MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 7808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007963	AG	3	6	13	18	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007963	TCA	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007963	GGC	2	6	1585	1590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007963	TCG	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007963	GC	3	6	2809	2814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007963	ACG	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007963	TCG	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007963	GCG	2	6	6393	6398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007963	T	6	6	6445	6450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007963	AGGGA	2	10	7149	7158	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007963	GGCG	2	8	7223	7230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007963	GCG	2	6	7269	7274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007963	GAC	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007963	GCAG	2	8	7297	7304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007963	GGT	2	6	7309	7314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007963	GCG	2	6	7317	7322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007963	A	6	6	7336	7341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007963	TCGT	2	8	7365	7372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007963	GTAA	2	8	14070	14077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007963	GTC	2	6	14122	14127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007963	ATG	2	6	14150	14155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007963	CATGG	2	10	14205	14214	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007963	ACC	2	6	19079	19084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007963	CGTC	2	8	19826	19833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007963	CGC	2	6	23645	23650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007963	TCG	2	6	24397	24402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007963	ACGCC	2	10	24448	24457	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_007963	GC	3	6	24458	24463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007963	CGG	2	6	24559	24564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007963	CG	3	6	24599	24604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007963	AC	3	6	24615	24620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007963	GAC	2	6	26154	26159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007963	GCC	2	6	26172	26177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007963	CGG	2	6	26214	26219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007963	GAAG	2	8	26223	26230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007963	GGT	2	6	26331	26336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007963	AAC	2	6	26339	26344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007963	CCG	2	6	26474	26479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_007963	GTC	2	6	27235	27240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007963	GGTG	2	8	27265	27272	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007963	TCA	2	6	27285	27290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007963	CA	3	6	27313	27318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007963	GGT	2	6	27831	27836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007963	CGA	2	6	27848	27853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007963	CGC	2	6	27885	27890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007963	GCC	2	6	27918	27923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007963	CGG	2	6	27944	27949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007963	CG	3	6	28583	28588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007963	GAG	2	6	28620	28625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007963	ATGA	2	8	29986	29993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007963	GTGGCC	2	12	30029	30040	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007963	GTC	2	6	34087	34092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007963	GTA	2	6	34094	34099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007963	GCC	2	6	34105	34110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007963	TTG	2	6	35758	35763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007963	TTG	2	6	35959	35964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007963	GAG	2	6	35974	35979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007963	TGC	2	6	39381	39386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007963	CGG	2	6	39416	39421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007963	CGA	2	6	39468	39473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007963	GAC	2	6	41497	41502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007963	CGC	2	6	41503	41508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007963	CGG	2	6	41509	41514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007963	ATC	2	6	41557	41562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007963	AC	3	6	41578	41583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007963	CACG	2	8	43893	43900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007963	GC	3	6	43901	43906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007963	CGG	2	6	43909	43914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007963	CCG	2	6	43968	43973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_007963	CATC	2	8	43979	43986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007963	AAATA	2	10	44759	44768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007963	TGG	3	9	44870	44878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007963	AAAAT	2	10	44894	44903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007963	AT	3	6	44902	44907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007963	AAC	2	6	44948	44953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007963	AGAT	2	8	44993	45000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007963	GCTC	2	8	45020	45027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007963	AGCG	2	8	45036	45043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007963	AT	3	6	45553	45558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007963	ATG	2	6	45584	45589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007963	CG	3	6	46164	46169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007963	GTG	2	6	46185	46190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007963	AAT	2	6	46214	46219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007963	CG	3	6	46232	46237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007963	GC	3	6	46241	46246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007963	GAT	2	6	46294	46299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007963	GGC	2	6	46951	46956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007963	GTC	2	6	47880	47885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007963	A	6	6	47921	47926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007963	TG	3	6	47973	47978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007963	CCG	2	6	47979	47984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007963	GAA	2	6	48042	48047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007963	GGC	2	6	48055	48060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007963	CCT	3	9	48166	48174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007963	CAT	2	6	49456	49461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007963	GT	3	6	49527	49532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007963	CGG	2	6	49561	49566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007963	GGC	2	6	49574	49579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007963	TTCGA	2	10	49599	49608	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007963	AAGA	2	8	50179	50186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007963	ACC	2	6	50192	50197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_007963	GAAA	2	8	50938	50945	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007963	GGA	2	6	51758	51763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007963	TCG	2	6	51808	51813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007963	ATTG	2	8	51830	51837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007963	GTC	2	6	51846	51851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007963	GTC	2	6	51882	51887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007963	CCT	2	6	51918	51923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007963	CACGG	2	10	51977	51986	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007963	GCGTTT	2	12	51989	52000	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007963	CGG	2	6	53356	53361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007963	GTCG	2	8	53373	53380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007963	CG	3	6	53420	53425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007963	GCAC	2	8	54672	54679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007963	CGG	3	9	56297	56305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007963	CAT	2	6	56371	56376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007963	CGCC	2	8	56420	56427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_007963	CGT	2	6	56468	56473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007963	CGA	3	9	56482	56490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007963	CGAC	2	8	56525	56532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007963	CCT	2	6	59253	59258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_007963	GCC	2	6	59275	59280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007963	GGC	2	6	59296	59301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007963	AGT	2	6	59363	59368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007963	GCC	2	6	59391	59396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007963	TCA	2	6	59456	59461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007963	GCA	2	6	59494	59499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007963	CGG	2	6	59507	59512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007963	CG	3	6	59566	59571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007963	AGC	2	6	59620	59625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007963	GGGC	2	8	59692	59699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007963	TGG	2	6	59771	59776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007963	TCG	2	6	59783	59788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007963	GAA	2	6	59796	59801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007963	GTT	2	6	59829	59834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007963	TGA	2	6	59884	59889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007963	ATC	2	6	59893	59898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007963	GGC	2	6	59904	59909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007963	GTG	2	6	59961	59966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007963	AGT	2	6	60025	60030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007963	TGCCG	2	10	60036	60045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_007963	GTG	2	6	60160	60165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007963	CGC	2	6	60224	60229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_007963	ATCA	2	8	60305	60312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007963	GA	3	6	60346	60351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_007963	TGGG	2	8	212839	212846	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
423	NC_007963	GGC	2	6	212860	212865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_007963	ACG	2	6	215069	215074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_007963	GTA	2	6	215089	215094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_007963	TA	3	6	215093	215098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_007963	CCA	2	6	216410	216415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_007963	CAG	3	9	216425	216433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_007963	AGG	2	6	216571	216576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_007963	TTC	2	6	217058	217063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_007963	GC	3	6	218761	218766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
436	NC_007963	TGAA	2	8	219881	219888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
437	NC_007963	CGG	2	6	219917	219922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_007963	TTCG	2	8	219928	219935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
439	NC_007963	GAT	2	6	219979	219984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_007963	CGA	2	6	220032	220037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_007963	GCC	2	6	221997	222002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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447	NC_007963	CG	3	6	222029	222034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
448	NC_007963	GGCG	2	8	222035	222042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
449	NC_007963	CGT	2	6	222047	222052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_007963	CCG	2	6	222874	222879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
451	NC_007963	TAT	2	6	222900	222905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_007963	GC	3	6	222910	222915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
453	NC_007963	ACCG	2	8	222929	222936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
454	NC_007963	CG	3	6	222942	222947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
455	NC_007963	CAA	2	6	224316	224321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_007963	CCA	2	6	224342	224347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
457	NC_007963	CACTT	2	10	224353	224362	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
458	NC_007963	GCT	2	6	224423	224428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_007963	GC	3	6	224433	224438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
460	NC_007963	TGCCA	2	10	224444	224453	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
461	NC_007963	AAG	2	6	230663	230668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_007963	GAT	2	6	231636	231641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_007963	AG	3	6	231708	231713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
464	NC_007963	TTG	2	6	231752	231757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
465	NC_007963	TGAA	2	8	231835	231842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
466	NC_007963	CTT	2	6	240738	240743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_007963	GGCGAG	2	12	240769	240780	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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469	NC_007963	AGC	2	6	240875	240880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_007963	TGC	2	6	243149	243154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_007963	T	6	6	243839	243844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_007963	GCAA	2	8	243883	243890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
475	NC_007963	ATG	2	6	243894	243899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
476	NC_007963	AG	4	8	243927	243934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
477	NC_007963	CGG	2	6	245639	245644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
478	NC_007963	ATG	2	6	245674	245679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
479	NC_007963	AATA	2	8	245689	245696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_007963	ATC	2	6	245697	245702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_007963	TGA	2	6	246755	246760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
482	NC_007963	GCCA	2	8	249491	249498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
483	NC_007963	AGC	2	6	249500	249505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_007963	AAG	2	6	249828	249833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_007963	GGC	2	6	252036	252041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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