MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 8301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007973	GGCAG	2	10	25	34	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007973	GC	3	6	43	48	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007973	AGA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007973	TGCG	2	8	1857	1864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007973	GCG	2	6	1871	1876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007973	CGA	2	6	1902	1907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007973	AGCC	2	8	1915	1922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007973	TAC	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007973	GGC	2	6	2047	2052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007973	ACG	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007973	CCA	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007973	CA	3	6	3372	3377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007973	GCA	2	6	3380	3385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007973	CGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007973	A	6	6	6114	6119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007973	T	7	7	6134	6140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007973	GCC	2	6	6165	6170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007973	TGC	2	6	6206	6211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007973	GCT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007973	CGG	2	6	6288	6293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007973	GC	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007973	ACG	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007973	GCG	2	6	6370	6375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007973	TGC	2	6	6425	6430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007973	CG	3	6	6446	6451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007973	CAA	2	6	6569	6574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007973	GTC	2	6	6656	6661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007973	GCG	2	6	6687	6692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007973	TCG	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007973	TTG	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007973	ATT	2	6	6870	6875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007973	AGG	2	6	8107	8112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007973	CGA	2	6	8136	8141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007973	GCAA	2	8	8191	8198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007973	GCA	2	6	8289	8294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007973	C	7	7	8360	8366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_007973	ATCGTT	2	12	10133	10144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007973	TGC	2	6	10254	10259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007973	TCCT	2	8	11192	11199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007973	TTC	2	6	11200	11205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007973	GTC	2	6	11254	11259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007973	TGAA	2	8	11261	11268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007973	ATG	2	6	16436	16441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007973	CG	4	8	16596	16603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007973	CG	4	8	17322	17329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007973	GGC	2	6	17352	17357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007973	AGG	2	6	17767	17772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007973	GCC	2	6	17778	17783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007973	CGC	2	6	17831	17836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007973	TCC	2	6	17854	17859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007973	GTGC	2	8	19539	19546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007973	CAA	2	6	19703	19708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007973	GGCC	2	8	20243	20250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007973	GCAT	2	8	20297	20304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007973	CCCT	2	8	20355	20362	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_007973	CTC	2	6	22039	22044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007973	ACA	2	6	22813	22818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007973	GCG	2	6	22827	22832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007973	AG	3	6	22833	22838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007973	GAGAC	2	10	23680	23689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007973	CAGGG	2	10	24576	24585	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007973	CA	3	6	24637	24642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007973	TCG	2	6	24645	24650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007973	CA	3	6	24657	24662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007973	TTC	2	6	24733	24738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007973	GGC	2	6	26943	26948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007973	CG	3	6	26982	26987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007973	TCCC	2	8	28308	28315	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_007973	TCT	2	6	29659	29664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007973	CG	3	6	29759	29764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007973	GGC	3	9	31274	31282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007973	TCCT	2	8	32087	32094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007973	GC	4	8	32131	32138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007973	GTC	2	6	32219	32224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007973	CGA	2	6	32255	32260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007973	CAA	2	6	33077	33082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007973	AGA	2	6	33085	33090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007973	CTGGT	2	10	33114	33123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007973	TTG	2	6	33165	33170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007973	GCA	2	6	33177	33182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007973	TGCG	2	8	33192	33199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007973	GCG	2	6	33239	33244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007973	TTG	2	6	33249	33254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007973	GCA	2	6	33378	33383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007973	TCG	2	6	33418	33423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007973	GAC	2	6	33425	33430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007973	GGC	2	6	33431	33436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007973	GTT	2	6	33437	33442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007973	TGT	2	6	33448	33453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007973	ACC	2	6	33476	33481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007973	CAG	2	6	33526	33531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007973	TGC	2	6	33543	33548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007973	TTG	2	6	33549	33554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007973	CCAC	2	8	33585	33592	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_007973	GC	3	6	33618	33623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007973	GAAC	2	8	33728	33735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007973	GTT	2	6	33752	33757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007973	GTA	2	6	33779	33784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007973	GAA	2	6	33836	33841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007973	CCAG	2	8	33891	33898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007973	GA	3	6	33970	33975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007973	CGA	2	6	35223	35228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007973	GTT	2	6	35286	35291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007973	GTT	2	6	35367	35372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007973	GCC	2	6	35448	35453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007973	TTC	2	6	35491	35496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007973	CGC	2	6	35573	35578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007973	CTG	2	6	35816	35821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007973	AGA	2	6	35860	35865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007973	TTCG	2	8	37028	37035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007973	TGC	2	6	37042	37047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007973	CGT	2	6	37931	37936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007973	CGGC	2	8	37966	37973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007973	TCG	2	6	39074	39079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007973	G	6	6	39111	39116	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007973	CCT	2	6	39122	39127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007973	CAG	2	6	39158	39163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007973	TCT	2	6	39171	39176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007973	C	6	6	39199	39204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_007973	CT	3	6	39211	39216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007973	C	6	6	39229	39234	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_007973	TCAG	2	8	39263	39270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007973	CCGG	2	8	39524	39531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007973	TGG	2	6	44261	44266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007973	TGCCC	2	10	44307	44316	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_007973	GT	3	6	44382	44387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007973	AAT	2	6	48027	48032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007973	GAA	2	6	48036	48041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007973	AGCC	2	8	48137	48144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007973	A	7	7	52495	52501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007973	CTT	2	6	52527	52532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007973	GTT	2	6	54011	54016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007973	TCG	2	6	54062	54067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007973	CGTG	2	8	55182	55189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007973	GAT	2	6	57174	57179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007973	GTG	2	6	57189	57194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007973	GCG	2	6	57530	57535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007973	CGG	3	9	57629	57637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007973	TCG	2	6	57686	57691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007973	ATC	2	6	58040	58045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007973	TCC	2	6	58071	58076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_007973	GGC	2	6	58127	58132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007973	TGG	2	6	58192	58197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007973	GCG	2	6	58210	58215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007973	CGCA	2	8	58375	58382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007973	GGCCG	2	10	58422	58431	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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277	NC_007973	GAAAA	2	10	132122	132131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_007973	CTG	2	6	132965	132970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_007973	GCC	2	6	132999	133004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_007973	CCGT	2	8	133035	133042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
284	NC_007973	AAC	2	6	133067	133072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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487	NC_007973	GC	3	6	241491	241496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_007973	CGCCA	2	10	241501	241510	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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