MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 6083

< Previous12345678910111213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007974	C	6	6	2537623	2537628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6002	NC_007974	CGGG	2	8	2537672	2537679	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_007974	GGA	2	6	2537690	2537695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_007974	G	6	6	2538807	2538812	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_007974	CG	4	8	2540718	2540725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_007974	GCA	2	6	2540726	2540731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_007974	CAC	2	6	2540766	2540771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_007974	AAG	2	6	2540808	2540813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_007974	TGA	2	6	2540853	2540858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_007974	TGGCG	2	10	2540880	2540889	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6011	NC_007974	CG	3	6	2540888	2540893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_007974	GGC	2	6	2540894	2540899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_007974	GCGG	2	8	2543255	2543262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_007974	CCA	2	6	2543304	2543309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_007974	GCA	2	6	2543606	2543611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_007974	GAG	2	6	2543631	2543636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_007974	TAC	2	6	2544925	2544930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_007974	CAG	2	6	2545244	2545249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_007974	GACAT	2	10	2546037	2546046	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6020	NC_007974	AGG	2	6	2546087	2546092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_007974	TGC	2	6	2546108	2546113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_007974	CGA	2	6	2546155	2546160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_007974	AGG	2	6	2546173	2546178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_007974	A	6	6	2546388	2546393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_007974	GCG	2	6	2546399	2546404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_007974	GCC	2	6	2546421	2546426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_007974	ACA	2	6	2550528	2550533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_007974	CCG	2	6	2551955	2551960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_007974	GCT	2	6	2558662	2558667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_007974	TCGTG	2	10	2558688	2558697	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6031	NC_007974	G	6	6	2562345	2562350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_007974	GCC	2	6	2562354	2562359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_007974	GCG	2	6	2562363	2562368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_007974	GC	3	6	2562405	2562410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_007974	CGTG	2	8	2562439	2562446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_007974	TCCT	2	8	2563314	2563321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_007974	GC	3	6	2564378	2564383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_007974	GCA	2	6	2565727	2565732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_007974	TGC	2	6	2565742	2565747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_007974	GGT	2	6	2565787	2565792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_007974	GCC	2	6	2568232	2568237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_007974	ACA	2	6	2568285	2568290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_007974	CGC	2	6	2568293	2568298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_007974	CGCTG	2	10	2568372	2568381	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6045	NC_007974	TACC	2	8	2568404	2568411	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_007974	GA	3	6	2573336	2573341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_007974	CCG	2	6	2573385	2573390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_007974	TCA	2	6	2573413	2573418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_007974	GCGGT	2	10	2573730	2573739	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6050	NC_007974	CCA	2	6	2574261	2574266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_007974	GC	3	6	2574267	2574272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_007974	GC	3	6	2574279	2574284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_007974	CTG	2	6	2574330	2574335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_007974	CGC	2	6	2574337	2574342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_007974	CGC	2	6	2574355	2574360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_007974	GAC	2	6	2574370	2574375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_007974	GAA	2	6	2574913	2574918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_007974	GGC	2	6	2574969	2574974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_007974	TGGAT	2	10	2577092	2577101	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_007974	CG	3	6	2577129	2577134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_007974	GTG	2	6	2577146	2577151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_007974	TCC	2	6	2577264	2577269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_007974	TCC	2	6	2577372	2577377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_007974	GGTG	2	8	2577469	2577476	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_007974	GCA	2	6	2577517	2577522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_007974	CCG	2	6	2577530	2577535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_007974	ATGGC	2	10	2577560	2577569	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6068	NC_007974	GAAA	2	8	2577580	2577587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_007974	GCC	2	6	2577601	2577606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_007974	GCC	2	6	2577630	2577635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_007974	GCC	2	6	2579038	2579043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_007974	GAT	2	6	2579092	2579097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_007974	TTG	2	6	2579112	2579117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_007974	CGA	2	6	2579194	2579199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_007974	TCCTT	2	10	2579252	2579261	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6076	NC_007974	GGT	2	6	2579275	2579280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_007974	GT	3	6	2579279	2579284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_007974	T	8	8	2579306	2579313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_007974	GAA	2	6	2579573	2579578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_007974	T	7	7	2579596	2579602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_007974	CAAGC	2	10	2579627	2579636	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6082	NC_007974	CCA	2	6	2579973	2579978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_007974	CCA	2	6	2580073	2580078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

< Previous12345678910111213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.