MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003361	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003361	TTC	2	6	1054	1059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_003361	GAA	2	6	1060	1065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003361	TAT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003361	ATT	3	9	2974	2982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003361	TTGTG	2	10	2983	2992	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003361	T	6	6	3002	3007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003361	CAA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_003361	TTG	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003361	AATC	2	8	5318	5325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003361	TGT	2	6	5328	5333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003361	TTC	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_003361	TGTTTT	2	12	6637	6648	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003361	TTTTA	2	10	6674	6683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003361	AT	3	6	6734	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003361	CAA	2	6	6777	6782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_003361	TG	3	6	6795	6800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003361	A	7	7	6805	6811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003361	AAT	2	6	16765	16770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003361	AGT	2	6	16831	16836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003361	GAA	2	6	16854	16859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003361	GAA	2	6	16908	16913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003361	AAT	2	6	16929	16934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003361	TAAA	2	8	16945	16952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003361	TTC	2	6	17603	17608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_003361	AG	3	6	17613	17618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003361	TTC	2	6	17650	17655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003361	GTT	2	6	20241	20246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003361	TCC	2	6	20247	20252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_003361	TCT	2	6	20306	20311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_003361	AAT	2	6	20319	20324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003361	TAA	2	6	21623	21628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003361	T	9	9	21671	21679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003361	T	8	8	21711	21718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003361	ATT	2	6	21719	21724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003361	A	8	8	23664	23671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003361	TGGA	2	8	23770	23777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003361	ATT	2	6	26437	26442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003361	T	6	6	26449	26454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003361	ATTTT	2	10	26455	26464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003361	T	7	7	26479	26485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003361	T	7	7	26508	26514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003361	TGT	2	6	26527	26532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003361	GTTTT	2	10	26535	26544	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003361	TATT	2	8	26555	26562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003361	ATTA	2	8	26567	26574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003361	TTA	2	6	26598	26603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003361	TTC	2	6	31450	31455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_003361	T	6	6	31569	31574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003361	TCC	2	6	31653	31658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_003361	CTT	3	9	31777	31785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_003361	AT	3	6	31816	31821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003361	A	7	7	32157	32163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003361	TTAAT	2	10	32175	32184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003361	AAT	2	6	32202	32207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003361	TTAA	2	8	32213	32220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003361	TTGT	2	8	32255	32262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003361	TAA	2	6	32263	32268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003361	TAT	2	6	32278	32283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003361	TAT	2	6	32294	32299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003361	TGT	2	6	32327	32332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003361	TTG	2	6	32390	32395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003361	GTCC	2	8	32496	32503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003361	CTTC	2	8	32572	32579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003361	GTT	2	6	32692	32697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003361	TTA	2	6	32749	32754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003361	AAT	2	6	32786	32791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003361	AAC	2	6	32861	32866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003361	TTTA	2	8	32915	32922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003361	TCTTCA	2	12	32934	32945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_003361	AGGA	2	8	32972	32979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003361	TTC	2	6	32990	32995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_003361	TCT	2	6	33000	33005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_003361	TTTG	2	8	33051	33058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003361	TGT	2	6	33096	33101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003361	ATCG	2	8	33154	33161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_003361	AG	3	6	33189	33194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003361	TTA	2	6	33224	33229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003361	TAA	2	6	33286	33291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003361	TAG	2	6	33322	33327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003361	AGT	2	6	33344	33349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003361	T	6	6	33366	33371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003361	T	6	6	33412	33417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003361	ATAAA	2	10	34118	34127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003361	T	6	6	34147	34152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003361	TTC	2	6	37422	37427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_003361	GTG	2	6	37466	37471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003361	AAC	2	6	37480	37485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_003361	CAA	2	6	37522	37527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_003361	TGTT	2	8	37534	37541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003361	AGA	2	6	37574	37579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003361	TCAA	2	8	37607	37614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003361	T	6	6	37665	37670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003361	TGTTTT	2	12	37690	37701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003361	GTT	3	9	37707	37715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003361	GAT	2	6	37773	37778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003361	CTT	2	6	37808	37813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_003361	A	6	6	37842	37847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003361	GAA	2	6	37944	37949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003361	TCA	2	6	38992	38997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003361	TTTTTA	2	12	39205	39216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003361	GAA	2	6	39292	39297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003361	GAA	2	6	42267	42272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003361	TAAA	2	8	43297	43304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003361	AT	3	6	43305	43310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003361	GTT	2	6	43314	43319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003361	TA	3	6	52083	52088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003361	A	6	6	52090	52095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003361	GAT	2	6	52099	52104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003361	TGT	2	6	52134	52139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003361	TCG	2	6	52166	52171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_003361	TTG	2	6	52181	52186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003361	T	6	6	52197	52202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003361	TCTTT	2	10	52224	52233	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_003361	T	6	6	52231	52236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003361	GTC	2	6	52283	52288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003361	A	6	6	52319	52324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003361	TGA	2	6	52358	52363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003361	CTT	2	6	52364	52369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_003361	ATC	2	6	52401	52406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003361	ATA	2	6	52409	52414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003361	TTC	2	6	52458	52463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_003361	GAAG	2	8	52553	52560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003361	TGT	2	6	52678	52683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003361	A	6	6	54334	54339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003361	T	7	7	54359	54365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003361	AAT	2	6	54388	54393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003361	CT	3	6	54620	54625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_003361	AAAG	2	8	54645	54652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003361	AG	3	6	54651	54656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003361	TTAAT	2	10	57822	57831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003361	AGA	2	6	57889	57894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003361	CTT	2	6	57898	57903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_003361	AGAAA	2	10	57919	57928	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003361	TAAA	2	8	57951	57958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003361	A	6	6	57956	57961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003361	TCTTT	2	10	59225	59234	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_003361	GGC	2	6	59264	59269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_003361	GAG	2	6	59323	59328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003361	TTA	2	6	59399	59404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003361	A	6	6	59421	59426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003361	TAA	2	6	59473	59478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003361	AAATA	2	10	59609	59618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003361	ATT	2	6	59626	59631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003361	TAA	2	6	59632	59637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003361	TATTT	2	10	59670	59679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003361	ATT	2	6	59721	59726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003361	TG	3	6	63123	63128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003361	ATT	2	6	64173	64178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003361	T	7	7	64190	64196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003361	A	6	6	64224	64229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003361	A	6	6	64257	64262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003361	T	13	13	64303	64315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003361	GAAGCC	2	12	64378	64389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_003361	CACTT	2	10	70952	70961	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_003361	TA	3	6	77214	77219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_003361	TTC	2	6	77489	77494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_003361	TAAA	2	8	77533	77540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003361	TTTTAA	2	12	77559	77570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_003361	ATG	2	6	129760	129765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_003361	TCT	2	6	129975	129980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_003361	CT	3	6	130193	130198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_003361	TAA	2	6	130223	130228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_003361	GAG	2	6	130316	130321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_003361	CT	3	6	130325	130330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
286	NC_003361	GAAA	2	8	130942	130949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
287	NC_003361	TTACA	2	10	130993	131002	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_003361	CAA	2	6	131057	131062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_003361	TAT	2	6	131064	131069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_003361	ATC	2	6	131108	131113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_003361	T	7	7	132828	132834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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