MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 6083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007974	CGGA	2	8	2163868	2163875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_007974	CCA	2	6	2163876	2163881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_007974	GAG	2	6	2163883	2163888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_007974	GCC	2	6	2165200	2165205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_007974	TC	3	6	2171164	2171169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_007974	AG	3	6	2171192	2171197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_007974	GC	3	6	2171257	2171262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_007974	CCGG	2	8	2171269	2171276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_007974	CGT	2	6	2171489	2171494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_007974	GA	3	6	2171508	2171513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_007974	CGG	2	6	2172465	2172470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_007974	CGC	2	6	2172537	2172542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_007974	GC	3	6	2172541	2172546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_007974	GAA	2	6	2172577	2172582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_007974	GCT	2	6	2172707	2172712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_007974	CA	3	6	2172764	2172769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_007974	AC	3	6	2172788	2172793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_007974	C	6	6	2174009	2174014	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5019	NC_007974	TGCG	2	8	2174019	2174026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_007974	CACG	2	8	2174035	2174042	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_007974	GC	3	6	2174065	2174070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_007974	ACC	2	6	2174084	2174089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_007974	TGG	2	6	2174092	2174097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_007974	ATC	2	6	2174099	2174104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_007974	AGA	2	6	2174171	2174176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_007974	ATTC	2	8	2174206	2174213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_007974	GACA	2	8	2174219	2174226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_007974	ACCT	2	8	2174236	2174243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_007974	CGG	2	6	2174247	2174252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_007974	TCCGC	2	10	2174257	2174266	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5031	NC_007974	GC	3	6	2174389	2174394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_007974	GGC	2	6	2174409	2174414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_007974	AGA	2	6	2174415	2174420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_007974	GCCT	2	8	2174746	2174753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_007974	TGC	2	6	2174768	2174773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_007974	CCA	2	6	2174774	2174779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_007974	AGCA	2	8	2174799	2174806	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_007974	CCG	2	6	2175095	2175100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_007974	TCGT	2	8	2175538	2175545	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_007974	CGG	2	6	2175553	2175558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_007974	CAGTGA	2	12	2175594	2175605	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5042	NC_007974	ACTCT	2	10	2175934	2175943	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5043	NC_007974	GCT	2	6	2176024	2176029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_007974	GACTT	2	10	2176030	2176039	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_007974	TTC	2	6	2176133	2176138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_007974	AGA	2	6	2176143	2176148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_007974	GAG	2	6	2176182	2176187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_007974	GCCA	2	8	2177148	2177155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_007974	GC	3	6	2177164	2177169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_007974	GC	3	6	2178078	2178083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_007974	A	7	7	2178104	2178110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_007974	CG	3	6	2178166	2178171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_007974	TGA	2	6	2179363	2179368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_007974	GGC	2	6	2180255	2180260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_007974	GCC	2	6	2180268	2180273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_007974	CCA	2	6	2181317	2181322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_007974	GCG	2	6	2182474	2182479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_007974	TCG	2	6	2182531	2182536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_007974	CGA	2	6	2182541	2182546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_007974	CCG	2	6	2182590	2182595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_007974	CCT	2	6	2185365	2185370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_007974	CGC	2	6	2185375	2185380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_007974	ATCC	2	8	2185384	2185391	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_007974	GGAA	2	8	2186580	2186587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_007974	TCG	2	6	2186635	2186640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_007974	CGA	2	6	2186645	2186650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_007974	ATC	2	6	2186682	2186687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_007974	CGA	2	6	2186693	2186698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_007974	CGC	2	6	2186713	2186718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_007974	GCAG	2	8	2186732	2186739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_007974	TCC	2	6	2190011	2190016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_007974	TGC	2	6	2190045	2190050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_007974	GCG	2	6	2190057	2190062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_007974	TCG	2	6	2190081	2190086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_007974	CAG	2	6	2190100	2190105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_007974	TCG	2	6	2190133	2190138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_007974	CGA	2	6	2190143	2190148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_007974	TGT	3	9	2190732	2190740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_007974	TCC	2	6	2190786	2190791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_007974	TTG	2	6	2190841	2190846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_007974	CG	3	6	2190852	2190857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_007974	CGG	2	6	2190877	2190882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_007974	TGCAG	2	10	2190893	2190902	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5084	NC_007974	TTGC	2	8	2195081	2195088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_007974	GTT	2	6	2198097	2198102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_007974	GCA	2	6	2198115	2198120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_007974	CGT	2	6	2198892	2198897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_007974	AGT	2	6	2198918	2198923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_007974	CT	3	6	2198942	2198947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_007974	CG	3	6	2199037	2199042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_007974	GCG	2	6	2199071	2199076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_007974	TCG	2	6	2199101	2199106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_007974	ATC	2	6	2199156	2199161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_007974	GTT	2	6	2199693	2199698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_007974	AAC	2	6	2199718	2199723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_007974	GTA	2	6	2199830	2199835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_007974	GGCG	2	8	2199878	2199885	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_007974	TGGC	2	8	2199911	2199918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_007974	TC	3	6	2202086	2202091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_007974	GCG	2	6	2202168	2202173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_007974	CCA	2	6	2202184	2202189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_007974	GCA	2	6	2202229	2202234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_007974	GGC	2	6	2202468	2202473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_007974	TGT	2	6	2202517	2202522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_007974	GAA	2	6	2202596	2202601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_007974	CCT	2	6	2203799	2203804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_007974	GTC	2	6	2203947	2203952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_007974	CGA	2	6	2204141	2204146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_007974	AGCC	2	8	2204244	2204251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_007974	GCC	2	6	2204273	2204278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_007974	CAAGG	2	10	2204353	2204362	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5112	NC_007974	ACG	2	6	2204438	2204443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_007974	CGA	2	6	2204501	2204506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_007974	GTAT	2	8	2204594	2204601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_007974	A	6	6	2207765	2207770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_007974	GGGA	2	8	2207818	2207825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_007974	ATTT	2	8	2207839	2207846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_007974	TAG	2	6	2207848	2207853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_007974	GCC	2	6	2207997	2208002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_007974	GCT	2	6	2208010	2208015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_007974	AGT	2	6	2209504	2209509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_007974	CGC	2	6	2209931	2209936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_007974	TGAA	2	8	2209937	2209944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_007974	CTTCT	2	10	2209945	2209954	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5125	NC_007974	CGA	2	6	2210452	2210457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_007974	TTG	2	6	2210789	2210794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_007974	GCG	2	6	2210816	2210821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_007974	A	6	6	2210856	2210861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_007974	CCG	2	6	2210878	2210883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_007974	ATTCG	2	10	2211426	2211435	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5131	NC_007974	ATGC	2	8	2211465	2211472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_007974	GCG	2	6	2213578	2213583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_007974	TGA	2	6	2213609	2213614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5145	NC_007974	CGGG	2	8	2216231	2216238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5218	NC_007974	TCGG	2	8	2239194	2239201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5219	NC_007974	AC	5	10	2239229	2239238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5232	NC_007974	GTC	2	6	2240827	2240832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_007974	CGT	2	6	2246159	2246164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_007974	GGA	2	6	2246228	2246233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_007974	A	7	7	2247299	2247305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_007974	GC	3	6	2248657	2248662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5254	NC_007974	AGA	2	6	2248689	2248694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_007974	GTC	2	6	2248775	2248780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5256	NC_007974	ACC	2	6	2248794	2248799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5257	NC_007974	AAG	2	6	2248809	2248814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_007974	CCA	2	6	2248857	2248862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5259	NC_007974	AAG	2	6	2248863	2248868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_007974	TCG	2	6	2248914	2248919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_007974	TCC	2	6	2248925	2248930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5262	NC_007974	GAG	2	6	2249183	2249188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_007974	GAC	2	6	2250129	2250134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_007974	CCT	2	6	2250761	2250766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5265	NC_007974	TCA	2	6	2250778	2250783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_007974	GTT	2	6	2251972	2251977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_007974	GCA	3	9	2254020	2254028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5268	NC_007974	TTCCTC	2	12	2260826	2260837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5269	NC_007974	ACG	2	6	2264681	2264686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5271	NC_007974	AC	3	6	2264763	2264768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5274	NC_007974	GTG	2	6	2264878	2264883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5275	NC_007974	TTC	2	6	2264905	2264910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5284	NC_007974	CTG	2	6	2272748	2272753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5293	NC_007974	TGT	2	6	2284115	2284120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5331	NC_007974	CCTTC	2	10	2307062	2307071	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5373	NC_007974	GCGCT	2	10	2322730	2322739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5381	NC_007974	CAT	3	9	2325686	2325694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5383	NC_007974	GAGT	2	8	2326733	2326740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5388	NC_007974	GAAC	2	8	2327971	2327978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5389	NC_007974	ACC	2	6	2329000	2329005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5390	NC_007974	ATT	2	6	2329009	2329014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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