MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 17609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008262	T	7	7	2129731	2129737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_008262	CCT	2	6	2129738	2129743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13503	NC_008262	TAA	2	6	2129744	2129749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_008262	ATTA	2	8	2129755	2129762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_008262	AAT	2	6	2129763	2129768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_008262	CTTG	2	8	2130039	2130046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13507	NC_008262	TAG	2	6	2130049	2130054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_008262	TAA	2	6	2130062	2130067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_008262	TA	3	6	2130085	2130090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_008262	TTA	2	6	2130093	2130098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_008262	ATC	2	6	2130101	2130106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_008262	ATT	2	6	2130116	2130121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_008262	ATT	2	6	2130128	2130133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_008262	GCT	2	6	2130141	2130146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_008262	ATT	3	9	2130267	2130275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_008262	TA	4	8	2130281	2130288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_008262	ATG	2	6	2130298	2130303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_008262	TAA	3	9	2130313	2130321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_008262	TTG	2	6	2130333	2130338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_008262	ACC	2	6	2132172	2132177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13521	NC_008262	TAT	2	6	2132188	2132193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_008262	ATA	2	6	2132244	2132249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13524	NC_008262	TCC	2	6	2132813	2132818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13525	NC_008262	T	6	6	2132819	2132824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_008262	ATT	2	6	2133556	2133561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_008262	TATAA	3	15	2133566	2133580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13529	NC_008262	AAT	2	6	2133598	2133603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_008262	T	6	6	2133616	2133621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_008262	TAT	2	6	2133637	2133642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13534	NC_008262	TTA	2	6	2136291	2136296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_008262	T	7	7	2136363	2136369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_008262	ATT	2	6	2136370	2136375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13541	NC_008262	T	7	7	2137859	2137865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_008262	ATA	2	6	2138270	2138275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_008262	AAC	2	6	2138276	2138281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13547	NC_008262	TC	3	6	2139362	2139367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13548	NC_008262	T	8	8	2139381	2139388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_008262	TTA	2	6	2139411	2139416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_008262	T	6	6	2139458	2139463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_008262	AT	3	6	2139464	2139469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_008262	TAG	2	6	2139514	2139519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_008262	ATA	2	6	2139578	2139583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_008262	AT	3	6	2139595	2139600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_008262	T	7	7	2139606	2139612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_008262	TTTTA	2	10	2139619	2139628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_008262	ATT	2	6	2139641	2139646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_008262	TGTT	2	8	2139649	2139656	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_008262	ATT	2	6	2144142	2144147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_008262	TCC	2	6	2144659	2144664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13561	NC_008262	ATT	2	6	2144670	2144675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_008262	AT	3	6	2144686	2144691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_008262	ATT	3	9	2144756	2144764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_008262	TTAG	2	8	2144771	2144778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_008262	TA	3	6	2144795	2144800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_008262	TAA	2	6	2144813	2144818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_008262	AGG	2	6	2144823	2144828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_008262	TAT	2	6	2145129	2145134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_008262	ATT	2	6	2145177	2145182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_008262	ATA	2	6	2145183	2145188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13573	NC_008262	TTAT	2	8	2145442	2145449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_008262	TA	3	6	2145471	2145476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_008262	T	6	6	2145493	2145498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13577	NC_008262	TTATA	2	10	2146177	2146186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_008262	TCTT	2	8	2146228	2146235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13579	NC_008262	TAT	3	9	2146236	2146244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_008262	TTA	2	6	2146247	2146252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13597	NC_008262	AAG	2	6	2148593	2148598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13599	NC_008262	AGTG	2	8	2148625	2148632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_008262	GGT	2	6	2148649	2148654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13602	NC_008262	GAT	2	6	2148699	2148704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_008262	T	7	7	2148708	2148714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_008262	AT	3	6	2148729	2148734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_008262	TAT	2	6	2148745	2148750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13608	NC_008262	A	7	7	2148821	2148827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_008262	AT	3	6	2148843	2148848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_008262	GTT	2	6	2148868	2148873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13612	NC_008262	ACTTTA	2	12	2149924	2149935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13613	NC_008262	A	6	6	2149935	2149940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_008262	TAA	2	6	2149980	2149985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13617	NC_008262	T	7	7	2150912	2150918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_008262	A	7	7	2150922	2150928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_008262	T	7	7	2152045	2152051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_008262	GTT	2	6	2152613	2152618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_008262	AT	3	6	2152635	2152640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_008262	TAT	2	6	2154839	2154844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_008262	CTC	2	6	2154845	2154850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13625	NC_008262	TTA	2	6	2154887	2154892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_008262	ATA	2	6	2154895	2154900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_008262	AT	3	6	2154978	2154983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_008262	A	6	6	2154985	2154990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13629	NC_008262	ATT	2	6	2155003	2155008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13630	NC_008262	TAT	2	6	2155009	2155014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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