_008262	T	6	6	2448576	2448581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_008262	TTTAAT	2	12	2448611	2448622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_008262	TCC	2	6	2450097	2450102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15035	NC_008262	TAAT	2	8	2450113	2450120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_008262	TA	3	6	2450174	2450179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_008262	TAAT	2	8	2450205	2450212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_008262	A	6	6	2450232	2450237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_008262	AAT	2	6	2450250	2450255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_008262	TAAAA	2	10	2450357	2450366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_008262	A	7	7	2450363	2450369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_008262	AAATT	2	10	2450655	2450664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_008262	CGA	2	6	2450837	2450842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_008262	CCA	2	6	2450900	2450905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15045	NC_008262	CG	3	6	2451146	2451151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15046	NC_008262	GTG	2	6	2451178	2451183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_008262	ATT	3	9	2451266	2451274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_008262	T	6	6	2451282	2451287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_008262	T	6	6	2451290	2451295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_008262	AAATT	2	10	2451591	2451600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_008262	ATA	2	6	2451680	2451685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_008262	TTTTG	2	10	2451688	2451697	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_008262	CGA	2	6	2451865	2451870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_008262	CCA	2	6	2451928	2451933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15055	NC_008262	ATTT	2	8	2452027	2452034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_008262	CG	3	6	2452219	2452224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15057	NC_008262	CT	3	6	2452266	2452271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15058	NC_008262	CGA	2	6	2452274	2452279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_008262	TTA	3	9	2452302	2452310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_008262	T	7	7	2452320	2452326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_008262	T	7	7	2452331	2452337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_008262	A	7	7	2452391	2452397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_008262	T	7	7	2452414	2452420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_008262	T	6	6	2452436	2452441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_008262	TCT	2	6	2452927	2452932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_008262	CCTTA	2	10	2454309	2454318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15067	NC_008262	ATTT	2	8	2454319	2454326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_008262	TA	4	8	2454385	2454392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_008262	TAT	2	6	2454441	2454446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_008262	TAA	2	6	2454468	2454473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_008262	AT	4	8	2454486	2454493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_008262	ATA	2	6	2454499	2454504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_008262	TCTT	2	8	2456285	2456292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15074	NC_008262	T	6	6	2456315	2456320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_008262	GATTTA	2	12	2456337	2456348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_008262	AT	3	6	2456360	2456365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_008262	TTA	2	6	2456367	2456372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_008262	TAT	2	6	2456383	2456388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_008262	AAAT	2	8	2456423	2456430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_008262	T	7	7	2456441	2456447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_008262	AAT	2	6	2457999	2458004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_008262	ATT	2	6	2458018	2458023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_008262	AAAT	2	8	2458039	2458046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_008262	AAAT	2	8	2458048	2458055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_008262	ATT	2	6	2458059	2458064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_008262	TATT	2	8	2458070	2458077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_008262	TAA	2	6	2458102	2458107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_008262	ATCA	2	8	2458132	2458139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15089	NC_008262	TA	3	6	2458169	2458174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_008262	TTAT	2	8	2458670	2458677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_008262	TAA	2	6	2458705	2458710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_008262	ATTT	2	8	2458747	2458754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_008262	ATT	2	6	2458755	2458760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_008262	TTA	2	6	2461144	2461149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15096	NC_008262	TAT	2	6	2463456	2463461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15098	NC_008262	ATT	2	6	2463498	2463503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_008262	TAA	2	6	2463516	2463521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_008262	A	6	6	2463520	2463525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_008262	ATTT	2	8	2463553	2463560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_008262	ATA	2	6	2463566	2463571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_008262	ATTT	2	8	2463611	2463618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_008262	AT	3	6	2463620	2463625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_008262	TTAA	2	8	2463632	2463639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_008262	ATT	2	6	2463650	2463655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15112	NC_008262	TTC	2	6	2463827	2463832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_008262	ATT	2	6	2463842	2463847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_008262	A	6	6	2463888	2463893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_008262	CAA	2	6	2463904	2463909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_008262	CTC	3	9	2464155	2464163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15117	NC_008262	ATTTAA	2	12	2464736	2464747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_008262	TAT	2	6	2464784	2464789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_008262	TAT	2	6	2464813	2464818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_008262	ATA	2	6	2464823	2464828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_008262	TA	4	8	2464844	2464851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_008262	TCA	2	6	2464853	2464858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_008262	ATTT	2	8	2464885	2464892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_008262	A	6	6	2464894	2464899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_008262	ATA	2	6	2464906	2464911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_008262	AAATT	2	10	2464921	2464930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_008262	TAAA	2	8	2464987	2464994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_008262	TA	3	6	2464999	2465004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_008262	ATTT	2	8	2465025	2465032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_008262	A	8	8	2465045	2465052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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