MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13

Total Repeats: 2594

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007429	A	6	6	1797	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007429	AAG	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007429	TGG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007429	CTT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007429	T	7	7	1841	1847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007429	A	6	6	1852	1857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007429	AAGG	2	8	1903	1910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007429	T	6	6	2233	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007429	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007429	T	7	7	2255	2261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007429	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007429	A	6	6	2327	2332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007429	GCA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007429	A	6	6	5660	5665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007429	AGA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007429	CAAAAA	2	12	6846	6857	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007429	GGAG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007429	CTT	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007429	TATG	2	8	7549	7556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007429	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007429	A	6	6	7607	7612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007429	TATTT	2	10	7628	7637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007429	ATTT	2	8	7690	7697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007429	TTA	2	6	7748	7753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007429	TTTG	2	8	7782	7789	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007429	GAA	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007429	ATG	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007429	A	6	6	9726	9731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007429	TTC	3	9	9771	9779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007429	ATC	2	6	9787	9792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007429	A	6	6	9811	9816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007429	GAA	2	6	9825	9830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007429	A	6	6	9881	9886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007429	TATT	2	8	9905	9912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007429	CCT	2	6	9926	9931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007429	TAG	2	6	11787	11792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007429	AGAA	2	8	11797	11804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007429	CTT	2	6	11837	11842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007429	TA	3	6	11843	11848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007429	TCA	2	6	11873	11878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007429	ATA	2	6	13159	13164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007429	GTTT	2	8	13167	13174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007429	TAC	2	6	13287	13292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007429	TA	3	6	13934	13939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007429	ATT	2	6	13968	13973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007429	AAG	2	6	13985	13990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007429	TTA	2	6	14011	14016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007429	AAGG	2	8	14033	14040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007429	AAG	2	6	14045	14050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007429	AAC	2	6	14129	14134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007429	TA	4	8	14158	14165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007429	CTT	2	6	15552	15557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007429	CAAA	2	8	16667	16674	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007429	AG	3	6	18110	18115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007429	GA	3	6	18123	18128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007429	GTT	2	6	18225	18230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007429	GAA	2	6	18969	18974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007429	AAT	3	9	19033	19041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007429	CT	3	6	19045	19050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007429	TCT	2	6	19061	19066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007429	TGCG	2	8	19121	19128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007429	CTT	3	9	20487	20495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007429	T	6	6	20494	20499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007429	T	6	6	20501	20506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007429	A	8	8	20983	20990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007429	A	6	6	20999	21004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007429	GAA	2	6	21012	21017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007429	A	6	6	21074	21079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007429	AG	3	6	21111	21116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007429	A	6	6	21149	21154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007429	GGA	2	6	21206	21211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007429	AGA	3	9	21246	21254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007429	GA	3	6	21269	21274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007429	TGG	2	6	21465	21470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007429	AAC	2	6	21504	21509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007429	AGC	2	6	21521	21526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007429	AGG	2	6	21610	21615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007429	TGA	2	6	21722	21727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007429	AG	3	6	21786	21791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007429	TCC	2	6	21839	21844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007429	CT	3	6	21855	21860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007429	CGCT	2	8	21863	21870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007429	TTAA	2	8	21884	21891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007429	GTTA	2	8	21921	21928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007429	GATC	2	8	21976	21983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007429	AAT	2	6	22015	22020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007429	A	7	7	25155	25161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007429	TTA	2	6	25168	25173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007429	T	11	11	25183	25193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007429	GA	3	6	27109	27114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007429	CT	3	6	27116	27121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007429	ACT	2	6	27124	27129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007429	A	6	6	27140	27145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007429	T	7	7	27152	27158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007429	T	7	7	28466	28472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007429	TAA	2	6	28477	28482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007429	TC	3	6	28484	28489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007429	ATTG	2	8	28535	28542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007429	AG	3	6	28567	28572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007429	AGA	2	6	28589	28594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007429	AAAGA	2	10	33689	33698	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007429	CTG	2	6	33717	33722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007429	GA	3	6	36980	36985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007429	T	9	9	37014	37022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007429	CTT	2	6	37074	37079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007429	AT	3	6	37082	37087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007429	CT	3	6	39349	39354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007429	TAA	2	6	39412	39417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007429	T	6	6	39432	39437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007429	AAG	2	6	39453	39458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007429	A	8	8	40710	40717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007429	CT	3	6	40720	40725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007429	T	6	6	40725	40730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007429	CTC	2	6	40731	40736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007429	AAG	2	6	40816	40821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007429	T	8	8	40906	40913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007429	GAT	2	6	43272	43277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007429	AAG	2	6	43278	43283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007429	A	8	8	43316	43323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007429	GGA	2	6	43330	43335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007429	TAA	2	6	43428	43433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007429	TC	3	6	44404	44409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007429	TGTT	2	8	44413	44420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007429	A	8	8	44452	44459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007429	AATA	2	8	44652	44659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007429	ACT	2	6	44660	44665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007429	AAG	2	6	46511	46516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007429	AAGT	2	8	48574	48581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007429	TAA	2	6	48583	48588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007429	GAA	2	6	48599	48604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007429	GAAGA	2	10	48607	48616	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007429	AG	3	6	48639	48644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007429	TGT	2	6	48658	48663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007429	T	8	8	49204	49211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007429	GTC	2	6	49336	49341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007429	AAG	2	6	49358	49363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007429	TAT	2	6	49387	49392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007429	T	8	8	49481	49488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007429	A	6	6	49532	49537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007429	T	6	6	49641	49646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007429	AGA	2	6	50156	50161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007429	CTATT	2	10	50185	50194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007429	AAG	2	6	50218	50223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007429	TCT	2	6	50232	50237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007429	ACT	2	6	50273	50278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007429	T	7	7	50293	50299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007429	AAT	2	6	50308	50313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007429	TGT	2	6	50330	50335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007429	GCC	2	6	50377	50382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_007429	ATT	2	6	50426	50431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007429	CAA	2	6	50445	50450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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