MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 12597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004557	TAAT	2	8	2328	2335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004557	TTA	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004557	TTA	2	6	2385	2390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004557	AATATA	2	12	2435	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004557	TTTA	2	8	2462	2469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004557	AGG	2	6	2474	2479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004557	AGG	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004557	TATT	2	8	3941	3948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004557	AGA	3	9	3966	3974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004557	A	8	8	3978	3985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004557	GAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004557	GGTG	2	8	4015	4022	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004557	ATTA	2	8	4556	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004557	TTTA	2	8	4572	4579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004557	TTAT	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004557	TAA	2	6	5181	5186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004557	ATT	2	6	5196	5201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004557	A	6	6	5212	5217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004557	AATT	2	8	5227	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004557	T	7	7	5243	5249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004557	GAA	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004557	AAT	2	6	5524	5529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004557	AAT	2	6	5552	5557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004557	TCAG	2	8	5584	5591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004557	TGC	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004557	TTC	2	6	5637	5642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004557	ACG	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004557	TTC	2	6	6774	6779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004557	TC	3	6	6795	6800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_004557	ACCT	2	8	6804	6811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004557	AGCTT	2	10	6911	6920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_004557	AC	3	6	6957	6962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004557	ACTC	2	8	7174	7181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004557	CTT	2	6	7197	7202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004557	CTC	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_004557	GGT	2	6	7263	7268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004557	GCT	2	6	7342	7347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004557	ACTTA	2	10	7394	7403	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_004557	GTT	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004557	TGT	2	6	7525	7530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004557	GAG	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004557	TCC	2	6	7688	7693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_004557	CA	3	6	7867	7872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_004557	CTCCC	2	10	7922	7931	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_004557	GGT	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004557	T	6	6	8073	8078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004557	CT	3	6	8118	8123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004557	GTCT	2	8	8133	8140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004557	ATG	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004557	AAAT	2	8	8167	8174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004557	TCGC	2	8	8198	8205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_004557	CTA	2	6	8208	8213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_004557	TCC	2	6	8237	8242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_004557	TGC	2	6	8501	8506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004557	GCT	2	6	8530	8535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004557	CACTT	2	10	8536	8545	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_004557	TAC	2	6	8555	8560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004557	TTA	2	6	8596	8601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004557	TC	3	6	8670	8675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004557	AGG	2	6	8719	8724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004557	GT	3	6	8860	8865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004557	TC	3	6	9002	9007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004557	GT	3	6	9028	9033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004557	ATG	2	6	9053	9058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004557	TCC	2	6	9079	9084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_004557	TAA	3	9	9134	9142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004557	CACGA	2	10	9178	9187	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_004557	GAC	2	6	9191	9196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_004557	CAC	2	6	9204	9209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_004557	TTC	2	6	9279	9284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004557	GCT	2	6	9314	9319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004557	CCT	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_004557	TTC	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004557	GCT	2	6	9731	9736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_004557	TCA	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004557	TGC	2	6	9835	9840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004557	CTG	2	6	9874	9879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004557	TCG	2	6	9949	9954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_004557	TTACC	2	10	9968	9977	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_004557	TCC	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_004557	CCG	2	6	10128	10133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_004557	GAAG	2	8	10148	10155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004557	CGC	2	6	10186	10191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_004557	TA	4	8	10250	10257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004557	T	6	6	10284	10289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004557	TGTC	2	8	10346	10353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_004557	T	8	8	10383	10390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004557	T	6	6	10405	10410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004557	ATTT	2	8	10414	10421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004557	TGT	2	6	10430	10435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004557	TCG	2	6	10441	10446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004557	TC	3	6	10450	10455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_004557	GAC	2	6	10456	10461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_004557	TTC	2	6	10484	10489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004557	CTTT	2	8	10503	10510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004557	GTT	3	9	10589	10597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004557	T	6	6	10630	10635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004557	TTA	2	6	10638	10643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004557	TA	4	8	10642	10649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004557	ATT	3	9	10651	10659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004557	TA	4	8	10680	10687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004557	TA	4	8	10703	10710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004557	T	6	6	10717	10722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004557	ATT	2	6	11408	11413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004557	TTA	2	6	11441	11446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004557	A	7	7	11446	11452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004557	AAT	2	6	11464	11469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004557	TTTTA	2	10	11520	11529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004557	AATTT	2	10	11572	11581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004557	TGT	2	6	11691	11696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004557	TATT	2	8	11699	11706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004557	AT	3	6	11712	11717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004557	TTA	2	6	11735	11740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004557	TA	3	6	11750	11755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004557	CAT	2	6	11880	11885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_004557	CAT	2	6	11923	11928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004557	AT	3	6	11945	11950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004557	TCC	2	6	11954	11959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_004557	AAAT	2	8	11993	12000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004557	TCTT	2	8	12011	12018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_004557	CT	3	6	12045	12050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004557	CTA	2	6	12118	12123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004557	CTT	2	6	12159	12164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004557	TAA	2	6	12175	12180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004557	TAT	2	6	12181	12186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004557	A	7	7	12210	12216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004557	TA	3	6	12226	12231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004557	TTAT	2	8	12356	12363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004557	ATT	2	6	12385	12390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004557	ATTAT	2	10	12398	12407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004557	CCT	2	6	12412	12417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_004557	TA	3	6	13230	13235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004557	TATT	2	8	13260	13267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004557	TA	4	8	13274	13281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004557	TTA	2	6	13285	13290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004557	AAATT	2	10	13301	13310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004557	T	6	6	13322	13327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004557	TAT	2	6	13339	13344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004557	ATT	2	6	13350	13355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004557	ATA	2	6	13372	13377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004557	ATT	2	6	13427	13432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004557	TA	3	6	13477	13482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004557	TAATT	2	10	13533	13542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004557	GGA	2	6	13547	13552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004557	AAT	2	6	14817	14822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004557	TTA	2	6	16181	16186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004557	TAT	2	6	16220	16225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004557	AAT	2	6	16226	16231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004557	TAAAA	2	10	16235	16244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004557	TAA	2	6	16256	16261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004557	A	6	6	16311	16316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004557	AT	4	8	17568	17575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004557	TTTA	2	8	17585	17592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_004557	TAA	2	6	17613	17618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004557	ATTT	2	8	17619	17626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_004557	TTTA	2	8	17642	17649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_004557	TATT	2	8	17668	17675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_004557	TAAA	2	8	17685	17692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_004557	TTTA	3	12	17700	17711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_004557	ATT	2	6	17713	17718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_004557	ATAA	2	8	17721	17728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_004557	ATT	2	6	17804	17809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_004557	TTTAA	2	10	19597	19606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_004557	ATTAT	2	10	27132	27141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_004557	TA	4	8	28300	28307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_004557	AT	3	6	28452	28457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_004557	ACGGT	2	10	28489	28498	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
283	NC_004557	TGA	2	6	28559	28564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_004557	T	8	8	28615	28622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_004557	T	6	6	28624	28629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_004557	TTAA	2	8	28666	28673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_004557	A	7	7	29991	29997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_004557	TAT	2	6	30106	30111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_004557	AAAT	2	8	30138	30145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_004557	ACCA	2	8	30159	30166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
293	NC_004557	CTA	2	6	30193	30198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_004557	TAT	2	6	30233	30238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_004557	AT	3	6	30237	30242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_004557	A	6	6	52934	52939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_004557	AT	3	6	52990	52995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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