MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN chromosome

Total Repeats: 6752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007292	AAT	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007292	TAT	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007292	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007292	GA	3	6	1979	1984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007292	AAT	3	9	2024	2032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007292	ATA	3	9	2042	2050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007292	ATT	3	9	2059	2067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007292	TATG	2	8	2081	2088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007292	ATT	2	6	2091	2096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007292	GTT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007292	T	7	7	2144	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007292	TAT	2	6	2191	2196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007292	AATA	2	8	2209	2216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007292	TTA	2	6	2235	2240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007292	GT	3	6	2283	2288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007292	TAAT	2	8	2327	2334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007292	AG	5	10	2388	2397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007292	T	6	6	2426	2431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007292	ACA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007292	TA	4	8	2484	2491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007292	TGT	2	6	2546	2551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007292	T	6	6	2599	2604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007292	GGT	2	6	2609	2614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007292	AGA	2	6	3444	3449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007292	AG	3	6	3454	3459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007292	AATT	2	8	3713	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007292	TATT	2	8	3726	3733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007292	ATT	2	6	3740	3745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007292	AGT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007292	TAAT	2	8	7294	7301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007292	T	6	6	8692	8697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007292	TAA	2	6	9167	9172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007292	TGT	2	6	9183	9188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007292	ATAA	2	8	9189	9196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007292	TATGTA	2	12	9207	9218	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007292	TAA	2	6	9234	9239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007292	A	6	6	9270	9275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007292	TA	3	6	9276	9281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007292	ATT	2	6	10684	10689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007292	T	6	6	10688	10693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007292	ATT	2	6	10702	10707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007292	TA	3	6	10722	10727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007292	ATT	2	6	10746	10751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007292	ATT	2	6	10806	10811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007292	A	9	9	10839	10847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007292	ATTTAT	2	12	10864	10875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007292	ATT	2	6	10890	10895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007292	TAT	2	6	12332	12337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007292	T	7	7	12382	12388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007292	TGC	2	6	14648	14653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007292	TAA	2	6	14656	14661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007292	TATT	2	8	14834	14841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007292	ATT	2	6	14858	14863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007292	ATT	2	6	14866	14871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007292	ATT	2	6	14880	14885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007292	TA	3	6	14923	14928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007292	GTTT	2	8	14946	14953	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007292	ATA	2	6	14965	14970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007292	ATT	2	6	14971	14976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007292	ATT	2	6	15126	15131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007292	TGT	2	6	15137	15142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007292	ATTGA	2	10	16316	16325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007292	AAT	2	6	16340	16345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007292	TA	3	6	16375	16380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007292	A	6	6	16391	16396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007292	AAAT	2	8	16423	16430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007292	AAT	2	6	16446	16451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007292	A	6	6	16529	16534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007292	T	8	8	19003	19010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007292	TA	3	6	19021	19026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007292	TTA	2	6	19056	19061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007292	TAT	2	6	19096	19101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007292	TTAT	2	8	19147	19154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007292	TATT	2	8	19627	19634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007292	TTA	2	6	19665	19670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007292	TA	4	8	19675	19682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007292	T	9	9	19693	19701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007292	TA	3	6	20881	20886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007292	ATTT	2	8	20929	20936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007292	TA	4	8	20954	20961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007292	A	6	6	20969	20974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007292	GATA	2	8	20988	20995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007292	T	6	6	21052	21057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007292	ATT	2	6	21089	21094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007292	ATTAT	2	10	21120	21129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007292	ATT	2	6	21134	21139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007292	AAT	3	9	21140	21148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007292	GTT	2	6	21158	21163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007292	ATAAA	2	10	21208	21217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007292	A	6	6	24317	24322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007292	TTAA	2	8	24337	24344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007292	TAA	2	6	25046	25051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007292	ATT	2	6	25069	25074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007292	TAA	2	6	25078	25083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007292	AAT	2	6	25093	25098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007292	TTA	2	6	25103	25108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007292	TA	3	6	25123	25128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007292	ATA	2	6	25158	25163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007292	AAT	2	6	25171	25176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007292	AT	3	6	25175	25180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007292	CTTAT	2	10	25187	25196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007292	TA	3	6	25281	25286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007292	TTA	3	9	25287	25295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007292	TCCT	2	8	25365	25372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007292	AGT	2	6	25385	25390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007292	AT	3	6	25392	25397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007292	T	6	6	25408	25413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007292	TAA	2	6	25444	25449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007292	ATAA	3	12	25446	25457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007292	ATC	2	6	25464	25469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007292	AT	3	6	25493	25498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007292	ATA	2	6	25535	25540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007292	TAT	2	6	25560	25565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007292	ATT	2	6	27648	27653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007292	ATT	2	6	27660	27665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007292	TTC	2	6	27680	27685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007292	T	6	6	27708	27713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007292	TAT	2	6	27720	27725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007292	T	6	6	27749	27754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007292	ATA	2	6	27758	27763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007292	T	6	6	27770	27775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007292	ATT	2	6	27778	27783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007292	T	6	6	27819	27824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007292	TAAA	2	8	27893	27900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007292	TTAA	2	8	27905	27912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007292	TAA	2	6	27926	27931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007292	TAT	2	6	27933	27938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007292	T	6	6	27938	27943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007292	TTC	2	6	27957	27962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007292	GAA	2	6	27986	27991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007292	CTTT	2	8	27992	27999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007292	TAA	2	6	28001	28006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007292	TTG	2	6	28030	28035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007292	T	6	6	28042	28047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007292	ATT	2	6	29699	29704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007292	TAT	2	6	29721	29726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007292	AGAAAA	2	12	29745	29756	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007292	T	7	7	29762	29768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007292	ATG	2	6	29769	29774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007292	AT	3	6	29784	29789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007292	AT	3	6	29791	29796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007292	T	6	6	29817	29822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007292	AAAT	2	8	29935	29942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007292	TA	3	6	29959	29964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007292	ATG	3	9	29967	29975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007292	TAT	2	6	29993	29998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007292	ATTAT	2	10	30016	30025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007292	TG	3	6	30982	30987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007292	TAA	3	9	30999	31007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007292	TAA	2	6	31050	31055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007292	ATTG	2	8	31115	31122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_007292	AT	4	8	56456	56463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_007292	ATTT	2	8	56750	56757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_007292	TAAT	2	8	56782	56789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_007292	ATT	2	6	56824	56829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_007292	TGAT	2	8	56852	56859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
451	NC_007292	ACA	2	6	56874	56879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_007292	AAT	3	9	56884	56892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_007292	TTA	2	6	56936	56941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_007292	ATT	2	6	56944	56949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_007292	AATT	2	8	57244	57251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_007292	TGAT	2	8	57256	57263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_007292	TTAA	2	8	58612	58619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_007292	TAT	2	6	58620	58625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_007292	AAT	2	6	58630	58635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_007292	ATTT	2	8	58640	58647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_007292	TAA	2	6	58672	58677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_007292	ATTA	2	8	58688	58695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_007292	ATT	2	6	58698	58703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_007292	TAT	2	6	58780	58785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_007292	T	7	7	58788	58794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_007292	TGT	2	6	58803	58808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_007292	ATT	2	6	60355	60360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_007292	TA	3	6	60398	60403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_007292	TAA	2	6	60407	60412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_007292	ATA	2	6	60826	60831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_007292	ATT	2	6	60839	60844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_007292	TTAT	2	8	60845	60852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_007292	AT	3	6	60881	60886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_007292	AAAT	2	8	61072	61079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_007292	AGC	2	6	61245	61250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
496	NC_007292	TATT	2	8	61288	61295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_007292	AT	3	6	62228	62233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_007292	TAT	2	6	62245	62250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_007292	CAA	2	6	62253	62258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_007292	TA	4	8	62260	62267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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