MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 8301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007973	GCG	2	6	2046803	2046808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_007973	CAGT	2	8	2049265	2049272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_007973	CAT	2	6	2049318	2049323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_007973	TGC	2	6	2049346	2049351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_007973	CGTT	2	8	2049400	2049407	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_007973	GAA	2	6	2049417	2049422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_007973	A	7	7	2049421	2049427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_007973	TGC	2	6	2049439	2049444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_007973	GCG	2	6	2049490	2049495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_007973	GT	3	6	2050800	2050805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_007973	CGGG	2	8	2050824	2050831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_007973	CAT	2	6	2050846	2050851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_007973	CGG	2	6	2050874	2050879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_007973	GC	3	6	2051751	2051756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_007973	GCGCC	2	10	2051778	2051787	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4016	NC_007973	CG	3	6	2051793	2051798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_007973	AATCC	2	10	2053177	2053186	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4018	NC_007973	TGT	3	9	2053192	2053200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_007973	CGA	2	6	2053242	2053247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_007973	GGC	2	6	2055363	2055368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_007973	GC	3	6	2055440	2055445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_007973	CGTA	2	8	2056409	2056416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_007973	CGT	2	6	2056455	2056460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_007973	T	8	8	2056511	2056518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_007973	AAG	2	6	2056922	2056927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_007973	ATC	2	6	2056987	2056992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_007973	GCG	2	6	2057004	2057009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_007973	AGA	2	6	2057045	2057050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_007973	CCA	2	6	2057387	2057392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_007973	CTGGA	2	10	2057398	2057407	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4031	NC_007973	ACG	2	6	2057430	2057435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_007973	GCC	2	6	2057558	2057563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_007973	TGGT	2	8	2057683	2057690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_007973	GCC	2	6	2058400	2058405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_007973	TGGT	2	8	2058422	2058429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_007973	CGGC	2	8	2059590	2059597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_007973	CGC	2	6	2059604	2059609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_007973	TCC	2	6	2059782	2059787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_007973	GGC	2	6	2059846	2059851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_007973	CAC	2	6	2059874	2059879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_007973	GAA	2	6	2060703	2060708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_007973	GC	3	6	2060764	2060769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_007973	GGGC	2	8	2060789	2060796	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_007973	CTA	2	6	2062588	2062593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_007973	TGG	2	6	2062659	2062664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_007973	GCG	2	6	2064257	2064262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_007973	AGC	2	6	2064306	2064311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_007973	CAT	2	6	2065670	2065675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_007973	AG	3	6	2065738	2065743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_007973	CTGGAA	2	12	2068924	2068935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4051	NC_007973	CGA	2	6	2068987	2068992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_007973	CTA	2	6	2069449	2069454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_007973	GCC	2	6	2070527	2070532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_007973	CAG	2	6	2072886	2072891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_007973	GTC	2	6	2072903	2072908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_007973	GCG	2	6	2072938	2072943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_007973	GGA	2	6	2072972	2072977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_007973	CGA	3	9	2073006	2073014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_007973	CGG	2	6	2073020	2073025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_007973	TGG	2	6	2074363	2074368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_007973	GCC	2	6	2074468	2074473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_007973	ACG	3	9	2074479	2074487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_007973	TGA	2	6	2074587	2074592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_007973	GCTG	2	8	2074602	2074609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_007973	TGC	2	6	2075719	2075724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_007973	GGC	2	6	2075730	2075735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_007973	GTGCGG	2	12	2076741	2076752	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4068	NC_007973	T	7	7	2077895	2077901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_007973	TTC	2	6	2077905	2077910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007973	TCG	2	6	2081063	2081068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_007973	CTTC	2	8	2082018	2082025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_007973	AATCA	2	10	2082132	2082141	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4073	NC_007973	GCC	2	6	2082189	2082194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_007973	GCATG	2	10	2082845	2082854	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4075	NC_007973	A	6	6	2082901	2082906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_007973	AAC	2	6	2082911	2082916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_007973	CAA	2	6	2082980	2082985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_007973	GCG	2	6	2083001	2083006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_007973	CA	3	6	2083787	2083792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_007973	CTG	2	6	2083831	2083836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_007973	GCTG	2	8	2083841	2083848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_007973	GGC	2	6	2083869	2083874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_007973	CG	3	6	2083919	2083924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_007973	GCCTG	2	10	2084377	2084386	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4085	NC_007973	AC	3	6	2085045	2085050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_007973	GCG	2	6	2085101	2085106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_007973	G	6	6	2085838	2085843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_007973	GC	3	6	2085872	2085877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_007973	TCC	2	6	2087221	2087226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_007973	TG	3	6	2087896	2087901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_007973	GCA	2	6	2087938	2087943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_007973	GGC	2	6	2087998	2088003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_007973	GCG	2	6	2088041	2088046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_007973	TCG	2	6	2088062	2088067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_007973	ATCA	2	8	2088081	2088088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_007973	T	6	6	2088091	2088096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_007973	GCG	2	6	2088132	2088137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_007973	CTC	2	6	2090117	2090122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_007973	CGG	2	6	2090137	2090142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_007973	GCCA	2	8	2090150	2090157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_007973	GGC	2	6	2090175	2090180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_007973	AACT	2	8	2090622	2090629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_007973	ATCA	2	8	2090662	2090669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_007973	GCG	2	6	2090693	2090698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_007973	GCA	2	6	2090749	2090754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_007973	GC	4	8	2090841	2090848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_007973	CG	3	6	2090918	2090923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_007973	TCA	3	9	2090996	2091004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_007973	CTG	2	6	2091008	2091013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_007973	CAA	2	6	2091015	2091020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_007973	GC	3	6	2091025	2091030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_007973	CGAT	2	8	2091053	2091060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_007973	CCGTG	2	10	2091082	2091091	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4114	NC_007973	CTT	2	6	2091236	2091241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_007973	CTT	2	6	2091260	2091265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_007973	ATC	2	6	2092237	2092242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_007973	C	6	6	2092260	2092265	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4118	NC_007973	GCA	2	6	2092367	2092372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_007973	TGAG	2	8	2092383	2092390	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_007973	GCG	2	6	2093220	2093225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_007973	TG	3	6	2093250	2093255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_007973	GCG	2	6	2093311	2093316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_007973	TGG	2	6	2093319	2093324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_007973	TGA	2	6	2093355	2093360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_007973	GTG	2	6	2093377	2093382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_007973	GAGG	2	8	2093384	2093391	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_007973	GGT	2	6	2093476	2093481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_007973	A	6	6	2093491	2093496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_007973	GGC	2	6	2093497	2093502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_007973	CCGT	2	8	2093550	2093557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4264	NC_007973	CTGA	2	8	2162044	2162051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4265	NC_007973	CA	3	6	2163171	2163176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4389	NC_007973	CAA	2	6	2185198	2185203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_007973	CGAA	2	8	2185845	2185852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4391	NC_007973	A	7	7	2188085	2188091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_007973	T	6	6	2188112	2188117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_007973	GCG	2	6	2189960	2189965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4396	NC_007973	ACG	2	6	2192266	2192271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4397	NC_007973	TACG	2	8	2192276	2192283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4398	NC_007973	A	6	6	2195182	2195187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_007973	T	6	6	2195210	2195215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4498	NC_007973	CT	4	8	2273621	2273628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4499	NC_007973	TCG	2	6	2273737	2273742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_007973	T	7	7	2274230	2274236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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