MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 17609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008262	ATTC	2	8	2241962	2241969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14002	NC_008262	TCTT	2	8	2242015	2242022	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14003	NC_008262	TTTAA	2	10	2242023	2242032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_008262	AG	3	6	2242041	2242046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_008262	TTAA	2	8	2242051	2242058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_008262	TTA	2	6	2242063	2242068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_008262	AATA	2	8	2242080	2242087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_008262	A	6	6	2242089	2242094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_008262	ATTT	3	12	2242099	2242110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_008262	ATA	2	6	2242138	2242143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_008262	ATT	2	6	2242159	2242164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_008262	ATT	2	6	2242185	2242190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_008262	ATTTTA	2	12	2242225	2242236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_008262	ATT	2	6	2242267	2242272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_008262	ATT	2	6	2242274	2242279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_008262	TA	3	6	2242307	2242312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_008262	A	7	7	2242339	2242345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_008262	TCAA	2	8	2242392	2242399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14019	NC_008262	CTA	2	6	2242422	2242427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_008262	CT	3	6	2245957	2245962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_008262	AT	3	6	2245979	2245984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_008262	AT	3	6	2246008	2246013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_008262	TAAT	2	8	2246020	2246027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_008262	TTA	2	6	2246037	2246042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_008262	ATA	2	6	2246498	2246503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_008262	ATT	2	6	2246525	2246530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_008262	TAA	2	6	2246558	2246563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_008262	TAA	2	6	2247773	2247778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_008262	TAAA	2	8	2247799	2247806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_008262	T	7	7	2247824	2247830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_008262	TAA	2	6	2247832	2247837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_008262	AT	3	6	2247878	2247883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_008262	TAA	2	6	2247920	2247925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_008262	AGG	2	6	2247929	2247934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_008262	TAAA	2	8	2248147	2248154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_008262	AATATT	2	12	2248159	2248170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_008262	TA	3	6	2248195	2248200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_008262	ATA	2	6	2248226	2248231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_008262	A	6	6	2248424	2248429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_008262	TCC	2	6	2251464	2251469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14041	NC_008262	AT	3	6	2251472	2251477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_008262	TTA	2	6	2251484	2251489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_008262	TAA	2	6	2251504	2251509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_008262	A	6	6	2251515	2251520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_008262	CTT	2	6	2251579	2251584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_008262	ATTTT	2	10	2251620	2251629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_008262	CT	3	6	2251648	2251653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14048	NC_008262	TCC	2	6	2255203	2255208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14049	NC_008262	TA	3	6	2258218	2258223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_008262	ATT	2	6	2258316	2258321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_008262	TCT	2	6	2258374	2258379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_008262	AAT	2	6	2258380	2258385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_008262	TAA	2	6	2258456	2258461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_008262	GTT	2	6	2259907	2259912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_008262	TA	3	6	2259913	2259918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_008262	AT	3	6	2259928	2259933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_008262	T	7	7	2259933	2259939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_008262	ATA	2	6	2259963	2259968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_008262	AAAT	2	8	2259975	2259982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_008262	TAA	2	6	2260010	2260015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_008262	TTA	2	6	2260021	2260026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_008262	ACA	2	6	2260030	2260035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_008262	ATT	2	6	2260036	2260041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_008262	TCTT	2	8	2260085	2260092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14065	NC_008262	ACTA	2	8	2260118	2260125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14066	NC_008262	TA	3	6	2260124	2260129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_008262	TTC	2	6	2260139	2260144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_008262	AT	3	6	2260258	2260263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_008262	AAAAC	2	10	2260273	2260282	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14070	NC_008262	AT	3	6	2260311	2260316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_008262	T	7	7	2260316	2260322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_008262	ATA	2	6	2260324	2260329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_008262	ATT	2	6	2260357	2260362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_008262	TTA	2	6	2260369	2260374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_008262	TAAA	2	8	2260380	2260387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_008262	TAA	2	6	2260448	2260453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_008262	TA	3	6	2260457	2260462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_008262	ATT	2	6	2260467	2260472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_008262	ATA	2	6	2260476	2260481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_008262	T	7	7	2260483	2260489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_008262	T	7	7	2260520	2260526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_008262	TAAT	2	8	2260545	2260552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_008262	GATT	2	8	2260564	2260571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_008262	CTCC	2	8	2261822	2261829	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14085	NC_008262	TA	3	6	2261845	2261850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_008262	TAA	2	6	2261852	2261857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_008262	AT	3	6	2261859	2261864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_008262	TAAA	2	8	2262572	2262579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_008262	TAAA	2	8	2262587	2262594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_008262	TAACT	2	10	2262616	2262625	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14091	NC_008262	ATA	2	6	2262662	2262667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_008262	CTT	3	9	2263860	2263868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_008262	TAT	2	6	2263876	2263881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_008262	TTTG	2	8	2263941	2263948	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_008262	AT	3	6	2263958	2263963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_008262	AT	3	6	2263989	2263994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_008262	TAAT	2	8	2264005	2264012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_008262	TAA	2	6	2264014	2264019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_008262	TA	3	6	2264036	2264041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_008262	A	8	8	2264049	2264056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_008262	T	6	6	2264075	2264080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_008262	TC	3	6	2265580	2265585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14103	NC_008262	T	7	7	2265619	2265625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_008262	ATT	2	6	2265673	2265678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_008262	ATC	2	6	2265707	2265712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_008262	TTAAAT	2	12	2265716	2265727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_008262	TAAAA	2	10	2265750	2265759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_008262	TAA	2	6	2265760	2265765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_008262	TCC	2	6	2266670	2266675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14110	NC_008262	GCT	2	6	2266781	2266786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_008262	TAG	2	6	2266912	2266917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_008262	TAT	2	6	2266930	2266935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_008262	T	7	7	2266966	2266972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_008262	ATTT	2	8	2266975	2266982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_008262	TAT	2	6	2267022	2267027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_008262	T	7	7	2267049	2267055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_008262	AATA	2	8	2267056	2267063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_008262	ATT	2	6	2267080	2267085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_008262	T	7	7	2267088	2267094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_008262	TA	3	6	2267122	2267127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_008262	A	7	7	2267133	2267139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_008262	T	7	7	2267165	2267171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_008262	TTA	2	6	2267181	2267186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_008262	ATT	2	6	2267200	2267205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_008262	TAT	2	6	2267206	2267211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_008262	TA	3	6	2267215	2267220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_008262	TCCTTA	2	12	2270956	2270967	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14128	NC_008262	ATA	2	6	2271016	2271021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_008262	TTC	2	6	2271145	2271150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_008262	AAT	2	6	2271183	2271188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_008262	AT	3	6	2271196	2271201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_008262	TTTTA	2	10	2271209	2271218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_008262	ACC	2	6	2272225	2272230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14245	NC_008262	T	6	6	2292488	2292493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14259	NC_008262	TCT	2	6	2296250	2296255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14397	NC_008262	CTT	2	6	2340920	2340925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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