MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 17609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008262	AATAT	2	10	75210	75219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008262	GT	3	6	75236	75241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008262	AT	3	6	75244	75249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008262	TAAAT	2	10	75318	75327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008262	ATA	2	6	75346	75351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008262	CAA	2	6	75370	75375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008262	A	7	7	75374	75380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008262	GAAA	2	8	75392	75399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008262	T	6	6	75413	75418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008262	A	7	7	75419	75425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008262	TGA	2	6	75446	75451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008262	AAG	2	6	75459	75464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008262	AGA	2	6	75506	75511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008262	GGC	2	6	75604	75609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008262	GCG	2	6	75662	75667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008262	CAT	3	9	75757	75765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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518	NC_008262	CGA	2	6	75842	75847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_008262	GCA	2	6	75916	75921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008262	GCA	2	6	75956	75961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008262	CGC	2	6	75963	75968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_008262	GTGA	2	8	75969	75976	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008262	AGG	2	6	76032	76037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008262	CAG	2	6	76059	76064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008262	GAT	2	6	76128	76133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008262	TGC	2	6	76169	76174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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529	NC_008262	CT	3	6	76275	76280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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531	NC_008262	GAA	2	6	76512	76517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008262	GGT	2	6	76586	76591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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534	NC_008262	TCGTG	2	10	76609	76618	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
535	NC_008262	GTTA	2	8	76659	76666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_008262	AG	3	6	76788	76793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008262	AC	3	6	76931	76936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_008262	AGG	2	6	76990	76995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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543	NC_008262	GAT	2	6	77107	77112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008262	ATA	2	6	77125	77130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008262	GA	3	6	77146	77151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008262	TC	3	6	77155	77160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_008262	TAATT	2	10	77186	77195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008262	ACA	2	6	77203	77208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008262	GGA	2	6	77476	77481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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551	NC_008262	TAG	2	6	77505	77510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008262	GCGA	2	8	77513	77520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_008262	ACATA	2	10	77564	77573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
554	NC_008262	ACC	2	6	77713	77718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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558	NC_008262	TGA	2	6	77853	77858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008262	GGA	2	6	78028	78033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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563	NC_008262	AGC	2	6	78371	78376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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565	NC_008262	GA	3	6	78412	78417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008262	ACC	2	6	78450	78455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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572	NC_008262	AG	4	8	78882	78889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008262	AGT	2	6	78891	78896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_008262	AT	3	6	82115	82120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008262	ATA	2	6	82122	82127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008262	TTC	2	6	82859	82864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008262	AAAT	2	8	82885	82892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008262	TAC	2	6	82944	82949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_008262	TTAA	2	8	82978	82985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008262	ATTA	2	8	83048	83055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008262	ATT	2	6	83081	83086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008262	AT	3	6	83100	83105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008262	AT	3	6	83120	83125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008262	CA	3	6	83133	83138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_008262	TAA	2	6	83139	83144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_008262	TA	3	6	83992	83997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008262	AATT	2	8	84014	84021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008262	TAG	2	6	84044	84049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008262	AG	3	6	84078	84083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008262	A	7	7	84095	84101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_008262	TAA	2	6	84108	84113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_008262	AG	3	6	84135	84140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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635	NC_008262	ATT	3	9	85233	85241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_008262	TAT	2	6	85387	85392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008262	ATTAA	2	10	85405	85414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008262	ATAA	2	8	85421	85428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008262	A	6	6	85427	85432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008262	TTA	2	6	85447	85452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_008262	ATT	2	6	85480	85485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_008262	AT	3	6	85490	85495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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