MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 12597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004557	ATA	2	6	2368770	2368775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_004557	AGG	2	6	2368783	2368788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_004557	TAA	2	6	2369645	2369650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_004557	CTT	2	6	2369669	2369674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_004557	TTA	2	6	2369708	2369713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_004557	TAAT	2	8	2369748	2369755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_004557	CTAA	2	8	2369793	2369800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_004557	T	7	7	2369825	2369831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_004557	ATT	2	6	2369860	2369865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_004557	TCC	2	6	2374059	2374064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_004557	AT	3	6	2375562	2375567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_004557	TCT	2	6	2379525	2379530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_004557	AC	3	6	2379568	2379573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_004557	TG	3	6	2379594	2379599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_004557	CT	3	6	2383462	2383467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11016	NC_004557	CTC	2	6	2385020	2385025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11017	NC_004557	C	6	6	2386148	2386153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11018	NC_004557	TAC	2	6	2386948	2386953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_004557	AGT	2	6	2386973	2386978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_004557	TA	3	6	2389506	2389511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_004557	T	6	6	2389535	2389540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_004557	TAT	2	6	2389542	2389547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_004557	TAA	2	6	2392661	2392666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_004557	ATT	2	6	2392685	2392690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_004557	TAA	2	6	2393667	2393672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_004557	CAAT	2	8	2393678	2393685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11027	NC_004557	AT	3	6	2393687	2393692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_004557	ATTA	2	8	2393705	2393712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_004557	TATT	2	8	2394847	2394854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_004557	CTA	2	6	2394879	2394884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_004557	AATT	2	8	2394898	2394905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_004557	CATA	2	8	2394929	2394936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11033	NC_004557	TATAAG	2	12	2394940	2394951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_004557	AAG	2	6	2394986	2394991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_004557	TTA	2	6	2394995	2395000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_004557	T	6	6	2396486	2396491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_004557	CT	3	6	2401732	2401737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11038	NC_004557	TAT	2	6	2401754	2401759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_004557	A	6	6	2401765	2401770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_004557	AT	3	6	2402531	2402536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_004557	ATC	2	6	2402540	2402545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_004557	CTC	2	6	2404946	2404951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11043	NC_004557	TTTA	2	8	2405999	2406006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_004557	A	7	7	2406011	2406017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_004557	CTC	2	6	2406019	2406024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11046	NC_004557	TTG	2	6	2406062	2406067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_004557	CTA	2	6	2406116	2406121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_004557	TAA	2	6	2406165	2406170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_004557	A	6	6	2406169	2406174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_004557	CT	3	6	2406221	2406226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_004557	ATTAA	2	10	2406244	2406253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_004557	ATC	2	6	2406255	2406260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_004557	A	7	7	2409248	2409254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_004557	GCA	2	6	2409256	2409261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_004557	TGC	2	6	2409265	2409270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_004557	AAAC	2	8	2409638	2409645	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11057	NC_004557	CTT	2	6	2409680	2409685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_004557	AT	3	6	2409763	2409768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_004557	TTCCTG	2	12	2409799	2409810	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_004557	GCT	2	6	2409828	2409833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_004557	TCC	2	6	2409867	2409872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11062	NC_004557	CAA	2	6	2409876	2409881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_004557	TAAAA	2	10	2410434	2410443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_004557	A	7	7	2410440	2410446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_004557	ATA	2	6	2410474	2410479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_004557	TCT	2	6	2410532	2410537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_004557	TAC	2	6	2410553	2410558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_004557	T	6	6	2410582	2410587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_004557	TA	3	6	2412521	2412526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_004557	CTCC	2	8	2412527	2412534	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11071	NC_004557	TTAT	2	8	2412547	2412554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_004557	A	6	6	2412559	2412564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_004557	A	8	8	2412566	2412573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_004557	ATA	2	6	2412619	2412624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_004557	TAT	2	6	2412637	2412642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_004557	TACT	2	8	2412675	2412682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11077	NC_004557	GGT	2	6	2412705	2412710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_004557	AATA	2	8	2412715	2412722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_004557	CT	3	6	2412756	2412761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11080	NC_004557	TA	3	6	2412813	2412818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_004557	ATT	2	6	2412837	2412842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_004557	TTTTAT	2	12	2413774	2413785	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_004557	ATT	2	6	2413802	2413807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_004557	ATA	2	6	2414661	2414666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_004557	TTAAA	2	10	2414674	2414683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_004557	GAA	2	6	2414701	2414706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_004557	ATT	2	6	2414718	2414723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_004557	ATT	2	6	2414725	2414730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_004557	TAAA	2	8	2414741	2414748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_004557	A	7	7	2414746	2414752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11092	NC_004557	T	7	7	2414783	2414789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_004557	CAC	2	6	2414799	2414804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_004557	AT	3	6	2414868	2414873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11098	NC_004557	AT	3	6	2415049	2415054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_004557	CAATTT	2	12	2415058	2415069	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11100	NC_004557	TA	3	6	2415073	2415078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_004557	TTTA	2	8	2415114	2415121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_004557	ATC	2	6	2415131	2415136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11104	NC_004557	AC	3	6	2416408	2416413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11105	NC_004557	TTC	2	6	2416450	2416455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_004557	AT	3	6	2416467	2416472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_004557	TTC	2	6	2416498	2416503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11108	NC_004557	TCCT	2	8	2416508	2416515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_004557	TGG	2	6	2416527	2416532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_004557	ATA	2	6	2416533	2416538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_004557	CAC	2	6	2416582	2416587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_004557	AATT	2	8	2416641	2416648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_004557	TTAATT	2	12	2416662	2416673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_004557	T	6	6	2416672	2416677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_004557	TTTTA	2	10	2416685	2416694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_004557	ATT	2	6	2416701	2416706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_004557	AT	3	6	2418387	2418392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_004557	TA	3	6	2418393	2418398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_004557	TCT	2	6	2418403	2418408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11121	NC_004557	CCT	2	6	2418462	2418467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11122	NC_004557	TTC	2	6	2418469	2418474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_004557	TTC	2	6	2418479	2418484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11125	NC_004557	TAAA	2	8	2418659	2418666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_004557	ATT	2	6	2418687	2418692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11128	NC_004557	GTT	2	6	2418719	2418724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_004557	TAAA	2	8	2418728	2418735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_004557	T	6	6	2418744	2418749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11399	NC_004557	ATG	2	6	2500420	2500425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11400	NC_004557	TTA	2	6	2500478	2500483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11401	NC_004557	ATG	2	6	2500489	2500494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11402	NC_004557	TAT	2	6	2500573	2500578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11403	NC_004557	T	9	9	2500583	2500591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11404	NC_004557	TTTA	2	8	2500606	2500613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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