MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chromobacterium violaceum ATCC 12472 chromosome

Total Repeats: 12810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005085	A	6	6	18	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005085	CAA	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005085	CGC	2	6	97	102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_005085	GCCG	2	8	122	129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005085	CG	5	10	155	164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005085	GCGG	2	8	2813	2820	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_005085	GCC	2	6	2825	2830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_005085	CTC	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_005085	CGGG	2	8	2856	2863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_005085	GCG	2	6	2897	2902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_005085	GCC	3	9	2905	2913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_005085	A	6	6	5388	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005085	CTG	2	6	5436	5441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_005085	GAC	2	6	5458	5463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005085	C	6	6	5494	5499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_005085	GAT	2	6	6592	6597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005085	TTC	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005085	TTC	2	6	6617	6622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005085	GT	3	6	6636	6641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005085	G	6	6	6680	6685	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005085	AG	3	6	6706	6711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005085	CTT	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_005085	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005085	TGC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005085	AGA	2	6	6914	6919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005085	C	6	6	6979	6984	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_005085	CAACA	2	10	7021	7030	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_005085	AGA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005085	CAG	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_005085	AAGAA	2	10	8071	8080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005085	GGA	2	6	8083	8088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005085	CTA	2	6	12126	12131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005085	GCC	2	6	12137	12142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_005085	CA	3	6	12162	12167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_005085	CCT	2	6	12334	12339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_005085	CTA	2	6	12375	12380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_005085	GCC	2	6	12389	12394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_005085	C	6	6	12445	12450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_005085	GCC	2	6	13108	13113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_005085	CGG	2	6	13130	13135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005085	GCG	2	6	13165	13170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_005085	GGC	2	6	13172	13177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005085	CATC	2	8	13194	13201	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005085	CGC	2	6	13210	13215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_005085	CGC	2	6	13242	13247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_005085	CG	4	8	13290	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_005085	CGGG	2	8	13343	13350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_005085	GGA	2	6	13365	13370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005085	GCCGG	2	10	13789	13798	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_005085	CG	3	6	13799	13804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005085	GGA	2	6	13835	13840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005085	CCGG	2	8	14252	14259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005085	CAA	2	6	14340	14345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005085	AAC	2	6	14357	14362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_005085	CAAC	2	8	17035	17042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005085	AAATA	2	10	17066	17075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005085	CAA	2	6	17620	17625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_005085	AAT	2	6	17689	17694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005085	AAAT	2	8	17746	17753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005085	ATAA	2	8	17767	17774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005085	ACATC	2	10	17778	17787	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_005085	ATT	2	6	21413	21418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005085	AAG	2	6	21495	21500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005085	GGC	2	6	21549	21554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_005085	AGT	2	6	21632	21637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005085	CAGC	2	8	21662	21669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_005085	CGCCA	2	10	21727	21736	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_005085	ACC	2	6	21765	21770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_005085	GCAC	2	8	21774	21781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005085	CTGC	2	8	22549	22556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_005085	CGCC	2	8	22602	22609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_005085	TTGA	2	8	28686	28693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005085	CGC	2	6	28712	28717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_005085	CG	3	6	28749	28754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_005085	CGG	2	6	28765	28770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005085	ATA	2	6	28812	28817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005085	TTG	2	6	29382	29387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005085	ATT	2	6	34811	34816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005085	A	7	7	34997	35003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005085	TCA	2	6	35028	35033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_005085	CAA	2	6	35037	35042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_005085	AAGC	2	8	35046	35053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_005085	AGGA	2	8	35088	35095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005085	GGT	2	6	35123	35128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005085	TAG	2	6	35157	35162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005085	TCTA	2	8	35176	35183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_005085	GCATA	2	10	35204	35213	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_005085	TTC	2	6	35403	35408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_005085	ACC	2	6	35431	35436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_005085	ACT	2	6	35482	35487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_005085	CTGCT	2	10	35494	35503	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_005085	GAC	2	6	36346	36351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_005085	A	6	6	36354	36359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005085	GGC	2	6	36364	36369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_005085	GCCT	2	8	36376	36383	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_005085	CAT	2	6	37784	37789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_005085	CGGA	2	8	39843	39850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_005085	CGC	2	6	39856	39861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_005085	CCGC	2	8	39919	39926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_005085	G	6	6	40003	40008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005085	GAT	2	6	40010	40015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005085	CCG	2	6	40026	40031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_005085	ACCGC	2	10	40861	40870	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_005085	CAGC	2	8	40871	40878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_005085	TAA	2	6	43512	43517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005085	GGC	2	6	46026	46031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_005085	GA	3	6	46041	46046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005085	GCC	3	9	46366	46374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_005085	CCA	2	6	46379	46384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_005085	GCC	2	6	47509	47514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_005085	CG	3	6	47521	47526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_005085	TAT	2	6	47591	47596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005085	GGA	2	6	47622	47627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005085	TCC	2	6	49133	49138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_005085	GC	3	6	49159	49164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_005085	GC	3	6	50020	50025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_005085	CGG	2	6	50076	50081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_005085	CGG	2	6	50110	50115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005085	GCT	2	6	50147	50152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005085	GGC	2	6	50195	50200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_005085	GC	3	6	50222	50227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_005085	GGC	2	6	50254	50259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_005085	TCA	2	6	50267	50272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_005085	T	6	6	51176	51181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005085	TC	3	6	51185	51190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_005085	GCC	3	9	51208	51216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_005085	AAG	2	6	51239	51244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005085	GCC	2	6	51264	51269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_005085	CAT	2	6	51274	51279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_005085	TGAT	2	8	54849	54856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005085	ATCA	2	8	54874	54881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_005085	GCG	2	6	54886	54891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_005085	GAA	2	6	54892	54897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005085	CCG	2	6	54899	54904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_005085	TGT	2	6	54929	54934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005085	TTC	2	6	55925	55930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005085	CGG	2	6	56013	56018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_005085	TCG	2	6	56081	56086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_005085	GATT	2	8	56134	56141	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005085	T	7	7	56186	56192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005085	GCCC	2	8	56193	56200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_005085	GC	3	6	56204	56209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_005085	GCAA	2	8	56212	56219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_005085	GCC	2	6	56223	56228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_005085	CGG	2	6	56237	56242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_005085	GGC	2	6	56264	56269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_005085	CCTC	2	8	59782	59789	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_005085	TA	3	6	59790	59795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005085	GA	3	6	60755	60760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005085	TGC	2	6	60817	60822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_005085	GCA	2	6	60826	60831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_005085	GC	3	6	60877	60882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_005085	GCT	2	6	60885	60890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_005085	ATG	2	6	60892	60897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_005085	CATGGC	2	12	60922	60933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_005085	C	6	6	60933	60938	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
157	NC_005085	GTC	2	6	63680	63685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_005085	GC	3	6	63695	63700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_005085	GAA	2	6	63725	63730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_005085	A	6	6	63729	63734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_005085	GCC	2	6	63773	63778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_005085	GCC	2	6	63790	63795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_005085	GCG	2	6	63796	63801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_005085	GCCG	2	8	65097	65104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_005085	TGC	2	6	66999	67004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_005085	TTC	2	6	67099	67104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_005085	TCC	2	6	67853	67858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_005085	GC	3	6	67899	67904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_005085	CCG	2	6	67914	67919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_005085	CGGCG	2	10	68821	68830	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
173	NC_005085	CAT	2	6	68831	68836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_005085	TA	3	6	68870	68875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_005085	TGA	2	6	68885	68890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_005085	GAT	2	6	69834	69839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_005085	AAT	2	6	69849	69854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_005085	T	6	6	69858	69863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_005085	GC	3	6	70847	70852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
180	NC_005085	TCA	2	6	72203	72208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_005085	GC	3	6	72257	72262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_005085	GGAAA	2	10	75030	75039	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
184	NC_005085	CGG	2	6	75093	75098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_005085	GCC	2	6	75104	75109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_005085	T	6	6	76475	76480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_005085	CGG	2	6	76486	76491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_005085	GCG	2	6	77901	77906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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226	NC_005085	CTTTT	2	10	94870	94879	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_005085	GCA	2	6	109947	109952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_005085	C	7	7	109962	109968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
274	NC_005085	GCC	2	6	109975	109980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_005085	AGG	2	6	110730	110735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_005085	GGC	2	6	111590	111595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_005085	GCC	2	6	111734	111739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_005085	CTGC	2	8	111913	111920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
281	NC_005085	GT	3	6	113296	113301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
282	NC_005085	GCA	2	6	113327	113332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_005085	TGC	2	6	113336	113341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_005085	TTTTCC	2	12	113377	113388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_005085	CGCC	2	8	113408	113415	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
287	NC_005085	GGCG	2	8	113419	113426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
288	NC_005085	CGG	2	6	113434	113439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_005085	ATGC	2	8	116369	116376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
291	NC_005085	AT	3	6	116397	116402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_005085	ACA	2	6	116458	116463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_005085	CCG	2	6	116589	116594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
296	NC_005085	CCG	2	6	116622	116627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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